More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0070 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0070  major facilitator transporter  100 
 
 
438 aa  869  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2146  major facilitator superfamily MFS_1  53.67 
 
 
438 aa  455  1e-127  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0010  multidrug-efflux transporter  46.67 
 
 
430 aa  374  1e-102  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0184  multidrug-efflux transporter  44.52 
 
 
430 aa  361  1e-98  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  1.54899e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0410  multidrug-efflux transporter  43.72 
 
 
433 aa  352  8e-96  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1277  major facilitator superfamily transporter  45.33 
 
 
433 aa  348  1e-94  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1378  multidrug resistance efflux transporter, putative  45.54 
 
 
433 aa  346  4e-94  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.993613  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0744  major facilitator transporter  43.91 
 
 
433 aa  340  3e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0364296  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1567  multidrug resistance efflux transporter, putative  45.77 
 
 
433 aa  330  3e-89  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0274  multidrug ABC transporter  46.35 
 
 
433 aa  326  6e-88  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.351648  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0422  hypothetical protein  35.97 
 
 
455 aa  258  1e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0398  hypothetical protein  35.97 
 
 
455 aa  258  2e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2425  major facilitator transporter  36.22 
 
 
458 aa  253  4e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112572  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1822  transporter, MFS superfamily  36.59 
 
 
458 aa  252  8e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  3.42182e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0371  major facilitator family transporter  36.36 
 
 
458 aa  251  2e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  3.4034e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3246  major facilitator transporter  34.09 
 
 
454 aa  249  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3103  major facilitator transporter  34.09 
 
 
454 aa  249  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.973708  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3066  major facilitator transporter  34.09 
 
 
456 aa  249  1e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0477  inner membrane transport protein YajR  34.97 
 
 
454 aa  244  2e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1037  major facilitator superfamily MFS_1  36.45 
 
 
454 aa  242  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0496  inner membrane transport protein YajR  34.74 
 
 
454 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0475  inner membrane transport protein YajR  34.74 
 
 
454 aa  240  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0483  inner membrane transport protein YajR  34.52 
 
 
454 aa  239  7e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.121319 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0538  inner membrane transport protein YajR  34.52 
 
 
454 aa  239  7e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.342738  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1527  major facilitator superfamily MFS_1  41.79 
 
 
407 aa  238  2e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3078  major facilitator superfamily MFS_1  32.44 
 
 
457 aa  238  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0349  transporter, major facilitator family  33.18 
 
 
454 aa  237  4e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0511  transporter, major facilitator family  33.18 
 
 
454 aa  236  6e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.905004  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0499  major facilitator transporter  32.96 
 
 
454 aa  236  6e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0463  major facilitator transporter  32.96 
 
 
454 aa  236  6e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00379  hypothetical protein  32.96 
 
 
454 aa  236  6e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00375  predicted transporter  32.96 
 
 
454 aa  236  6e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0459  major facilitator transporter  32.96 
 
 
454 aa  236  6e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3206  major facilitator transporter  32.96 
 
 
454 aa  235  9e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  9.0157e-05 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3182  major facilitator superfamily MFS_1  32.96 
 
 
454 aa  235  9e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.565255  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3022  major facilitator transporter  35.75 
 
 
472 aa  234  2e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.358015  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0894  major facilitator transporter  34.03 
 
 
453 aa  234  2e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298012  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2294  major facilitator family transporter  35.4 
 
 
458 aa  234  2e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.843575  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3877  major facilitator transporter  37.85 
 
 
464 aa  234  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5050  general substrate transporter  35.81 
 
 
465 aa  232  8e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0243206 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2691  major facilitator family transporter  38.12 
 
 
454 aa  232  1e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0232907  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2228  major facilitator transporter  35.64 
 
 
461 aa  230  4e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.568651  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3274  major facilitator superfamily MFS_1  33.94 
 
 
454 aa  230  4e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0995  DNA polymerase III, alpha subunit  37.61 
 
 
471 aa  229  8e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  8.12271e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1085  major facilitator transporter  33.41 
 
 
454 aa  228  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  5.02867e-06 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2887  major facilitator superfamily MFS_1  32.73 
 
 
455 aa  227  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1959  major facilitator transporter  34.18 
 
 
454 aa  225  1e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00498964  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4519  major facilitator transporter  32.43 
 
 
464 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.301476  normal  0.140313 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4719  major facilitator transporter  34.46 
 
 
464 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.210959 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06530  major facilitator family transporter  32.64 
 
 
462 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0804742  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1684  sugar efflux MFS family transporter  34.18 
 
