More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0091 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0091  NLP/P60  100 
 
 
170 aa  347  4e-95  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  50.85 
 
 
342 aa  123  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  50.89 
 
 
341 aa  122  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  1.54936e-13  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  48.7 
 
 
246 aa  122  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  48.67 
 
 
246 aa  119  2e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  50.46 
 
 
346 aa  119  2e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  49.54 
 
 
342 aa  117  9e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  1.3444e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  49.54 
 
 
342 aa  117  1e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  51.79 
 
 
240 aa  115  4e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  8.98283e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  46.61 
 
 
349 aa  114  7e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  45.32 
 
 
210 aa  113  1e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  41.86 
 
 
220 aa  112  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  49.54 
 
 
347 aa  110  9e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  6.88808e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0958  NLP/P60 protein  51.26 
 
 
202 aa  110  1e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  1.5981e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  42.06 
 
 
192 aa  109  2e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  43.66 
 
 
217 aa  108  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  42.06 
 
 
192 aa  108  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  46.22 
 
 
255 aa  107  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  32.95 
 
 
202 aa  106  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  38.24 
 
 
265 aa  106  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  1.04581e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  35.03 
 
 
205 aa  106  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  37.93 
 
 
211 aa  105  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  42.37 
 
 
221 aa  104  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  43.59 
 
 
223 aa  104  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  43.59 
 
 
223 aa  104  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  43.59 
 
 
223 aa  104  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  5.24971e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  42.37 
 
 
221 aa  103  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  1.64638e-06  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0751  NLP/P60 protein  40.41 
 
 
173 aa  103  1e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  42.98 
 
 
218 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  41.67 
 
 
223 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  41.88 
 
 
224 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  41.88 
 
 
223 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  42.98 
 
 
218 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  5.76333e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  41.88 
 
 
223 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  42.98 
 
 
218 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  42.98 
 
 
218 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  42.98 
 
 
234 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  2.2944e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  42.98 
 
 
234 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  6.24175e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  42.98 
 
 
234 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  41.53 
 
 
224 aa  102  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  42.11 
 
 
391 aa  101  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1177  putative transmembrane protein  42.15 
 
 
222 aa  101  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0196017  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  43.9 
 
 
183 aa  101  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2166  NLP/P60 protein  33.72 
 
 
194 aa  100  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343346  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  39.53 
 
 
338 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  1.71376e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0173  NlpC/P60 family protein  39.74 
 
 
458 aa  100  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  3.88548e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2667  peptidace C40 NLP/P60  38.64 
 
 
187 aa  99.4  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.411217  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  39.52 
 
 
257 aa  99.8  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  35.15 
 
 
215 aa  99.8  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  40.68 
 
 
234 aa  99.4  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  35.19 
 
 
215 aa  99.4  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  41.53 
 
 
226 aa  98.6  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  41.53 
 
 
228 aa  97.4  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1554  NLP/P60  40.17 
 
 
208 aa  97.4  8e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68889  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  32.5 
 
 
150 aa  97.1  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  33.56 
 
 
267 aa  97.1  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  38.46 
 
 
476 aa  95.9  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2100  NLP/P60  41.32 
 
 
201 aa  96.3  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.995227  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  37.72 
 
 
307 aa  95.9  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  36.15 
 
 
298 aa  95.5  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  39.29 
 
 
266 aa  95.1  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  30.81 
 
 
269 aa  95.1  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  37.04 
 
 
424 aa  95.1  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  3.25506e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2100  NLP/P60 protein  44.63 
 
 
302 aa  94.7  5e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2519  cell wall-associated hydrolase-like protein  42.31 
 
 
225 aa  94.4  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  41.59 
 
 
274 aa  94.4  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  33.33 
 
 
177 aa  94.4  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2178  NLP/P60 protein  39.39 
 
 
193 aa  94  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  40.34 
 
 
150 aa  94  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  33.1 
 
 
285 aa  93.6  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  32.54 
 
 
181 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  37.3 
 
 
208 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2291  NLP/P60 protein  42.02 
 
 
242 aa  92.8  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  37.6 
 
 
208 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  30.23 
 
 
269 aa  92.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  1.66415e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  37.3 
 
 
208 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1118  NLP/P60 protein  36.13 
 
 
189 aa  93.2  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.579853  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1768  NLP/P60 protein  40.17 
 
 
325 aa  92.8  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  37.3 
 
 
207 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2335  putative outer membrane lipoprotein  35.62 
 
 
191 aa  92.4  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  37.4 
 
 
188 aa  92.4  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  37.4 
 
 
188 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  37.4 
 
 
188 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  37.4 
 
 
188 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  37.4 
 
 
188 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  37.4 
 
 
188 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  38.39 
 
 
278 aa  92  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.49372e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  37.4 
 
 
188 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  37.4 
 
 
188 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  37.4 
 
 
188 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  41.67 
 
 
210 aa  91.7  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  42.11 
 
 
333 aa  92  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  37.21 
 
 
284 aa  91.7  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  44.44 
 
 
366 aa  91.7  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  32.94 
 
 
188 aa  91.3  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1293  NLP/P60  36.15 
 
 
205 aa  91.3  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0496746  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  43.2 
 
 
193 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  43.2 
 
 
205 aa  90.9  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  4.4472e-09 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  36.36 
 
 
235 aa  90.9  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  27.88 
 
 
248 aa  90.9  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>