98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0142 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0142  putative metal-dependent hydrolase  100 
 
 
153 aa  315  2e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3023  hypothetical protein  59.18 
 
 
167 aa  190  5e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3622  hypothetical protein  55.63 
 
 
175 aa  184  6e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0180  hypothetical protein  58.33 
 
 
169 aa  183  9e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07290  hypothetical protein  58.99 
 
 
162 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.303168  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5013  hypothetical protein  55.24 
 
 
174 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0664  hypothetical protein  58.27 
 
 
162 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0789398  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0510  hypothetical protein  54.55 
 
 
174 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0560  hypothetical protein  56 
 
 
169 aa  181  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1097  hypothetical protein  56 
 
 
169 aa  181  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0498  hypothetical protein  56 
 
 
169 aa  181  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0250  hypothetical protein  57.24 
 
 
172 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01747  hypothetical protein  55.94 
 
 
175 aa  179  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3055  hypothetical protein  56.67 
 
 
169 aa  179  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1485  hypothetical protein  55.94 
 
 
167 aa  179  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.991457  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3267  hypothetical protein  55.63 
 
 
167 aa  178  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0615  hypothetical protein  55.63 
 
 
167 aa  178  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3377  hypothetical protein  55.63 
 
 
167 aa  178  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3521  hypothetical protein  55.63 
 
 
167 aa  178  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1213  protein of unknown function DUF45  54.79 
 
 
168 aa  178  2e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3552  hypothetical protein  55.63 
 
 
167 aa  178  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.393221  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1539  hypothetical protein  55.41 
 
 
169 aa  179  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2641  protein of unknown function DUF45  54.79 
 
 
167 aa  178  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  0.90331 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4399  hypothetical protein  55.63 
 
 
167 aa  178  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.255986  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3223  hypothetical protein  54.93 
 
 
165 aa  177  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0466  hypothetical protein  54.48 
 
 
163 aa  177  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2775  hypothetical protein  55.63 
 
 
207 aa  177  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.828021  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02954  predicted metal dependent hydrolase  55.63 
 
 
167 aa  177  4e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02904  hypothetical protein  55.63 
 
 
167 aa  177  4e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0616  protein of unknown function DUF45  55.63 
 
 
167 aa  177  4e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.903914  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4315  hypothetical protein  55.1 
 
 
170 aa  177  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4195  hypothetical protein  53.52 
 
 
175 aa  177  7e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000226186 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3505  hypothetical protein  54.93 
 
 
167 aa  176  8e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4958  hypothetical protein  49.66 
 
 
179 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5007  hypothetical protein  49.66 
 
 
179 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.311792  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0508  hypothetical protein  49.66 
 
 
166 aa  175  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1408  protein of unknown function DUF45  53.06 
 
 
177 aa  175  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3643  protein of unknown function DUF45  54.23 
 
 
167 aa  175  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.276898  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4831  hypothetical protein  49.66 
 
 
179 aa  175  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3482  hypothetical protein  56.52 
 
 
165 aa  174  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3516  hypothetical protein  56.52 
 
 
165 aa  174  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503461  hitchhiker  0.0000110103 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3412  hypothetical protein  56.52 
 
 
165 aa  174  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.934069  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3408  hypothetical protein  56.52 
 
 
165 aa  174  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3578  hypothetical protein  56.52 
 
 
165 aa  174  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.146008 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0062  protein of unknown function DUF45  52.41 
 
 
173 aa  174  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2061  hypothetical protein  57.53 
 
 
174 aa  174  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0980857  normal  0.354164 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3541  hypothetical protein  54.93 
 
 
166 aa  174  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.263587 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05640  hypothetical protein  51.72 
 
 
171 aa  174  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5254  hypothetical protein  53.15 
 
 
178 aa  173  9e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1390  hypothetical protein  55.78 
 
 
164 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0130  hypothetical protein  58.39 
 