 
454 aa  224  2e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0484  major facilitator family transporter  34.2 
 
 
464 aa  223  7e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291295 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0655  major facilitator family transporter  33.11 
 
 
464 aa  223  7e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0513  major facilitator transporter  34.2 
 
 
464 aa  221  1e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09195  major facilitator transporter  35.22 
 
 
462 aa  221  2e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0308711  normal  0.679663 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0517  major facilitator transporter  33.94 
 
 
464 aa  221  2e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0921044 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0867  major facilitator transporter  35.49 
 
 
454 aa  217  3e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551059  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0449  major facilitator transporter  33.87 
 
 
460 aa  217  3e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.780134  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0515  transporter, putative  35.4 
 
 
455 aa  217  4e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.97153  normal  0.615177 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0570  major facilitator transporter  34.47 
 
 
455 aa  217  4e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.42598e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3390  major facilitator transporter  32.13 
 
 
455 aa  215  1e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3711  major facilitator transporter  34.84 
 
 
455 aa  214  3e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  1.34514e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0555  major facilitator transporter  34.47 
 
 
455 aa  213  6e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  6.5492e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0580  major facilitator transporter  34.47 
 
 
455 aa  213  6e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  9.44901e-05  normal  0.0306529 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3754  major facilitator transporter  34.47 
 
 
455 aa  213  6e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  1.39158e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0586  major facilitator superfamily MFS_1  34.47 
 
 
455 aa  213  6e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  3.0167e-06  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0437  major facilitator transporter  38.81 
 
 
453 aa  212  9e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.630168 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4029  transporter, putative  35.75 
 
 
455 aa  212  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3591  major facilitator transporter  35.99 
 
 
455 aa  212  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  3.19402e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  32.03 
 
 
462 aa  209  8e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  8.04058e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3420  major facilitator transporter  35.99 
 
 
455 aa  208  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  6.01324e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1993  major facilitator transporter  37.31 
 
 
454 aa  207  4e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  2.56386e-08  decreased coverage  9.79309e-05 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0532  major facilitator transporter  35.75 
 
 
455 aa  206  5e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  8.51019e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0639  major facilitator transporter  34.22 
 
 
455 aa  206  5e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00996628  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4026  major facilitator transporter  33.63 
 
 
455 aa  206  6e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000155639  hitchhiker  3.027e-09 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0482  major facilitator transporter  36.39 
 
 
407 aa  205  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0747  major facilitator superfamily transporter  37.94 
 
 
456 aa  203  6e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.726619  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3308  major facilitator superfamily MFS_1  37.58 
 
 
401 aa  202  1e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0575835  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0639  major facilitator transporter  37.5 
 
 
455 aa  201  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000191567  hitchhiker  4.8698e-06 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0303  major facilitator superfamily MFS_1  33.76 
 
 
394 aa  199  8e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.189721  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3314  major facilitator transporter  35.94 
 
 
455 aa  199  9e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  9.2062e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0276  major facilitator superfamily MFS_1  33.76 
 
 
387 aa  199  1e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0340  major facilitator transporter  34.29 
 
 
385 aa  198  1e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0922  major facilitator family transporter  34.53 
 
 
454 aa  198  2e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2141  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 
462 aa  197  3e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.154122 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0314  major facilitator transporter  34.2 
 
 
418 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0421  putative multidrug-efflux transporter transmembrane protein  33.25 
 
 
387 aa  195  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107977  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2778  major facilitator transporter  33.25 
 
 
395 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2164  major facilitator transporter  33.25 
 
 
395 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.570545  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0955  major facilitator superfamily MFS_1  36.51 
 
 
465 aa  194  4e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.903849  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0813  major facilitator family transporter  36.51 
 
 
465 aa  194  4e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2789  major facilitator transporter  33.25 
 
 
385 aa  194  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2838  major facilitator transporter  33.25 
 
 
395 aa  193  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0298937  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4248  major facilitator transporter  37.1 
 
 
452 aa  194  4e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.718043  unclonable  2.0202e-12 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2696  major facilitator transporter  33.25 
 
 
385 aa  193  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.236302 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6108  major facilitator transporter  33.51 
 
 
395 aa  192  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0610  major facilitator superfamily MFS_1  34.65 
 
 
395 aa  193  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495333  normal  0.0469856 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0534  major facilitator transporter  36.67 
 
 
455 aa  192  7e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  1.00009e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0499  major facilitator family transporter  36.23 
 
 
478 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.788244  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3773  major facilitator transporter  34.64 
 
 
416 aa  191  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>