More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0147 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0147  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  100 
 
 
145 aa  298  2e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000260074  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1224  dCMP deaminase  44.9 
 
 
151 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.242587 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1174  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.01 
 
 
168 aa  117  7.999999999999999e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3026  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.9 
 
 
151 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.415381  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2215  cytidine/deoxycytidylate deaminase (dCMP deaminase)  37.14 
 
 
159 aa  114  5e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1927  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  44.92 
 
 
186 aa  114  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1340  hypothetical protein  44.07 
 
 
160 aa  113  6.9999999999999995e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21480  deoxycytidylate deaminase  39.04 
 
 
156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1622  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  42.86 
 
 
154 aa  111  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000389213  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2185  dCMP deaminase  43.54 
 
 
156 aa  110  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1747  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.43 
 
 
156 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0753156  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1766  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.04 
 
 
170 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0992  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.35 
 
 
151 aa  108  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0042  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.27 
 
 
170 aa  107  4.0000000000000004e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00633059  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0853  dCMP deaminase  45.71 
 
 
159 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0530  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.7 
 
 
169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0866803  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4824  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.74 
 
 
155 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000597848  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1037  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.15 
 
 
152 aa  107  4.0000000000000004e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0424018 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0516  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.7 
 
 
169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000285737  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1686  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  41.22 
 
 
154 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0257  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.39 
 
 
144 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1443  deoxycytidylate deaminase  41.79 
 
 
158 aa  106  8.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0530  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.85 
 
 
143 aa  104  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1376  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50 
 
 
146 aa  104  4e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1068  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.68 
 
 
164 aa  104  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.223544 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3161  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.61 
 
 
147 aa  103  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04005  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  41.3 
 
 
143 aa  103  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1618  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.31 
 
 
158 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1598  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.09 
 
 
155 aa  100  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000104146  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0348  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  44.7 
 
 
161 aa  100  6e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1985  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.19 
 
 
151 aa  100  7e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000230584  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  38.35 
 
 
162 aa  100  9e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.508443  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1624  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.58 
 
 
174 aa  100  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.526387  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0827  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.28 
 
 
174 aa  99.8  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.98 
 
 
169 aa  99.8  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.238566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2599  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.86 
 
 
153 aa  99.8  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.736828  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0622  deoxycytidylate deaminase, putative  37.93 
 
 
173 aa  99.4  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.646191  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0634  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.6 
 
 
148 aa  99  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0100  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.36 
 
 
149 aa  98.6  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0943  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.91 
 
 
173 aa  99  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2081  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44 
 
 
155 aa  98.6  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000136796  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0828  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.67 
 
 
174 aa  97.4  5e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2391  putative ComE operon protein 2  39.86 
 
 
156 aa  97.4  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0261  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.38 
 
 
145 aa  96.3  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00013435  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1570  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  38.06 
 
 
159 aa  95.9  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1646  ComE operon protein 2  43.08 
 
 
143 aa  95.5  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.772371  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1681  ComE operon protein 2  43.08 
 
 
143 aa  95.5  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000220754  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0726  deoxycytidylate deaminase, putative  43.2 
 
 
187 aa  95.1  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.837477 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4494  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  45.38 
 
 
153 aa  94.4  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.093103  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1552  zinc-binding CMP/dCMP deaminase  43.7 
 
 
164 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.51807  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2313  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.7 
 
 
164 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1647  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  44.07 
 
 
157 aa  94  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.318126  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2401  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.7 
 
 
164 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0510253  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2193  deoxycytidylate deaminase, putative  40 
 
 
165 aa  94  7e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.494514  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1891  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.4 
 
 
177 aa  94  7e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351382  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2261  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.7 
 
 
164 aa  93.6  8e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0205474  normal  0.015389 
 
 
-
 
NC_002936  DET0413  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  43.55 
 
 
157 aa  92.8  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.142884  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_356  cytidine/deoxycytidylate deaminase, Zn-binding protein  43.55 
 
 
157 aa  92.8  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0152459  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0644  ComE operon protein 2  37.59 
 
 
161 aa  92.8  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000470948  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0202  deoxycytidylate deaminase  37.23 
 
 
162 aa  92.8  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.131565 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1242  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.58 
 
 
179 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2433  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  37.4 
 
 
155 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.43778  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0063  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.89 
 
 
153 aa  89.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2389  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.46 
 
 
135 aa  90.1  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0382435 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1252  deoxycytidylate deaminase  42.98 
 
 
146 aa  89.7  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0080548  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0712  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.89 
 
 
185 aa  89.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1156  comE operon protein 2  38.57 
 
 
153 aa  89.4  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.403375  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1419  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.62 
 
 
153 aa  89.4  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0399371  normal  0.378339 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0392  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.28 
 
 
157 aa  89  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.65946  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1943  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.22 
 
 
149 aa  89  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0433  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.21 
 
 
148 aa  88.2  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2856  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.02 
 
 
154 aa  88.2  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00540503 
 
 
-
 
NC_002950  PG1856  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  42.37 
 
 
151 aa  85.9  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00950  dCMP deaminase, putative  32.87 
 
 
273 aa  86.3  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.41296  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0918  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  40.87 
 
 
159 aa  86.7  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3096  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.3 
 
 
182 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0408769 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1855  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.62 
 
 
176 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1001  ComE operon protein 2  37.68 
 
 
156 aa  85.5  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1322  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  40.3 
 
 
166 aa  85.9  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1134  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  40.91 
 
 
166 aa  85.5  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.466602  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3052  ComE operon protein 2  38.41 
 
 
185 aa  85.5  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.901586  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0947  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.15 
 
 
200 aa  84.7  4e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.244959 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4072  ComE operon protein 2  37.5 
 
 
185 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0459  deoxycytidylate deaminase  36.75 
 
 
158 aa  84.3  5e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4348  ComE operon protein 2  37.5 
 
 
185 aa  84  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000304329 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4407  ComE operon protein 2  37.5 
 
 
185 aa  84  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4224  ComE operon protein 2  37.5 
 
 
185 aa  84  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4062  comE operon protein 2  37.5 
 
 
185 aa  84  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0691295  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4459  ComE operon protein 2  37.5 
 
 
185 aa  84  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252157  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4552  ComE operon protein 2  37.5 
 
 
185 aa  84  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.252932  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2084  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.89 
 
 
180 aa  84  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0294047  normal  0.214354 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2450  ComE operon protein 2  42.02 
 
 
151 aa  83.6  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0169534  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1716  late competence protein required for DNA binding and uptake  41.38 
 
 
151 aa  84  7e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000612083  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1704  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  39.83 
 
 
150 aa  82.8  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.677481  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0194  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.46 
 
 
151 aa  82.4  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0791  ComE operon protein 2  37.5 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  0.000000127363 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34441  deoxycytidylate deaminase  34.03 
 
 
341 aa  82  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0952024  normal  0.762426 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4446  ComE operon protein 2  37.5 
 
 
185 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.028939  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_8218  predicted protein  40.52 
 
 
125 aa  82  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.387067  normal  0.180175 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5014  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  37.24 
 
 
194 aa  81.3  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>