More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0065 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011773  BCAH820_1891  dihydroxy-acid dehydratase  59.68 
 
 
557 aa  690  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4269  dihydroxy-acid dehydratase  69.7 
 
 
561 aa  808  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34728  normal  0.47373 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0013  dihydroxy-acid dehydratase  68.27 
 
 
558 aa  785  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00657346  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1769  dihydroxy-acid dehydratase  66.85 
 
 
553 aa  749  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2036  dihydroxy-acid dehydratase  69.41 
 
 
557 aa  793  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0217  dihydroxy-acid dehydratase  60.71 
 
 
554 aa  686  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2230  dihydroxy-acid dehydratase  57.14 
 
 
557 aa  663  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0742  dihydroxy-acid dehydratase  56.61 
 
 
565 aa  649  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.853368  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1275  dihydroxy-acid dehydratase  61.43 
 
 
557 aa  710  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.208811  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0012  dihydroxy-acid dehydratase  69.41 
 
 
582 aa  795  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2871  dihydroxy-acid dehydratase  59.43 
 
 
559 aa  688  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0065  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 
561 aa  1143  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  2.40463e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1853  dihydroxy-acid dehydratase  59.86 
 
 
557 aa  694  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1111  dihydroxy-acid dehydratase  59.14 
 
 
558 aa  674  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4450  dihydroxy-acid dehydratase  56.66 
 
 
561 aa  662  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0129872  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1446  dihydroxy-acid dehydratase  58.93 
 
 
557 aa  688  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125544  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0744  dihydroxy-acid dehydratase  57.14 
 
 
566 aa  651  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.217755 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4263  dihydroxy-acid dehydratase  70.3 
 
 
560 aa  808  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0039  dihydroxy-acid dehydratase  68.63 
 
 
558 aa  768  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00474435  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0662  dihydroxy-acid dehydratase  60.71 
 
 
613 aa  697  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.587488  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1854  dihydroxy-acid dehydratase  59.86 
 
 
557 aa  697  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0854  dihydroxy-acid dehydratase  57.58 
 
 
565 aa  660  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1969  dihydroxy-acid dehydratase  59.57 
 
 
557 aa  692  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1752  dihydroxy-acid dehydratase  66.01 
 
 
557 aa  748  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3218  dihydroxy-acid dehydratase  71.23 
 
 
562 aa  829  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1541  dihydroxy-acid dehydratase  67.74 
 
 
558 aa  779  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3488  dihydroxy-acid dehydratase  60.04 
 
 
557 aa  695  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2014  dihydroxy-acid dehydratase  59.86 
 
 
558 aa  692  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0410747  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0811  dihydroxy-acid dehydratase  60.71 
 
 
558 aa  697  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4240  dihydroxy-acid dehydratase  69.41 
 
 
560 aa  804  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2167  dihydroxy-acid dehydratase  57.32 
 
 
565 aa  652  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1906  dihydroxy-acid dehydratase  57.07 
 
 
559 aa  655  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4111  dihydroxy-acid dehydratase  69.41 
 
 
560 aa  804  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0132321  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0540  dihydroxy-acid dehydratase  55.89 
 
 
569 aa  641  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1694  dihydroxy-acid dehydratase  59.68 
 
 
557 aa  693  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1710  dihydroxy-acid dehydratase  59.86 
 
 
557 aa  694  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1717  dihydroxy-acid dehydratase  59.86 
 
 
557 aa  694  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1669  dihydroxy-acid dehydratase  59.57 
 
 
557 aa  689  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0012  dihydroxy-acid dehydratase  68.63 
 
 
558 aa  788  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1937  dihydroxy-acid dehydratase  59.75 
 
 
557 aa  692  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0041  dihydroxy-acid dehydratase  71.71 
 
 
559 aa  838  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1716  dihydroxy-acid dehydratase  55 
 
 
579 aa  627  1e-178  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0300181 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0609  dihydroxy-acid dehydratase  55.6 
 
 
565 aa  622  1e-177  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2090  dihydroxy-acid dehydratase  55.36 
 
 
562 aa  616  1e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2127  dihydroxy-acid dehydratase  55.36 
 
 
562 aa  616  1e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1665  dihydroxy-acid dehydratase  54.82 
 
 
562 aa  614  1e-174  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.361875  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2040  dihydroxyacid dehydratase  53.93 
 
 
580 aa  603  1e-171  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0805544  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1851  dihydroxy-acid dehydratase, truncated  55.58 
 
 
577 aa  600  1e-170  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.14511  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0665  dihydroxy-acid dehydratase  51.43 
 
 
552 aa  561  1e-158  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000174611  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0369  dihydroxy-acid dehydratase  51.97 
 
 
554 aa  561  1e-158  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0386  dihydroxy-acid dehydratase  51.97 
 
 
554 aa  559  1e-158  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0018  dihydroxy-acid dehydratase  54.5 
 
