27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0256 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0256  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  313  5e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0557189  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0504  hypothetical protein  45.45 
 
 
154 aa  143  8.000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1472  hypothetical protein  27.21 
 
 
151 aa  63.2  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00198336  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0095  Domain of unknown function DUF1791  29.41 
 
 
176 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.921438  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3212  hypothetical protein  29.17 
 
 
176 aa  57  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1943  hypothetical protein  27.03 
 
 
168 aa  52.8  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.862348  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1760  Domain of unknown function DUF1791  28.35 
 
 
166 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289316  normal  0.172768 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0509  hypothetical protein  30.88 
 
 
165 aa  50.8  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0289752  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1181  Methyltransferase type 11  27.21 
 
 
397 aa  50.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.694662  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2005  hypothetical protein  25.17 
 
 
161 aa  48.1  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00242078  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1860  hypothetical protein  25.5 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00347774  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2431  putative signal peptide protein  33.33 
 
 
137 aa  47.4  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0779  hypothetical protein  30.3 
 
 
115 aa  44.3  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.790907  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1221  hypothetical protein  28.99 
 
 
127 aa  44.3  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4145  protein of unknown function DUF1791  29.84 
 
 
153 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0874  hypothetical protein  29.17 
 
 
171 aa  44.3  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.100983  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4871  hypothetical protein  29.71 
 
 
151 aa  43.9  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1476  hypothetical protein  27 
 
 
176 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.332272  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1843  hypothetical protein  28.85 
 
 
169 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1310  hypothetical protein  27.27 
 
 
183 aa  42  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0111987  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1031  hypothetical protein  28.45 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.454179 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0468  hypothetical protein  31.48 
 
 
112 aa  40.8  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0547  hypothetical protein  29.63 
 
 
169 aa  41.2  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.733611  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0808  hypothetical protein  28.3 
 
 
145 aa  40.8  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.893436  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0536  hypothetical protein  25.58 
 
 
123 aa  40.8  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0093  hypothetical protein  37.78 
 
 
116 aa  40.4  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0267  hypothetical protein  35 
 
 
144 aa  40  0.01  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000206306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>