29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0185 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0185  hypothetical protein  100 
 
 
350 aa  715    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2214  protein of unknown function DUF354  62.32 
 
 
354 aa  456  1e-127  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1618  hypothetical protein  56.25 
 
 
356 aa  400  9.999999999999999e-111  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.783063  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1596  protein of unknown function DUF354  54.39 
 
 
358 aa  369  1e-101  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0093  hypothetical protein  30.42 
 
 
350 aa  151  2e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0978162 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0867  hypothetical protein  29.24 
 
 
353 aa  98.6  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.530638  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2863  hypothetical protein  27.11 
 
 
377 aa  90.9  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0844  hypothetical protein  25.3 
 
 
338 aa  88.2  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.504464  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0372  hypothetical protein  24.59 
 
 
333 aa  87.8  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.153205 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1667  hypothetical protein  25 
 
 
337 aa  87.4  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.251893  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0246  hypothetical protein  25.3 
 
 
337 aa  87.4  4e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1392  hypothetical protein  25.08 
 
 
860 aa  87.4  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0961  hypothetical protein  24.55 
 
 
337 aa  86.7  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1550  hypothetical protein  27.55 
 
 
337 aa  87  5e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.590415  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0255  hypothetical protein  25.94 
 
 
340 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1339  hypothetical protein  25.5 
 
 
335 aa  84.7  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00496321  normal  0.353078 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1755  hypothetical protein  23.05 
 
 
330 aa  84.3  0.000000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.387816  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1136  hypothetical protein  23.1 
 
 
329 aa  80.5  0.00000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.345385 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1090  hypothetical protein  25.4 
 
 
350 aa  78.6  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.399019  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1073  protein of unknown function DUF354  22.75 
 
 
349 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.266744  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3188  protein of unknown function DUF354  23.95 
 
 
349 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0085  protein of unknown function DUF354  23.65 
 
 
342 aa  73.2  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0489  protein of unknown function DUF354  26.13 
 
 
355 aa  72  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2590  hypothetical protein  22.19 
 
 
341 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1064  protein of unknown function DUF354  23.91 
 
 
353 aa  63.2  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2021  hypothetical protein  23.13 
 
 
347 aa  57.4  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2023  protein of unknown function DUF354  22.67 
 
 
379 aa  53.5  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0244531  normal  0.923484 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0053  hypothetical protein  20.98 
 
 
363 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1117  hypothetical protein  21.95 
 
 
357 aa  44.3  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>