15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0077 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0077  PDP protein  100 
 
 
170 aa  316  8e-86  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.390146  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0372  pdp protein  44.91 
 
 
177 aa  127  9e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0184343  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1786  MTA/SAH nucleosidase  37.42 
 
 
188 aa  113  1e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000723674  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1925  hypothetical protein  40.24 
 
 
175 aa  110  1e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2129  ATPase, AAA family protein  38.32 
 
 
187 aa  105  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0370  hypothetical protein  36.9 
 
 
171 aa  95.1  4e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1844  hypothetical protein  34.97 
 
 
172 aa  90.9  7e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1488  hypothetical protein  34.36 
 
 
172 aa  90.1  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1669  hypothetical protein  34.36 
 
 
172 aa  90.1  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2706  hypothetical protein  28.66 
 
 
208 aa  52.4  3e-06  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2072  hypothetical protein  31.13 
 
 
214 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0030  hypothetical protein  31.63 
 
 
177 aa  45.4  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4001  MgtE intracellular region  26.47 
 
 
431 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.114119  normal  0.413173 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4061  MgtE intracellular region  26.47 
 
 
431 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.803121  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3987  MgtE intracellular region  26.47 
 
 
417 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.576405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>