56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0168 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0168  Sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
387 aa  748    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0177  sodium/hydrogen exchanger family protein  48.02 
 
 
388 aa  358  9.999999999999999e-98  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.193512  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1549  sodium/hydrogen exchanger family protein  45.12 
 
 
387 aa  332  5e-90  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0575  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  45.24 
 
 
389 aa  327  2.0000000000000001e-88  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.77521  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0159  Na+/H+ antiporter  47.27 
 
 
392 aa  322  5e-87  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1852  sodium/hydrogen exchanger family protein  44.44 
 
 
391 aa  320  1.9999999999999998e-86  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1676  sodium/hydrogen exchanger family protein  43.92 
 
 
391 aa  319  3.9999999999999996e-86  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2288  radical SAM protein  46.5 
 
 
387 aa  318  1e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2056  sodium/hydrogen exchanger family protein  44.18 
 
 
391 aa  316  5e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1177  sodium/hydrogen exchanger  39.07 
 
 
392 aa  300  3e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1944  Sodium/hydrogen exchanger  39.1 
 
 
382 aa  286  4e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1795  sodium/hydrogen exchanger  29.74 
 
 
389 aa  106  8e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0178  Na+/H+ antiporter  27.62 
 
 
386 aa  97.1  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000577111  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0826  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  28.87 
 
 
609 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381657  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0614  sodium/hydrogen exchanger  27.74 
 
 
609 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4604  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  28.06 
 
 
609 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0754  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  29.02 
 
 
609 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133818 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0699  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.02 
 
 
609 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0610  Na+/H+ antiporter  29.02 
 
 
609 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0609  Na+/H+ antiporter  29.02 
 
 
609 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0665  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.02 
 
 
609 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0733  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  29.37 
 
 
609 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1067  sodium/hydrogen exchanger  25.38 
 
 
609 aa  71.6  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000397977  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0587  sodium/hydrogen exchanger  26.45 
 
 
609 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.013374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0768  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.67 
 
 
609 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1008  sodium/hydrogen exchanger  25.44 
 
 
614 aa  66.6  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000272114  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1027  sodium/hydrogen exchanger  25.44 
 
 
614 aa  66.6  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000401836  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0590  Na+/H+ exchanger family protein, putative  25.2 
 
 
614 aa  66.2  0.0000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000104046  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0162  Kef-type K+ transport system, membrane component  24.42 
 
 
608 aa  66.2  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000463033  unclonable  1.19367e-27 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0341  sodium/hydrogen exchanger  25.08 
 
 
401 aa  65.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.972997  normal  0.438917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1889  sodium/hydrogen exchanger  24.05 
 
 
402 aa  64.3  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1038  Na+/H+ antiporter, putative  25.39 
 
 
484 aa  64.3  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000729524  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  25.39 
 
 
484 aa  63.9  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00112359  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1963  sodium/hydrogen exchanger  24.33 
 
 
611 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000117586  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1786  sodium/hydrogen exchanger  27.7 
 
 
402 aa  61.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.612452  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  25.36 
 
 
390 aa  55.8  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  25.89 
 
 
379 aa  55.1  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  24.58 
 
 
399 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  28.32 
 
 
385 aa  51.2  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1681  sodium/hydrogen exchanger  24.38 
 
 
732 aa  50.8  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0867  sodium/hydrogen exchanger  25.28 
 
 
530 aa  49.7  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.638156  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0227  Na/H antiporter (napA)  24.81 
 
 
399 aa  48.9  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.751994  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1862  sodium/hydrogen exchanger  27.25 
 
 
751 aa  47.4  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0056  sodium/hydrogen exchanger  26.85 
 
 
388 aa  47  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0601402  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1258  sodium/hydrogen exchanger  24.53 
 
 
721 aa  46.6  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105109  normal  0.138872 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3878  sodium/hydrogen exchanger  24.71 
 
 
715 aa  46.2  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.267583  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3828  sodium/hydrogen exchanger  24.71 
 
 
715 aa  46.2  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3950  sodium/hydrogen exchanger  31.76 
 
 
414 aa  46.2  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.387419 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  26.04 
 
 
375 aa  45.1  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  23.44 
 
 
389 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0743  sodium/hydrogen exchanger  26.54 
 
 
395 aa  45.1  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.286808  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0606  sodium/hydrogen exchanger  33.13 
 
 
414 aa  44.7  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1792  sodium/hydrogen antiporter  22.73 
 
 
767 aa  44.3  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1839  sodium/hydrogen exchanger  20.95 
 
 
416 aa  43.9  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.212345  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0546  Na+/H+ antiporter  22.99 
 
 
715 aa  43.9  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0565  sodium/hydrogen exchanger  25.58 
 
 
385 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>