More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0247 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0247  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 226 aa  456  1e-127  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0377  DNA-binding response regulator  32.74 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.306284  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1362  DNA-binding response regulator  29.6 
 
 		 225 aa  111  7.000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0685  response regulator receiver  29.68 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1664  DNA-binding response regulator  29.96 
 
 		 226 aa  99.8  3e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.690265  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0851  two component transcriptional regulator  27.11 
 
 		 230 aa  99  5e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1483  DNA-binding response regulator  29.52 
 
 		 226 aa  99  5e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1837  DNA-binding response regulator  29.52 
 
 		 226 aa  98.2  8e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.591446  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0363  response regulator receiver  30.29 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1869  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  26.7 
 
 		 229 aa  96.3  3e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0722  response regulator receiver domain-containing protein  25 
 
 		 227 aa  94.4  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0554017  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0448  response regulator receiver  27.88 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000838603  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1547  cytochrome c biogenesis protein  28.17 
 
 		 220 aa  93.2  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0873939  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1991  two component transcriptional regulator  32.89 
 
 		 229 aa  91.7  7e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.656084  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1920  response regulator receiver  31.61 
 
 		 226 aa  91.7  8e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0749  two component transcriptional regulator  25.79 
 
 		 230 aa  88.6  8e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0705  response regulator receiver  25.34 
 
 		 231 aa  86.3  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00025775  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0827  response regulator receiver domain-containing protein  35.83 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.914575  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2081  response regulator receiver  36.97 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4239  two component transcriptional regulator  22.02 
 
 		 220 aa  81.3  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0202421  normal  0.361244 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3550  two component transcriptional regulator  22.83 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2139  response regulator receiver  22.42 
 
 		 236 aa  80.1  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3792  two component transcriptional regulator  22.83 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.358087  normal  0.612342 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4225  winged helix family two component transcriptional regulator  22.83 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03384  response regulator  24.41 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000742618  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3285  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.81 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00225391  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3680  histidine kinase A domain-containing protein  22.79 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.894604 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0140  two component transcriptional regulator  29.07 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.794843  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1880  two component transcriptional regulator  26.4 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3491  two component transcriptional regulator  23.5 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0557217 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6029  two component transcriptional regulator  21.63 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.167629 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3935  two component transcriptional regulator  25.69 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.646675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1242  two component transcriptional regulator  27.68 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.546498  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0170  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.88 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2599  two component transcriptional regulator, winged helix family  22.22 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1312  transcriptional regulatory protein  24.65 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0158381  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  26.44 
 
 		 223 aa  72  0.000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2389  two component transcriptional regulator, winged helix family  21.78 
 
 		 240 aa  72  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0687652  decreased coverage  0.0000973314 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1372  transcriptional regulatory protein  24.65 
 
 		 223 aa  72  0.000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000461157  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.28 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08510  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  22.22 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103906  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4970  two component transcriptional regulator  29.24 
 
 		 228 aa  71.6  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375881  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3075  two component transcriptional regulator  21.66 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0867071  normal  0.535547 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3430  transcriptional regulator  21.66 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1399  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.15 
 
 		 476 aa  71.2  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2791  two component transcriptional regulator  23.29 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0009  two component transcriptional regulator  26.2 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0625  two component transcriptional regulator  28.24 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32580  two-component response regulator  24.89 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.16072 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2759  two-component response regulator  24.89 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.358049  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1143  two component transcriptional regulator  25.23 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.606905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0120  response regulator receiver  26.22 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3437  two component transcriptional regulator  25.23 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  23.81 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1128  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  22.22 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.40399  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0720  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.11 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1228  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  24.32 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2105  two component transcriptional regulator  28.33 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4900  two component transcriptional regulator, winged helix family  20.81 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0357  two component transcriptional regulator  23.15 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2530  two component transcriptional regulator  25.23 
 
 		 242 aa  68.6  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.279936  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1874  two component transcriptional regulator  26.4 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1272  response regulator receiver  29.22 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1155  two component transcriptional regulator, winged helix family  20.89 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.560017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1618  two component transcriptional regulator  24.6 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  24.86 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0905  two component transcriptional regulator  24.24 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1332  response regulator receiver  28.14 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1378  response regulator receiver domain-containing protein  28.79 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.321431  normal  0.0110306 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0717  two component transcriptional regulator  24.17 
 
 		 242 aa  67  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4191  two component transcriptional regulator  26.69 
 
 		 244 aa  67  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0076  two component transcriptional regulator  23.15 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.225452 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1638  two component transcriptional regulator  22.83 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0286  two component transcriptional regulator  23.72 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11471  two-component response regulator, phosphate  24.19 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0202491 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4249  two component transcriptional regulator, winged helix family  24.32 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.316157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2154  two component transcriptional regulator  27.85 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2004  response regulator receiver  26.61 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.230205  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0239  two component transcriptional regulator  24.31 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2752  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  25.41 
 
 		 799 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0242  two component transcriptional regulator  24.31 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0257  response regulator receiver  23.83 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0239  two component transcriptional regulator  24.31 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0673  two component transcriptional regulator, winged helix family  27 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.996485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1535  two component transcriptional regulator  19.32 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1871  two component transcriptional regulator, winged helix family  21.33 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.105791  normal  0.266081 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0892  response regulator receiver  21.33 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2485  two component transcriptional regulator, winged helix family  22.91 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0411  two component transcriptional regulator  23.68 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3124  transcriptional regulatory protein QseB  21.56 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0357  two component transcriptional regulator  24.31 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  25.13 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00241  VirG  25.24 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3589  two component transcriptional regulator  20.98 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0386  two component transcriptional regulator  24.54 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0245  two component transcriptional regulator, winged helix family  24.31 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117592 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4781  DNA-binding response regulator  26.41 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2146  two component transcriptional regulator, winged helix family  20.63 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0142  DNA-binding response regulator  28 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2735  two component transcriptional regulator  21.81 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>