More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0066 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0028  threonyl-tRNA synthetase  65.79 
 
 
603 aa  860  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1819  threonyl-tRNA synthetase  64.4 
 
 
606 aa  835  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.196151  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0081  threonyl-tRNA synthetase  64.45 
 
 
605 aa  838  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  7.16431e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0238  threonyl-tRNA synthetase  65.83 
 
 
602 aa  855  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1702  threonyl-tRNA synthetase  63.58 
 
 
617 aa  828  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000310236  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0199  threonyl-tRNA synthetase  66.33 
 
 
602 aa  858  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0330  threonyl-tRNA synthetase  62.96 
 
 
606 aa  822  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000295964  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0611  threonyl-tRNA synthetase  63.64 
 
 
609 aa  830  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.260291  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0066  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 
602 aa  1249  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  2.16362e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0216  threonyl-tRNA synthetase  66.17 
 
 
602 aa  854  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 
636 aa  615  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  49.25 
 
 
636 aa  617  1e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  49.31 
 
 
644 aa  613  1e-174  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  48.4 
 
 
636 aa  608  1e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  48.49 
 
 
645 aa  607  1e-172  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  2.55721e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 
636 aa  606  1e-172  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 
645 aa  605  1e-172  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  7.4774e-09  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  47.67 
 
 
644 aa  599  1e-170  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0984  threonyl-tRNA synthetase  48.18 
 
 
644 aa  597  1e-169  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.234013 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 
644 aa  597  1e-169  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  47.67 
 
 
638 aa  597  1e-169  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.02997e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 
638 aa  597  1e-169  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2997  threonyl-tRNA synthetase  49.04 
 
 
644 aa  597  1e-169  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  50.9 
 
 
643 aa  597  1e-169  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 
646 aa  593  1e-168  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 
635 aa  592  1e-168  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.78172e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  46.97 
 
 
649 aa  589  1e-167  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0490  threonyl-tRNA synthetase  46.09 
 
 
647 aa  591  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00808985  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1907  threonyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 
637 aa  590  1e-167  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  1.67344e-05 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2823  threonyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 
643 aa  587  1e-166  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.77582e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 
640 aa  579  1e-164  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0608  threonyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 
634 aa  580  1e-164  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.769524  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 
640 aa  578  1e-163  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 
644 aa  577  1e-163  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 
644 aa  577  1e-163  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  46.26 
 
 
634 aa  574  1e-162  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 
639 aa  571  1e-161  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.79764e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 
635 aa  570  1e-161  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 
637 aa  565  1e-160  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  1.37846e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  46.97 
 
 
643 aa  564  1e-159  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 
635 aa  563  1e-159  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  7.17334e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  46.11 
 
 
644 aa  563  1e-159  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  9.9925e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0392  threonyl-tRNA synthetase  47.83 
 
 
633 aa  558  1e-158  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 
640 aa  558  1e-157  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  45.62 
 
 
640 aa  556  1e-157  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  46.72 
 
 
635 aa  556  1e-157  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  46.01 
 
 
639 aa  556  1e-157  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  44.59 
 
 
633 aa  558  1e-157  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  9.91077e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 
636 aa  553  1e-156  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0723  threonyl-tRNA synthetase  45.17 
 
 
631 aa  555  1e-156  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  4.76694e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 
634 aa  552  1e-156  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.36416e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 
640 aa  553  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  45 
 
 
639 aa  553  1e-156  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 
639 aa  549  1e-155  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 
639 aa  549  1e-155  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 
639 aa  549  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 
639 aa  549  1e-155  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 
638 aa  551  1e-155  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0835  threonyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 
640 aa  551  1e-155  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 
640 aa  551  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 
639 aa  546  1e-154  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  46.11 
 
 
648 aa  545  1e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 
635 aa  542  1e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  3.83369e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3194  threonyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 
637 aa  541  1e-152  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0627  threonyl-tRNA synthetase  45.72 
 
 
588 aa  536  1e-151  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0516  threonyl-tRNA synthetase  46.61 
 
 
637 aa  534  1e-150  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 
638 aa  533  1e-150  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_659  threonyl-tRNA synthetase (thrS)  46.45 
 
 
582 aa  533  1e-150  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  3.28118e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1664  threonyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 
640 aa  531  1e-149  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000605435  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16370  threonyl-tRNA synthetase /Ser-tRNA(Thr) hydrolase  46.7 
 
 
586 aa  529  1e-149  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.12349 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0681  threonyl-tRNA synthetase  46.1 
 
 
582 aa  528  1e-148  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  3.23411e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1643  threonyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 
645 aa  527  1e-148  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193799  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3742  threonyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 
646 aa  526  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.190527  hitchhiker  0.00137888 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04450  threonyl-tRNA synthetase /Ser-tRNA(Thr) hydrolase  44.97 
 
 
586 aa  526  1e-148  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0386598  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02485  threonyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 
638 aa  527  1e-148  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0163148  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0487  threonyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
638 aa  524  1e-147  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.348528  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2787  threonyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
649 aa  524  1e-147  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0753  threonyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 
582 aa  524  1e-147  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.105849  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2061  threonyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 
641 aa  519  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399726  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 
641 aa  520  1e-146  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1667  threonyl-tRNA synthetase  45.68 
 
 
642 aa  520  1e-146  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.301446  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02079  threonyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 
642 aa  520  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1824  threonyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 
636 aa  520  1e-146  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  3.92835e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0829  threonyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 
640 aa  521  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.127421  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 
638 aa  518  1e-145  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1336  threonyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 
669 aa  516  1e-145  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0942  threonyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 
642 aa  515  1e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  4.84442e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1976  threonyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 
640 aa  517  1e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30647  normal  0.0664699 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3623  threonyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 
643 aa  515  1e-145  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.263576  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1577  threonyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 
636 aa  516  1e-145  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.219126  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1951  threonyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 
642 aa  518  1e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.250897  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1034  threonyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 
611 aa  518  1e-145  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0844  threonyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 
642 aa  513  1e-144  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2643  threonyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 
637 aa  513  1e-144  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 
635 aa  513  1e-144  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1745  threonyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 
637 aa  513  1e-144  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239329 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003716  threonyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 
642 aa  514  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  2.63633e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1010  threonyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 
640 aa  514  1e-144  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0955  threonyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 
650 aa  514  1e-144  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.94017  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0935  threonyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 
611 aa  513  1e-144  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0867221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>