 
168 aa  172  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0173602  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2868  hypothetical protein  50 
 
 
171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2650  hypothetical protein  51.39 
 
 
203 aa  171  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.701907  normal  0.473621 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2355  protein of unknown function DUF45  50 
 
 
172 aa  171  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.202802  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1783  hypothetical protein  51.03 
 
 
189 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3068  hypothetical protein  52.45 
 
 
165 aa  171  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0188  hypothetical protein  51.33 
 
 
166 aa  169  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3432  protein of unknown function DUF45  54.67 
 
 
174 aa  169  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000422395 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1222  hypothetical protein  55.94 
 
 
170 aa  169  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1039  hypothetical protein  51.77 
 
 
179 aa  167  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3293  hypothetical protein  55.1 
 
 
179 aa  167  4e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222647  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1134  hypothetical protein  52.78 
 
 
180 aa  167  6e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0829  protein of unknown function DUF45  54.79 
 
 
170 aa  166  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0136  hypothetical protein  53.9 
 
 
163 aa  164  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2446  hypothetical protein  52.82 
 
 
169 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.382195  hitchhiker  0.00000000481223 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2516  hypothetical protein  52.82 
 
 
169 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.000013684 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2608  hypothetical protein  52.82 
 
 
169 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.353391  hitchhiker  0.0000000267232 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003680  hypothetical protein  50 
 
 
171 aa  160  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02144  hypothetical protein  52.11 
 
 
171 aa  160  8.000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2454  hypothetical protein  51.75 
 
 
168 aa  160  9e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.542737  unclonable  0.00000219257 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1271  hypothetical protein  53.9 
 
 
165 aa  159  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012956 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1608  hypothetical protein  53.28 
 
 
162 aa  159  1e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000317368  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2840  hypothetical protein  51.41 
 
 
173 aa  159  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1839  hypothetical protein  51.41 
 
 
162 aa  159  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00369136  normal  0.470716 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1535  hypothetical protein  50 
 
 
169 aa  157  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.156288  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1484  hypothetical protein  51.88 
 
 
168 aa  157  5e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2626  hypothetical protein  51.06 
 
 
168 aa  155  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2949  protein of unknown function DUF45  46.58 
 
 
166 aa  155  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.12197 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1658  hypothetical protein  50.38 
 
 
170 aa  153  7e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.268756  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2700  protein of unknown function DUF45  48.57 
 
 
174 aa  153  8e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0148854  hitchhiker  0.0000581945 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1643  hypothetical protein  48.57 
 
 
174 aa  153  8e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00239821  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1680  hypothetical protein  48.57 
 
 
174 aa  153  8e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0855822  normal  0.599707 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2447  hypothetical protein  49.65 
 
 
199 aa  152  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3056  hypothetical protein  55.73 
 
 
169 aa  152  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.210578  hitchhiker  0.00906067 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1415  hypothetical protein  49.26 
 
 
166 aa  147  4e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00105973  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1592  hypothetical protein  52.63 
 
 
167 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.18877  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02667  hypothetical protein  44.44 
 
 
165 aa  126  9.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.447659  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2293  hypothetical protein  31.75 
 
 
227 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07620  predicted metal-dependent hydrolase  42.11 
 
 
201 aa  43.9  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.966751  normal  0.648637 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  22.08 
 
 
236 aa  43.9  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07420  predicted metal-dependent hydrolase  32.39 
 
 
198 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.654381  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0977  protein of unknown function DUF45  22.96 
 
 
259 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  30 
 
 
245 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4225  protein of unknown function DUF45  24.3 
 
 
173 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2891  protein of unknown function DUF45  25.25 
 
 
208 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00416901  hitchhiker  0.00700023 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2465  protein of unknown function DUF45  34 
 
 
236 aa  41.2  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0731519  hitchhiker  0.0000760001 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  28.33 
 
 
245 aa  40.8  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  29.41 
 
 
246 aa  40.4  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>