More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0093 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0093  30S ribosomal protein S9  100 
 
 		 129 aa  258  2e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1908  ribosomal protein S9  65.12 
 
 		 129 aa  179  1e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0388  30S ribosomal protein S9  62.79 
 
 		 129 aa  174  4e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1652  30S ribosomal protein S9  62.79 
 
 		 129 aa  171  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.386728  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1826  30S ribosomal protein S9  62.79 
 
 		 129 aa  171  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.0000606063  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1472  30S ribosomal protein S9  62.79 
 
 		 129 aa  171  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000347675  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0738  30S ribosomal protein S9  62.02 
 
 		 129 aa  170  5e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.211677  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0385  30S ribosomal protein S9  61.24 
 
 		 129 aa  168  2e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.704674  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0912  30S ribosomal protein S9  62.02 
 
 		 129 aa  167  4e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1598  30S ribosomal protein S9  59.69 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158082  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2938  ribosomal protein S9  53.54 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000844995 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0902  30S ribosomal protein S9  52.8 
 
 		 161 aa  137  6e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.829966  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  51.18 
 
 		 159 aa  135  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1872  30S ribosomal protein S9  51.18 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.952658 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3025  30S ribosomal protein S9  52.76 
 
 		 157 aa  134  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3107  30S ribosomal protein S9  50.39 
 
 		 160 aa  133  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.966484  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0149  30S ribosomal protein S9  51.18 
 
 		 162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0795  30S ribosomal protein S9  56 
 
 		 130 aa  133  8e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718866  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1321  30S ribosomal protein S9  52.8 
 
 		 155 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  53.54 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  52 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2708  30S ribosomal protein S9  50.39 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.421371  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1163  30S ribosomal protein S9  51.97 
 
 		 160 aa  132  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.456788  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1422  30S ribosomal protein S9  50.39 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.51395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4591  30S ribosomal protein S9  48.82 
 
 		 160 aa  131  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2672  30S ribosomal protein S9  49.61 
 
 		 158 aa  130  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.569835  normal  0.132209 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1050  30S ribosomal protein S9  52.8 
 
 		 130 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000126027  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2454  30S ribosomal protein S9  49.61 
 
 		 158 aa  130  9e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  52.76 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1179  30S ribosomal protein S9  50.39 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.554063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1476  30S ribosomal protein S9  50.4 
 
 		 166 aa  128  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.270542 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0244  30S ribosomal protein S9  51.18 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0861  30S ribosomal protein S9  52 
 
 		 155 aa  128  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0415089  normal  0.103809 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1234  30S ribosomal protein S9  51.2 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4594  30S ribosomal protein S9  50.39 
 
 		 188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4611  30S ribosomal protein S9  48.03 
 
 		 162 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3190  30S ribosomal protein S9  51.2 
 
 		 130 aa  128  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000452354  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1650  30S ribosomal protein S9  50.4 
 
 		 160 aa  128  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.377487 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0021  30S ribosomal protein S9  50.4 
 
 		 160 aa  128  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849835  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1899  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 130 aa  128  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.1303899999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0607  30S ribosomal protein S9  52 
 
 		 130 aa  128  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000206629  hitchhiker  0.00149279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2843  30S ribosomal protein S9  48.82 
 
 		 161 aa  128  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2620  30S ribosomal protein S9  48.82 
 
 		 161 aa  128  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.159482 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1681  30S ribosomal protein S9  50.39 
 
 		 155 aa  128  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00362695  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2175  30S ribosomal protein S9  50.4 
 
 		 160 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0915323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2650  30S ribosomal protein S9  48.82 
 
 		 161 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1601  30S ribosomal protein S9  49.6 
 
 		 164 aa  127  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.292372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  53.54 
 
 		 130 aa  127  6e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4345  30S ribosomal protein S9  49.61 
 
 		 160 aa  127  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0786  30S ribosomal protein S9  49.61 
 
 		 158 aa  126  8.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.637937  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0790  30S ribosomal protein S9  49.61 
 