 
559 aa  560  1e-158  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1593  dihydroxy-acid dehydratase  52.6 
 
 
556 aa  558  1e-157  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0280  dihydroxy-acid dehydratase  52.16 
 
 
554 aa  558  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.141574  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0356  dihydroxy-acid dehydratase  52.22 
 
 
557 aa  556  1e-157  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1755  dihydroxy-acid dehydratase  50.9 
 
 
558 aa  550  1e-155  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_738  dihydroxy-acid dehydratase  50.44 
 
 
555 aa  548  1e-155  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  1.09399e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2259  dihydroxyacid dehydratase  50.18 
 
 
552 aa  549  1e-155  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0302  dihydroxy-acid dehydratase  50 
 
 
552 aa  549  1e-155  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2147  dihydroxy-acid dehydratase  50.36 
 
 
553 aa  550  1e-155  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0753  dihydroxy-acid dehydratase  50.27 
 
 
555 aa  548  1e-154  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7332  Dihydroxy-acid dehydratase  47.6 
 
 
612 aa  548  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2538  dihydroxy-acid dehydratase  48.6 
 
 
612 aa  545  1e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0834  dihydroxy-acid dehydratase  50.09 
 
 
555 aa  545  1e-153  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00030605  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2481  dihydroxy-acid dehydratase  49.2 
 
 
563 aa  542  1e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00604257  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2713  dihydroxy-acid dehydratase  50.54 
 
 
554 aa  542  1e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.387248  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1344  dihydroxy-acid dehydratase  49.83 
 
 
618 aa  541  1e-152  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0122991  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0102  dihydroxy-acid dehydratase  51.98 
 
 
552 aa  535  1e-151  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0234635  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3508  dihydroxy-acid dehydratase  47.11 
 
 
616 aa  536  1e-151  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2036  dihydroxy-acid dehydratase  49.73 
 
 
557 aa  532  1e-150  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  1.99143e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0009  dihydroxy-acid dehydratase  47.76 
 
 
556 aa  529  1e-149  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.961342  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0116  dihydroxy-acid dehydratase  48.75 
 
 
555 aa  531  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2486  dihydroxy-acid dehydratase  47.2 
 
 
614 aa  530  1e-149  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.274808  normal  0.116227 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3112  dihydroxy-acid dehydratase  49.55 
 
 
556 aa  529  1e-149  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.735973  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1912  dihydroxy-acid dehydratase  47.4 
 
 
553 aa  528  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.82927  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08860  dihydroxyacid dehydratase  48.83 
 
 
552 aa  528  1e-148  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.131951  normal  0.204216 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3418  dihydroxy-acid dehydratase  48.7 
 
 
620 aa  525  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10820  dihydroxy-acid dehydratase  50.36 
 
 
551 aa  525  1e-148  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1072  dihydroxy-acid dehydratase  45.84 
 
 
618 aa  527  1e-148  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1506  dihydroxy-acid dehydratase  46 
 
 
619 aa  528  1e-148  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.189174 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1259  dihydroxy-acid dehydratase  47.06 
 
 
553 aa  526  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  9.47046e-07  hitchhiker  1.23711e-05 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0292  dihydroxy-acid dehydratase  47.03 
 
 
616 aa  527  1e-148  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5358  dihydroxy-acid dehydratase  46.19 
 
 
613 aa  528  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0358  dihydroxy-acid dehydratase  47.13 
 
 
619 aa  526  1e-148  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0364  dihydroxy-acid dehydratase  47.13 
 
 
619 aa  526  1e-148  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2756  dihydroxy-acid dehydratase  46.66 
 
 
646 aa  525  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1784  dihydroxy-acid dehydratase  46.7 
 
 
615 aa  526  1e-148  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.272247  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3721  dihydroxy-acid dehydratase  46.88 
 
 
553 aa  525  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  6.18938e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1648  dihydroxy-acid dehydratase  46.55 
 
 
618 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5057  dihydroxy-acid dehydratase  46.36 
 
 
615 aa  527  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0469  dihydroxy-acid dehydratase  46.03 
 
 
615 aa  525  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2292  dihydroxy-acid dehydratase  45.98 
 
 
615 aa  526  1e-148  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.809008  normal  0.0178596 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3804  dihydroxy-acid dehydratase  46.45 
 
 
619 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3662  dihydroxy-acid dehydratase  47.13 
 
 
619 aa  526  1e-148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5002  dihydroxy-acid dehydratase  46.19 
 
 
613 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.138711  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5178  dihydroxy-acid dehydratase  46.03 
 
 
613 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00413  dihydroxy-acid dehydratase  46.09 
 
 
599 aa  523  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2717  dihydroxy-acid dehydratase  47.04 
 
 
617 aa  522  1e-147  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.52758  normal  0.12218 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0336  dihydroxy-acid dehydratase  46.19 
 
 
613 aa  524  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2491  dihydroxy-acid dehydratase  46.01 
 
 
613 aa  523  1e-147  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>