More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0095 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0095  HAD family hydrolase  100 
 
 
212 aa  431  1e-120  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1899  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  57.21 
 
 
212 aa  222  3e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000244384  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0391  phosphoglycolate phosphatase  52.41 
 
 
216 aa  206  3e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0914  hypothetical protein  45.67 
 
 
216 aa  194  8e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0387  conserved hypothetical protein, putative HAD superfamily hydrolase  49.25 
 
 
214 aa  191  5e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.322414  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1600  pyrophosphatase PpaX  46.7 
 
 
217 aa  190  2e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  9.2205e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1824  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  46.7 
 
 
213 aa  171  8e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0490965  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1470  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  45.69 
 
 
213 aa  168  7e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000674726  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1650  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  46.19 
 
 
213 aa  167  1e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0740  hypothetical protein  42.72 
 
 
212 aa  166  2e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.347846  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0927  HAD family hydrolase  36.45 
 
 
210 aa  119  4e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5280  pyrophosphatase PpaX  35.71 
 
 
216 aa  105  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5677  pyrophosphatase PpaX  36.26 
 
 
216 aa  105  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  31.05 
 
 
222 aa  104  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  4.5535e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  35.16 
 
 
215 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.33 
 
 
225 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3704  pyrophosphatase PpaX  35.75 
 
 
212 aa  102  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5322  pyrophosphatase PpaX  34.62 
 
 
216 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3168  pyrophosphatase PpaX  37.08 
 
 
222 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5265  pyrophosphatase PpaX  34.07 
 
 
216 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2037  HAD family hydrolase  33.68 
 
 
225 aa  99  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4854  pyrophosphatase PpaX  34.07 
 
 
216 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  30.58 
 
 
252 aa  98.6  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4839  pyrophosphatase PpaX  34.07 
 
 
216 aa  98.6  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5390  pyrophosphatase PpaX  34.07 
 
 
216 aa  98.6  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5010  pyrophosphatase PpaX  34.07 
 
 
216 aa  98.6  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  32.24 
 
 
225 aa  98.2  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  30.1 
 
 
252 aa  97.8  9e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  30.1 
 
 
252 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  30.1 
 
 
252 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  32.58 
 
 
214 aa  97.8  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  30.1 
 
 
252 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  30.1 
 
 
252 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  30.1 
 
 
252 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  30.1 
 
 
252 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  30.1 
 
 
252 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.69 
 
 
225 aa  96.7  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2984  pyrophosphatase PpaX  35.39 
 
 
215 aa  96.3  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  33.52 
 
 
216 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  32.58 
 
 
214 aa  95.9  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  29.57 
 
 
252 aa  95.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  29.57 
 
 
252 aa  95.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  29.57 
 
 
252 aa  95.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  29.57 
 
 
252 aa  95.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0012  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.96 
 
 
212 aa  94.7  8e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0912057  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  29.57 
 
 
252 aa  94.7  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  35.94 
 
 
217 aa  94.4  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0868  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.09 
 
 
227 aa  93.6  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  3.53752e-06  normal  0.072442 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  28.37 
 
 
235 aa  92.8  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.57 
 
 
230 aa  92.4  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1313  HAD family hydrolase  30.93 
 
 
232 aa  90.9  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1212  hypothetical protein  33.51 
 
 
219 aa  90.1  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0173059  normal  0.0170431 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  29.5 
 
 
225 aa  89.7  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0484  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.09 
 
 
218 aa  89.4  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  30.93 
 
 
225 aa  89  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  30 
 
 
296 aa  88.2  9e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2726  phosphoglycolate phosphatase  32.11 
 
 
223 aa  88.2  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.658118  hitchhiker  0.000458503 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  28.12 
 
 
226 aa  88.2  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02117  indigoidine synthesis like protein  28.65 
 
 
214 aa  87.8  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0261  HAD family hydrolase  29.02 
 
 
217 aa  87.8  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  1.30583e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.65 
 
 
218 aa  87.4  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1144  HAD family hydrolase  28.12 
 
 
213 aa  86.7  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  26.7 
 
 
253 aa  87  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  26.29 
 
 
226 aa  87  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1437  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.12 
 
 
213 aa  85.5  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111508  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3263  HAD family hydrolase  29.47 
 
 
216 aa  84.7  9e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  25.35 
 
 
229 aa  84.3  1e-15  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.41 
 
 
209 aa  84.7  1e-15  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  25.91 
 
 
226 aa  83.2  2e-15  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1950  HAD family hydrolase  29.19 
 
 
228 aa  84  2e-15  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0253028  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.17 
 
 
217 aa  82.4  4e-15  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.652563  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0364  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.23 
 
 
229 aa  82.8  4e-15  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2080  phosphoglycolate phosphatase  28.11 
 
 
237 aa  82.8  4e-15  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  26.06 
 
 
234 aa  82.4  5e-15  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  26.47 
 
 
232 aa  82.4  5e-15  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0218  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.86 
 
 
206 aa  82  6e-15  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  27.89 
 
 
235 aa  81.6  9e-15  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2285  phosphatases  29.19 
 
 
221 aa  81.3  1e-14  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.812545  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  30 
 
 
218 aa  81.3  1e-14  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2004  phosphoglycolate phosphatase  32.14 
 
 
221 aa  81.3  1e-14  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000935232  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  25.53 
 
 
234 aa  80.5  2e-14  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0065  hypothetical protein  27.17 
 
 
221 aa  80.1  2e-14  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  28.95 
 
 
226 aa  80.5  2e-14  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 
227 aa  80.5  2e-14  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.94 
 
 
217 aa  80.5  2e-14  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.246246 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  28.12 
 
 
228 aa  80.5  2e-14  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4527  phosphoglycolate phosphatase  33.52 
 
 
216 aa  80.1  2e-14  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2332  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  32.69 
 
 
221 aa  79.7  3e-14  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150125  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3123  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.81 
 
 
221 aa  80.1  3e-14  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025393 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  23.4 
 
 
232 aa  79.7  3e-14  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2202  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.81 
 
 
221 aa  79.7  3e-14  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.958257  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  23.4 
 
 
233 aa  79.3  4e-14  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3722  phosphoglycolate phosphatase  27.13 
 
 
232 aa  79.3  4e-14  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0244843  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3961  phosphoglycolate phosphatase  27.13 
 
 
232 aa  79.3  4e-14  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.512442  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0230  phosphoglycolate phosphatase  27.13 
 
 
232 aa  79.3  4e-14  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00770  hypothetical protein  27.17 
 
 
221 aa  79.3  4e-14  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  25 
 
 
240 aa  79.3  4e-14  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1697  HAD family hydrolase  30.77 
 
 
231 aa  79  5e-14  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0993915 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2220  HAD superfamily hydrolase  31.63 
 
 
221 aa  79  5e-14  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2064  HAD superfamily hydrolase  31.63 
 
 
221 aa  79  5e-14  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>