35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0294 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0294  50S ribosomal protein L29  100 
 
 		 61 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00124097  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1025  50S ribosomal protein L29  57.38 
 
 		 61 aa  70.9  0.000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00341949  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0042  50S ribosomal protein L29  57.38 
 
 		 61 aa  67  0.00000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.118761  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1769  50S ribosomal protein L29  52.46 
 
 		 64 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000104669  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0067  50S ribosomal protein L29  55.74 
 
 		 61 aa  63.9  0.0000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00273848  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2073  50S ribosomal protein L29  55.93 
 
 		 61 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0466832  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1696  50S ribosomal protein L29  55.93 
 
 		 61 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00133107  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1867  50S ribosomal protein L29  55.93 
 
 		 61 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1960  ribosomal protein L29  52.54 
 
 		 62 aa  60.5  0.000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.430573  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0273  ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 66 aa  47  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000123805  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf434  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0218  ribosomal protein L29  37.7 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1277  ribosomal protein L29  36.21 
 
 		 63 aa  44.3  0.0006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1386  50S ribosomal protein L29  43.86 
 
 		 66 aa  44.3  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000247048  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0466  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1300  50S ribosomal protein L29  43.86 
 
 		 66 aa  44.3  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000050767  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3897  50S ribosomal protein L29P  41.51 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0634  50S ribosomal protein L29  41.38 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169135  hitchhiker  0.00000000334263 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4500  50S ribosomal protein L29  42.11 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00015602  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2942  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000229225  hitchhiker  0.00000342543 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3289  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000215489  hitchhiker  0.00000182798 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3011  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000636591  normal  0.0461975 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5132  ribosomal protein L29  43.4 
 
 		 83 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76527 
 
 
-
 
NC_009972  Maur_5050  50S ribosomal protein L29  33.33 
 
 		 67 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0326432  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2638  50S ribosomal protein L29P  42.59 
 
 		 85 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137123  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1715  50S ribosomal protein L29  35.85 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0668  ribosomal protein L29  41.82 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0746889  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0434  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157908  hitchhiker  0.0000885685 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  37.29 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2849  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.851445  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3787  50S ribosomal protein L29  38.6 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0936197  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0092  50S ribosomal protein L29  54.1 
 
 		 61 aa  40.4  0.008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.786092  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09920  LSU ribosomal protein L29P  38.98 
 
 		 64 aa  40.4  0.008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  hitchhiker  0.0000015632 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3309  50S ribosomal protein L29  37.93 
 
 		 64 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000526811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3171  50S ribosomal protein L29  37.93 
 
 		 64 aa  40  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000183391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>