More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0209 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
658 aa  1307    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.603066  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0377  Nitrate and nitrite sensing domain protein  41.86 
 
 
661 aa  485  1e-135  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000413313  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.98 
 
 
720 aa  301  3e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0989  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.09 
 
 
720 aa  301  4e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1937  methyl-accepting chemotaxis protein  33.56 
 
 
662 aa  278  2e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0215017  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1929  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.82 
 
 
662 aa  274  5.000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.23754  normal  0.0188929 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2325  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.99 
 
 
664 aa  259  1e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.100516  hitchhiker  0.00420774 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1352  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.82 
 
 
668 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2282  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.56 
 
 
664 aa  253  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.330304  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1713  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.85 
 
 
666 aa  253  1e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000425798  normal  0.0665929 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0763  methyl-accepting chemotaxis protein  32.56 
 
 
661 aa  238  4e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2242  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.2 
 
 
664 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0988  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.66 
 
 
652 aa  228  2e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1957  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.28 
 
 
664 aa  224  6e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.257458  normal  0.211978 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2369  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.28 
 
 
664 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0315396  normal  0.0961625 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1790  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.27 
 
 
664 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.119789  normal  0.182995 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1950  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.08 
 
 
664 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0377955  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1813  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.8 
 
 
664 aa  220  6e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.280908  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1760  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.91 
 
 
664 aa  219  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.106787  normal  0.536367 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0413  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.1 
 
 
653 aa  219  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1685  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.33 
 
 
664 aa  219  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0832618  normal  0.158688 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.13 
 
 
661 aa  214  5.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.51 
 
 
649 aa  209  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2657  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.07 
 
 
646 aa  193  8e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.653915  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1251  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.49 
 
 
646 aa  193  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.457093  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2284  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.78 
 
 
653 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297466 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2315  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  28.36 
 
 
653 aa  169  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.967368  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3099  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.35 
 
 
672 aa  169  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.500846  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1924  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.5 
 
 
531 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.666083  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2511  methyl-accepting chemotaxis protein  27.74 
 
 
653 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295069  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1394  putative 6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase (ptps; ptp synthase)  29.48 
 
 
656 aa  164  6e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1434  chemotaxis sensory transducer  33.52 
 
 
530 aa  162  2e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1039  protease htpx  32.78 
 
 
656 aa  154  4e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0758551  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1432  chemotaxis sensory transducer  35.26 
 
 
546 aa  154  4e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0840  cache domain-contain protein  40.51 
 
 
566 aa  154  5e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.287851  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0920  nitrate and nitrite sensing methyl-accepting chemotaxis protein  27.36 
 
 
662 aa  154  7e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0113  chemotaxis sensory transducer  34.05 
 
 
563 aa  152  2e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0112  chemotaxis sensory transducer  35.57 
 
 
563 aa  151  3e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1931  chemotaxis sensory transducer  33.05 
 
 
621 aa  150  7e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0262  chemotaxis sensory transducer  33.24 
 
 
650 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0819  chemotaxis sensory transducer  33.9 
 
 
627 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.113637  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1930  chemotaxis sensory transducer  33.71 
 
 
625 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2141  chemotaxis sensory transducer  34.14 
 
 
708 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1331  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.98 
 
 
563 aa  147  9e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158014  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1205  chemotaxis sensory transducer  32.11 
 
 
713 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1932  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 
682 aa  142  3e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0982  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.73 
 
 
663 aa  140  8.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.293812  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1860  chemotaxis sensory transducer  29.89 
 
 
533 aa  139  2e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00521087  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1826  chemotaxis sensory transducer  32 
 
 
650 aa  139  2e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0631  chemotaxis sensory transducer  33.99 
 
 
656 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00821954  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0869  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  49.08 
 
 
649 aa  137  4e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1073  chemotaxis sensory transducer  33.69 
 
 
633 aa  138  4e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00919731  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3269  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.23 
 
