59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0068 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0068  exo-beta-1 3-glucanase-like  100 
 
 
638 aa  1280  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00110829  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1668  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  41.24 
 
 
650 aa  452  1e-126  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.137314  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35060  Glycoside hydrolase  43.67 
 
 
533 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.923975  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1605  glycoside hydrolase family protein  43.2 
 
 
531 aa  363  7e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1290  glycoside hydrolase family protein  52.08 
 
 
521 aa  358  2e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1332  beta (1-6) glucans synthase  40.12 
 
 
522 aa  349  9e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.438077  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1740  beta (1-6) glucans synthase, putative  52.08 
 
 
525 aa  349  1e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3979  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  51.76 
 
 
521 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.724466  normal  0.625635 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4421  putative beta (1-6) glucans synthase  37.4 
 
 
541 aa  300  5e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0112946  normal  0.554528 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3208  putative glucan 1,3-beta-glucosidase  51.49 
 
 
540 aa  292  1e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.537701  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2602  putative beta (1-6) glucans synthase  36.49 
 
 
541 aa  290  5e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.288043  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2858  putative beta (1-6) glucans synthase  34.81 
 
 
558 aa  284  3e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.178086  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1787  putative beta (1-6) glucans synthase  34.29 
 
 
532 aa  278  2e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0597936 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4171  putative beta (1-6) glucans synthase, ndvC-like protein  34.24 
 
 
538 aa  276  9e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2930  putative beta (1-6) glucans synthase, NdvC-like protein  37.22 
 
 
536 aa  275  2e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0666963  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1373  putative beta (1-6) glucan synthase  33.53 
 
 
535 aa  271  2e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  9.27844e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2614  putative beta (1-6) glucans synthase  34.29 
 
 
558 aa  272  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272631  hitchhiker  0.00127237 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1781  putative beta (1-6) glucans synthase  35.92 
 
 
494 aa  264  3e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4423  glycosyl transferase family protein  41.56 
 
 
905 aa  228  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501491  normal  0.0679911 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2837  glycoside hydrolase family protein  33.11 
 
 
529 aa  216  1e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.413837  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49360  glucosyl transferase  35.65 
 
 
869 aa  211  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.169531  normal  0.125269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4173  putative beta-(1-3)-glucosyl transferase, ndvB-like protein  37.3 
 
 
895 aa  200  8e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761366  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39140  Glycosyl transferase, family 2  36.73 
 
 
863 aa  198  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0104614  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2600  glycosyl transferase family protein  35.99 
 
 
919 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0728813  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2146  glycosyl transferase family protein  38.31 
 
 
903 aa  194  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.302574  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2612  glycosyl transferase family protein  37.22 
 
 
895 aa  193  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.228291  hitchhiker  0.00221032 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1779  glycosyl transferase family protein  35.14 
 
 
889 aa  193  8e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4198  glycosyl transferase family protein  33.96 
 
 
863 aa  191  3e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80228  normal  0.702129 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2860  glycosyl transferase family protein  36.89 
 
 
899 aa  191  3e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00529842  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1135  glycosyl transferase family protein  33.65 
 
 
862 aa  191  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.67659 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4093  glycosyl transferase family protein  33.23 
 
 
863 aa  190  6e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.363982  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1789  glycosyl transferase family protein  35.42 
 
 
889 aa  190  8e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.121922  normal  0.0753716 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1526  beta-(1-3)-glucosyl transferase, putative  33.65 
 
 
863 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.166405 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1089  glycosyl transferase family protein  34.09 
 
 
885 aa  187  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.182025  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2928  glycosyl transferase family 2  32.86 
 
 
944 aa  181  3e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.904629  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1698  glycosyl transferase family 2  32.84 
 
 
844 aa  175  3e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  6.12337e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1280  glycosyl transferase family protein  33.92 
 
 
889 aa  174  4e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0531421  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3209  glycosyl transferase family 2  31.67 
 
 
868 aa  173  9e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.871407  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0560  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 
917 aa  172  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922438  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1372  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 
859 aa  162  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0188568  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4379  glycoside hydrolase family protein  34.08 
 
 
295 aa  152  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1332  glycosyl transferase family protein  33.96 
 
 
831 aa  153  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0376589 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3721  putative glycosyl hydrolase  34.32 
 
 
295 aa  149  1e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.439077  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1524  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.07 
 
 
842 aa  146  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566497  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28554  Cell wall endo-beta-1,3-glucanase  30.7 
 
 
555 aa  91.7  3e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.496398  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74722  Glycoside hydrolase, family 17  28.29 
 
 
308 aa  82  3e-14  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.154228  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10150  Putative beta-transglucosylase. Family GH17. A fumigatus Bgt1-like (Eurofung)  27.34 
 
 
304 aa  81.6  4e-14  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.251061  normal  0.119691 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4380  glycoside hydrolase family protein  26.42 
 
 
321 aa  72.8  2e-11  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3720  putative glycosyl hydrolase  26.49 
 
 
336 aa  70.5  1e-10  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03727  putative beta transglucosylase, GH17 family (Eurofung)  24.24 
 
 
366 aa  69.7  2e-10  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.774595 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32120  family 17 glucosidase SCW11 precursor (Soluble cell wall protein 11)  26.84 
 
 
452 aa  68.6  3e-10  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.506951  normal  0.0756506 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04700  Endo-beta-1,3-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B430]  26.28 
 
 
649 aa  68.6  3e-10  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361112  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57025  cell wall glucanase Probable family 17 glucosidase SCW4 precursor (Soluble cell wall protein 4)  26.54 
 
 
303 aa  66.6  1e-09  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277446  normal  0.953702 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0507  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  24.83 
 
 
338 aa  65.9  2e-09  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89695  Soluble Cell Wall protein  24.57 
 
 
369 aa  58.2  4e-07  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00660  glucan 1,3 beta-glucosidase protein putative  38.95 
 
 
249 aa  57.8  6e-07  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  25.15 
 
 
1290 aa  57.8  6e-07  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07950  Beta-1,3-endoglucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AUT0]  26.57 
 
 
465 aa  52  3e-05  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000158341  normal  0.358394 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01551  Putative beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BD29]  23.87 
 
 
555 aa  47.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.550208  normal  0.0387764 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>