41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0265 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0265  hypothetical protein  100 
 
 
493 aa  1013  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  2.73485e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2207  metalloid reductase RarA  31.62 
 
 
458 aa  91.3  3e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1540  outer membrane porin  25.64 
 
 
456 aa  87.4  5e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000339272  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0474  outer membrane porin  28.87 
 
 
407 aa  82.4  2e-14  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  4.58474e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0019  outer membrane porin  33.33 
 
 
402 aa  78.6  3e-13  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00360128  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0715  outer membrane porin  24.24 
 
 
451 aa  75.9  2e-12  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0142723  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1155  outer membrane porin  24.69 
 
 
413 aa  74.3  4e-12  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.864338  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0469  outer membrane porin  22.98 
 
 
432 aa  74.3  4e-12  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  5.34788e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1463  hypothetical protein  23.9 
 
 
435 aa  71.6  3e-11  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.62928 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4147  outer membrane porin  23.62 
 
 
407 aa  68.6  2e-10  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.17719 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3627  outer membrane porin  29.05 
 
 
435 aa  67.4  6e-10  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3385  outer membrane porin  23.97 
 
 
412 aa  67.4  6e-10  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.228993  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2788  outer membrane porin  24.24 
 
 
413 aa  65.5  2e-09  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.149615 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1456  hypothetical protein  23.7 
 
 
450 aa  63.2  1e-08  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0734  outer membrane porin  23.95 
 
 
384 aa  62  3e-08  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.536638  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1917  hypothetical protein  26.02 
 
 
423 aa  60.1  8e-08  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.50266  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3175  outer membrane porin  23.34 
 
 
420 aa  58.9  2e-07  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.442937  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0366  outer membrane porin  27.93 
 
 
403 aa  58.5  3e-07  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  5.02534e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1991  hypothetical protein  27.89 
 
 
428 aa  54.3  5e-06  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0954759  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1660  outer membrane porin  27.89 
 
 
428 aa  54.3  5e-06  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.133249  normal  0.448938 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0255  outer membrane porin  23.99 
 
 
406 aa  53.9  6e-06  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4293  outer membrane porin  23.99 
 
 
398 aa  52.4  2e-05  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0195017  normal  0.981008 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0307  hypothetical protein  27.4 
 
 
280 aa  51.2  5e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  2.84732e-05  decreased coverage  6.57786e-06 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0137  hypothetical protein  27.4 
 
 
447 aa  50.4  7e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0760948  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4332  outer membrane porin  23.13 
 
 
439 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.994922 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64720  putative porin  30.59 
 
 
417 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.916486  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3390  porin, putative  22.99 
 
 
426 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.808043  normal  0.355784 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2087  outer membrane porin  22.9 
 
 
452 aa  47.8  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0752  outer membrane porin for cationic amino acids and peptides  37.88 
 
 
499 aa  47.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.616901  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5621  putative porin  30.59 
 
 
417 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2005  outer membrane porin  29.59 
 
 
447 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1367  outer membrane porin  34.92 
 
 
468 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0114  hypothetical protein  25.17 
 
 
483 aa  45.8  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.853586  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2563  outer membrane porin  23.7 
 
 
427 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0910723  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25950  OprE-like outer membrane porin  25 
 
 
443 aa  45.1  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.249173  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49580  OprE-like outer membrane porin  23.08 
 
 
441 aa  44.3  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.607029  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2058  outer membrane porin  20.96 
 
 
417 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536728  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  21.18 
 
 
422 aa  44.3  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4433  outer membrane porin  36.36 
 
 
529 aa  44.3  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.326641 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31180  OprE-like outer membrane porin  23.08 
 
 
439 aa  43.9  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5281  outer membrane porin  24.8 
 
 
413 aa  43.5  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.746207 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>