 
605 aa  137  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000515244  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.77 
 
 
564 aa  137  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1957  methyl-accepting chemotaxis protein  52.78 
 
 
654 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0397  methyl-accepting chemotaxis protein  47.8 
 
 
655 aa  135  3e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1409  methyl-accepting chemotaxis protein  47.8 
 
 
655 aa  135  3e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1856  acyl-CoA hydrolase  48.34 
 
 
654 aa  133  7.999999999999999e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0395  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase (UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine synthetase)  53.79 
 
 
663 aa  133  1.0000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1471  DNA processing chain A  47.77 
 
 
651 aa  132  2.0000000000000002e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1698  methyl-accepting chemotaxis protein  53.03 
 
 
653 aa  132  2.0000000000000002e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130314  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.15 
 
 
557 aa  131  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4266  chemotaxis sensory transducer  35.77 
 
 
546 aa  131  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.261421  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0847  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 
620 aa  131  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.566037  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1114  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.14 
 
 
700 aa  130  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.655641 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2035  putative transducer  42.5 
 
 
626 aa  130  9.000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0818  chemotaxis sensory transducer  28.49 
 
 
590 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1178  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.63 
 
 
530 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1041  methyl-accepting chemotaxis protein  53.03 
 
 
731 aa  128  3e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.32701  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1854  chemotaxis sensory transducer  31.85 
 
 
536 aa  127  5e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1307  methyl-accepting chemotaxis protein  55.56 
 
 
596 aa  127  5e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000917497  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0982  domain of unknown function DUF1745  43.15 
 
 
666 aa  127  6e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.505903  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0185  methyl-accepting chemotaxis protein  55.56 
 
 
544 aa  127  6e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000579859  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0180  methyl-accepting chemotaxis protein  52.27 
 
 
659 aa  127  8.000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0312  methyl-accepting chemotaxis protein  52.27 
 
 
662 aa  127  9e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0314  methyl-accepting chemotaxis protein  52.27 
 
 
659 aa  127  9e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.55 
 
 
637 aa  127  9e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0140  methyl-accepting chemotaxis protein  52.27 
 
 
540 aa  126  1e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1679  methyl-accepting chemotaxis protein  52.27 
 
 
700 aa  126  1e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1735  methyl-accepting chemotaxis protein  52.27 
 
 
651 aa  126  1e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0889  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.94 
 
 
540 aa  126  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3759  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.64 
 
 
554 aa  126  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0990388  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1498  methyl-accepting chemotaxis protein  52.27 
 
 
700 aa  126  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.756421  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1915  methyl-accepting chemotaxis protein  52.27 
 
 
653 aa  126  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.633585  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3725  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 
620 aa  126  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.403145  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0289  methyl-accepting chemotaxis protein  52.27 
 
 
665 aa  126  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1720  methyl-accepting chemotaxis protein  52.27 
 
 
664 aa  126  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0562  putative methyl-accepting chemotaxis protein  30.42 
 
 
530 aa  126  1e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.191806  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1227  methyl-accepting chemotaxis protein  55.56 
 
 
553 aa  126  1e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1858  methyl-accepting chemotaxis protein  52.27 
 
 
700 aa  126  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1776  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  31.8 
 
 
543 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.68 
 
 
554 aa  125  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1549  methyl-accepting chemotaxis protein  52.27 
 
 
236 aa  125  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00107467  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.08 
 
 
538 aa  125  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0340  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.67 
 
 
541 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.582352  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0190  methyl-accepting chemotaxis protein  54.7 
 
 
657 aa  124  4e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.145639  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1305  methyl-accepting chemotaxis protein  54.7 
 
 
652 aa  124  4e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.049405  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1645  methyl-accepting chemotaxis protein  56.41 
 
 
545 aa  124  4e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0567442  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.67 
 
 
541 aa  124  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  decreased coverage  0.0000342214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.67 
 
 
541 aa  124  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.722367  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>