291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0121 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0121  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  100 
 
 
395 aa  820    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2012  DNA-cytosine methyltransferase  65.33 
 
 
398 aa  554  1e-157  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  41.34 
 
 
368 aa  224  2e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  35.55 
 
 
313 aa  183  6e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  32.02 
 
 
308 aa  169  9e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  34.58 
 
 
313 aa  167  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  32.45 
 
 
313 aa  161  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  31.48 
 
 
345 aa  156  6e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  32.11 
 
 
334 aa  138  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  30.77 
 
 
328 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  29.81 
 
 
310 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  27.88 
 
 
400 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  29.53 
 
 
335 aa  116  5e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  28.86 
 
 
323 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  29.54 
 
 
328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  34.56 
 
 
379 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1155  DNA-cytosine methyltransferase  27.13 
 
 
317 aa  107  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26.38 
 
 
357 aa  107  5e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  26.67 
 
 
468 aa  106  6e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  34.98 
 
 
406 aa  105  9e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  28.07 
 
 
421 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  30.98 
 
 
338 aa  104  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  28.36 
 
 
429 aa  102  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  27.59 
 
 
423 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  28.72 
 
 
335 aa  100  4e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  27.25 
 
 
337 aa  100  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  27.59 
 
 
423 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3572  DNA-cytosine methyltransferase  25.19 
 
 
370 aa  100  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  unclonable  0.0000000000674254  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4337  cytosine-specific methyltransferase NlaX  28.08 
 
 
348 aa  99  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0259442  hitchhiker  0.000000011708 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4319  DNA-cytosine methyltransferase family protein  27.11 
 
 
312 aa  99  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165512 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  30.8 
 
 
329 aa  98.6  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  29.2 
 
 
434 aa  98.6  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  28.36 
 
 
324 aa  98.2  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  27.09 
 
 
356 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  24.45 
 
 
440 aa  97.1  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0534  DNA-cytosine methyltransferase  26.3 
 
 
399 aa  96.7  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0499669  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  27.37 
 
 
327 aa  96.3  9e-19  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.23 
 
 
431 aa  95.9  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.85 
 
 
405 aa  95.5  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  27.25 
 
 
474 aa  95.9  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7069  DNA-cytosine methyltransferase  29.82 
 
 
393 aa  95.9  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000135592  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  25.94 
 
 
409 aa  95.9  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4962  DNA-cytosine methyltransferase  27.63 
 
 
342 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  28.49 
 
 
395 aa  95.1  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  24.35 
 
 
727 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  26.61 
 
 
373 aa  94.4  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  25.39 
 
 
325 aa  94  4e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.7 
 
 
362 aa  94  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  25.2 
 
 
488 aa  93.6  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  27.36 
 
 
657 aa  92.4  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  27.92 
 
 
412 aa  92.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  25.68 
 
 
418 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  25.68 
 
 
418 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  28.75 
 
 
406 aa  91.3  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  28.39 
 
 
320 aa  91.3  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  26.29 
 
 
417 aa  91.3  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  26.72 
 
 
416 aa  91.3  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0047  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  25.61 
 
 
352 aa  91.3  3e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00306927  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  23.91 
 
 
331 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  26.08 
 
 
319 aa  90.1  7e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  24.42 
 
 
415 aa  89.7  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  28.33 
 
 
438 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  24.66 
 
 
434 aa  90.1  7e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0365  DNA-cytosine methyltransferase family protein  29.18 
 
 
350 aa  89  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  24.19 
 
 
362 aa  89  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  25.06 
 
 
390 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  24.18 
 
 
373 aa  89  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  26.96 
 
 
437 aa  88.6  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  24.3 
 
 
652 aa  88.6  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2858  DNA-cytosine methyltransferase  26.1 
 
 
502 aa  88.2  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.568201  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  28.78 
 
 
320 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  26.53 
 
 
361 aa  89  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20440  DNA-methyltransferase Dcm  26.09 
 
 
315 aa  87.8  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359782  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  24.61 
 
 
329 aa  87.8  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1127  DNA-cytosine methyltransferase  27.4 
 
 
359 aa  87.4  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000503374  unclonable  0.0000088158 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  22.64 
 
 
365 aa  87  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  26.33 
 
 
305 aa  86.3  8e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  28.11 
 
 
318 aa  86.3  9e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47357  predicted protein  30.45 
 
 
495 aa  85.5  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22131  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.09 
 
 
451 aa  85.9  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  23.46 
 
 
377 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  24.94 
 
 
398 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2284  DNA-cytosine methyltransferase  27.38 
 
 
399 aa  85.9  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1127  DNA cytosine methylase  25.89 
 
 
476 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00778828  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2151  DNA cytosine methylase  25.89 
 
 
476 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  27.32 
 
 
360 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1333  DNA-cytosine methyltransferase  26.01 
 
 
415 aa  85.1  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  25.48 
 
 
454 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2208  DNA cytosine methylase  25.89 
 
 
476 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.736012 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2155  DNA cytosine methylase  25.89 
 
 
476 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0409475 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  24.21 
 
 
431 aa  84.7  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1249  DNA cytosine methylase  25.89 
 
 
476 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.608462  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  27.87 
 
 
336 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5352  DNA-cytosine methyltransferase  24.26 
 
 
444 aa  84  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  27.23 
 
 
364 aa  83.6  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  25.44 
 
 
350 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1510  DNA-cytosine methyltransferase  24.94 
 
 
414 aa  83.6  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  24.66 
 
 
399 aa  83.6  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0082  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  30.04 
 
 
424 aa  83.6  0.000000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000201074 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  29.73 
 
 
438 aa  83.2  0.000000000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>