More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0280 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0280  ribonuclease HII  100 
 
 		 188 aa  385  1e-106  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.259622  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0430  ribonuclease HII  58.47 
 
 		 185 aa  213  1.9999999999999998e-54  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1971  Ribonuclease H  54.35 
 
 		 182 aa  204  6e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0578493  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0010  ribonuclease HII  56.57 
 
 		 191 aa  194  7e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000542544  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0009  ribonuclease HII  58.29 
 
 		 191 aa  188  2.9999999999999997e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0036  ribonuclease HII  58.29 
 
 		 191 aa  188  2.9999999999999997e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00659063  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0083  ribonuclease HII  52.57 
 
 		 183 aa  183  1.0000000000000001e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0342  ribonuclease HII  50 
 
 		 184 aa  181  5.0000000000000004e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0247134  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1765  ribonuclease HII  49.71 
 
 		 183 aa  174  8e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0654906  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0016  ribonuclease HII  44.75 
 
 		 189 aa  161  4.0000000000000004e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  41.67 
 
 		 214 aa  140  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  44.75 
 
 		 206 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  40.56 
 
 		 210 aa  139  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  40.56 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  40.56 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  40.56 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  38.89 
 
 		 217 aa  135  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  38.89 
 
 		 217 aa  135  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  42.62 
 
 		 206 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  43.65 
 
 		 193 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  39.01 
 
 		 236 aa  132  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  40.53 
 
 		 214 aa  132  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  40.76 
 
 		 202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  40.76 
 
 		 202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  44.89 
 
 		 256 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  43.78 
 
 		 197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  43.02 
 
 		 208 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  42.54 
 
 		 257 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  42.29 
 
 		 277 aa  129  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  41.9 
 
 		 203 aa  129  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07010  ribonuclease HII  37.63 
 
 		 262 aa  128  4.0000000000000003e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000706526  normal  0.43338 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  42.46 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  41.85 
 
 		 212 aa  128  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  40.22 
 
 		 198 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  40.22 
 
 		 198 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  37.99 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  40.22 
 
 		 198 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  42.61 
 
 		 257 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  37.43 
 
 		 201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  41.57 
 
 		 235 aa  125  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  39.01 
 
 		 232 aa  125  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1286  ribonuclease H  45.86 
 
 		 199 aa  125  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  39.27 
 
 		 211 aa  125  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  40.76 
 
 		 199 aa  125  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1292  ribonuclease HII  38.46 
 
 		 232 aa  125  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.060784  normal  0.581124 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  40.22 
 
 		 198 aa  124  9e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  40.22 
 
 		 198 aa  124  9e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  40.22 
 
 		 198 aa  124  9e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  40.66 
 
 		 207 aa  124  9e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  39.44 
 
 		 249 aa  124  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  40.22 
 
 		 198 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  39.89 
 
 		 197 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  41.3 
 
 		 211 aa  123  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  40.22 
 
 		 198 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  39.66 
 
 		 198 aa  122  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  39.66 
 
 		 198 aa  123  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  37.99 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  38.33 
 
 		 198 aa  122  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  40.78 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  39.66 
 
 		 198 aa  122  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  40.22 
 
 		 198 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  40.22 
 
 		 198 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  40.22 
 
 		 198 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  44.63 
 
 		 255 aa  122  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  38.55 
 
 		 207 aa  122  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  38.33 
 
 		 198 aa  122  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  37.7 
 
 		 214 aa  122  4e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  37.57 
 
 		 198 aa  122  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  38.69 
 
 		 245 aa  122  4e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  39.66 
 
 		 217 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  41.76 
 
 		 199 aa  122  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1362  ribonuclease HII  46.03 
 
 		 209 aa  121  5e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  36.13 
 
 		 206 aa  121  6e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  39.66 
 
 		 207 aa  121  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  39.66 
 
 		 207 aa  121  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2422  ribonuclease HII  38.67 
 
 		 214 aa  120  9e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000428257  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  40.22 
 
 		 207 aa  120  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1324  ribonuclease HII  40.34 
 
 		 191 aa  120  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  38.55 
 
 		 218 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  41.3 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2568  ribonuclease HII  38.12 
 
 		 214 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.446358  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2694  ribonuclease HII  43.39 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.529016  hitchhiker  0.00296162 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  40.78 
 
 		 209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  40.78 
 
 		 209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  44.62 
 
 		 242 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  40.68 
 
 		 198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01386  ribonuclease HII  41.76 
 
 		 190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00865993  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1284  ribonuclease HII  42.19 
 
 		 212 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.103887  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1547  ribonuclease HII  41.12 
 
 		 198 aa  119  3e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.040973  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2456  ribonuclease HII  40.11 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.633452  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1834  Ribonuclease H  38.67 
 
 		 228 aa  119  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1327  ribonuclease HII  39.33 
 
 		 191 aa  119  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  39.78 
 
 		 213 aa  119  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  38.55 
 
 		 240 aa  119  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1449  ribonuclease HII  36.67 
 
 		 226 aa  119  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000143368  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  37.91 
 
 		 229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2478  ribonuclease HII  38.67 
 
 		 214 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0544675  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2041  ribonuclease HII  38.42 
 
 		 214 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000010241  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2041  ribonuclease HII  38.67 
 
 		 214 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00230414  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  41.57 
 
 		 204 aa  118  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>