 		 158 aa  126  8.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.552498  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0821  30S ribosomal protein S9  50.39 
 
 		 149 aa  126  9.000000000000001e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.766995  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2496  30S ribosomal protein S9  49.61 
 
 		 158 aa  126  9.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0797  30S ribosomal protein S9  51.94 
 
 		 128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000494469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0913  ribosomal protein S9  50.79 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000269489  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0902  30S ribosomal protein S9  50.4 
 
 		 130 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1018  30S ribosomal protein S9  51.18 
 
 		 152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2697  30S ribosomal protein S9  47.24 
 
 		 161 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.145825  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2875  30S ribosomal protein S9  51.2 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0195834  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3285  30S ribosomal protein S9  49.6 
 
 		 180 aa  125  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  49.61 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2241  SSU ribosomal protein S9P  50.78 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.201316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3348  ribosomal protein S9  50.79 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0614997 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4425  ribosomal protein S9  50.4 
 
 		 130 aa  124  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3436  30S ribosomal protein S9  51.61 
 
 		 131 aa  124  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4119  30S ribosomal protein S9  50.4 
 
 		 130 aa  124  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4693  30S ribosomal protein S9  50.4 
 
 		 130 aa  124  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380118  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2425  30S ribosomal protein S9  48.8 
 
 		 164 aa  124  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149157  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0562  SSU ribosomal protein S9P  48.03 
 
 		 131 aa  125  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000134066  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2249  30S ribosomal protein S9  50.4 
 
 		 163 aa  125  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1384  30S ribosomal protein S9  48.8 
 
 		 161 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1233  30S ribosomal protein S9  49.6 
 
 		 130 aa  124  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000147442  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1940  ribosomal protein S9  50 
 
 		 129 aa  124  6e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3085  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 130 aa  124  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000996861  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3371  30S ribosomal protein S9  51.22 
 
 		 130 aa  123  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3517  30S ribosomal protein S9  51.22 
 
 		 130 aa  123  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143376  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00882  30S ribosomal protein S9  49.61 
 
 		 130 aa  123  7e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3453  30S ribosomal protein S9  51.22 
 
 		 130 aa  123  7e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1513  SSU ribosomal protein S9P  51.2 
 
 		 165 aa  123  8.000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.472306 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2399  ribosomal protein S9  49.61 
 
 		 130 aa  123  9e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.696602  normal  0.066769 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0212  ribosomal protein S9  50.4 
 
 		 131 aa  123  9e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000467508  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1316  30S ribosomal protein S9  50.4 
 
 		 130 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.428523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4408  30S ribosomal protein S9  50.4 
 
 		 130 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0056  SSU ribosomal protein S9P  48.8 
 
 		 130 aa  122  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0128063  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13050  30S ribosomal protein S9  48.8 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0560  30S ribosomal protein S9  48.8 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000599765  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2726  ribosomal protein S9  51.97 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000561308  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1133  30S ribosomal protein S9  50.39 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000113025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0461  30S ribosomal protein S9  50.39 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000140237  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  47.62 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000028456  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4533  30S ribosomal protein S9  50.4 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0525  30S ribosomal protein S9  50.39 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000883336  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1537  30S ribosomal protein S9  48.84 
 
 		 128 aa  121  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000611504  normal  0.14818 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0215  30S ribosomal protein S9  47.15 
 
 		 130 aa  121  3e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00249156  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4348  30S ribosomal protein S9  49.61 
 
 		 130 aa  121  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000012665  hitchhiker  0.00291766 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0128  30S ribosomal protein S9  46.34 
 
 		 130 aa  121  3e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000606121  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0923  30S ribosomal protein S9  49.6 
 
 		 130 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1566  30S ribosomal protein S9  49.61 
 
 		 128 aa  121  4e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000968491  normal  0.322438 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3665  30S ribosomal protein S9  48.82 
 
 		 130 aa  121  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0023412  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004510  SSU ribosomal protein S9p (S16e)  48.03 
 
 		 130 aa  121  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000229051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>