132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0170 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0170  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  357  4e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0572  hypothetical protein  47.4 
 
 
174 aa  152  2.9999999999999998e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1550  phosphodiesterase  45.77 
 
 
180 aa  142  2e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  31.06 
 
 
171 aa  79.7  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  32.3 
 
 
171 aa  76.3  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  32.3 
 
 
171 aa  76.3  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  32.3 
 
 
171 aa  75.1  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0185  phosphodiesterase  29.61 
 
 
164 aa  74.7  0.0000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0908  phosphodiesterase  31.21 
 
 
175 aa  71.6  0.000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.808433  normal  0.308867 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0060  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.56 
 
 
178 aa  71.2  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.876718  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  31.9 
 
 
174 aa  70.9  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2220  phosphodiesterase  32.48 
 
 
168 aa  70.5  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0660952  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0694  phosphodiesterase  31.06 
 
 
158 aa  70.5  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0718  phosphodiesterase  31.06 
 
 
158 aa  70.5  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.205538  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0437  phosphodiesterase, MJ0936 family  30 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0026  phosphodiesterase  28.95 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.239005  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  32.35 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0763  phosphodiesterase  29.3 
 
 
168 aa  65.1  0.0000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.420804  normal  0.111199 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0811  phosphodiesterase  35.25 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1231  phosphodiesterase  27.61 
 
 
173 aa  64.3  0.0000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.234159  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1431  phosphodiesterase  28.22 
 
 
165 aa  62.8  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7192  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.03 
 
 
167 aa  61.6  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0201  phosphodiesterase  27.04 
 
 
168 aa  61.6  0.000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.605154  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1588  phosphodiesterase  26.7 
 
 
176 aa  61.2  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.398386  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2610  phosphoesterase, putative  33.58 
 
 
152 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330277  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.77 
 
 
160 aa  58.5  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2256  phosphodiesterase  32.05 
 
 
153 aa  57  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1651  hypothetical protein  28.1 
 
 
183 aa  56.6  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000844745  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  27.81 
 
 
168 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0138  hypothetical protein  24.22 
 
 
166 aa  55.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1000  hypothetical protein  32.85 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0102337 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0024  phosphodiesterase  27.78 
 
 
163 aa  55.8  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  36.67 
 
 
162 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4978  hypothetical protein  28.57 
 
 
172 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5066  phosphodiesterase  28.57 
 
 
172 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5359  phosphodiesterase  28.57 
 
 
172 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  28.31 
 
 
181 aa  55.1  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  29.41 
 
 
148 aa  54.7  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1432  phosphodiesterase  27.22 
 
 
166 aa  54.7  0.0000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0917348 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2127  phosphodiesterase  30.37 
 
 
152 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.214713 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2058  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.15 
 
 
168 aa  54.3  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000252538 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2556  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.52 
 
 
163 aa  53.5  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.438723  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2350  hypothetical protein  31.34 
 
 
152 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.45 
 
 
159 aa  53.5  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  27.7 
 
 
188 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2552  phosphodiesterase  27.16 
 
 
156 aa  52.8  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0760667  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1362  phosphodiesterase  26.39 
 
 
158 aa  52.4  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 
162 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2361  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.67 
 
 
173 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0202207  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0099  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.12 
 
 
169 aa  52  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2402  hypothetical protein  29.23 
 
 
155 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  30.95 
 
 
186 aa  51.6  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1506  hypothetical protein  26.67 
 
 
173 aa  51.6  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  33.75 
 
 
160 aa  51.2  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2449  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.27 
 
 
173 aa  51.6  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0186  phosphodiesterase  30.52 
 
 
179 aa  51.2  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1441  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.83 
 
 
150 aa  51.2  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0531917  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.17 
 
 
170 aa  50.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.5 
 
 
162 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1346  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.2 
 
 
167 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1514  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.57 
 
 
210 aa  50.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0530  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.41 
 
 
162 aa  50.1  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  27.61 
 
 
181 aa  49.3  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.49 
 
 
159 aa  49.3  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1198  phosphodiesterase  26.53 
 
 
182 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244677  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.3 
 
 
156 aa  48.5  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5609  phosphodiesterase  26.9 
 
 
168 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749126  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2093  phosphodiesterase, MJ0936 family  38.89 
 
 
167 aa  48.1  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.253727  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  25.71 
 
 
168 aa  47.8  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.94 
 
 
165 aa  47.8  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1020  phosphoesterase, putative  28.95 
 
 
159 aa  47.4  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.417574  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02370  phosphoesterase, MJ0936 family  27.05 
 
 
178 aa  47  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.569795  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1850  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.59 
 
 
164 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.447532 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1399  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.1 
 
 
163 aa  47.4  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.66731  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3652  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.72 
 
 
166 aa  47.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  32.56 
 
 
157 aa  46.6  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  29.81 
 
 
161 aa  46.6  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6302  phosphodiesterase  31.71 
 
 
177 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317374  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0324  phosphodiesterase  30.26 
 
 
152 aa  46.6  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00874535  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3064  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.49 
 
 
196 aa  46.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109166  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  25.17 
 
 
185 aa  46.6  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0341  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.51 
 
 
171 aa  46.6  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.431716  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0028  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.76 
 
 
182 aa  45.8  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.54449  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1529  hypothetical protein  32.85 
 
 
154 aa  45.4  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.145823  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  29.63 
 
 
152 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4059  phosphodiesterase  24.39 
 
 
185 aa  45.4  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00143502  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1420  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.29 
 
 
181 aa  45.1  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.856818  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.19 
 
 
158 aa  45.1  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  29.41 
 
 
157 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1434  phosphodiesterase  22.56 
 
 
183 aa  44.7  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000439444  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19410  phosphoesterase, MJ0936 family  36.96 
 
 
195 aa  44.7  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0347  phosphodiesterase  22.56 
 
 
183 aa  44.7  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166311  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1544  phosphodiesterase  22.56 
 
 
183 aa  44.7  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000690734  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  28.31 
 
 
164 aa  44.7  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  29.41 
 
 
157 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0679  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.37 
 
 
162 aa  44.7  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.488967 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1906  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.38 
 
 
184 aa  44.7  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.27 
 
 
175 aa  43.9  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0543  phosphodiesterase  27.52 
 
 
172 aa  43.5  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.10472  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4323  phosphodiesterase  25.29 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>