More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0056 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0056  acetate kinase  100 
 
 
389 aa  789  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.614754  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  49.24 
 
 
404 aa  389  1e-107  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1158  acetate kinase  46.82 
 
 
398 aa  380  1e-104  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00331056  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0104  acetate kinase  46.31 
 
 
397 aa  372  1e-102  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.66342  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1034  acetate kinase  49.36 
 
 
402 aa  370  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00869824  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1318  acetate kinase  47.34 
 
 
396 aa  365  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0788  acetate kinase  47.59 
 
 
396 aa  366  1e-100  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.119296  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  46.35 
 
 
422 aa  364  1e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0712  acetate kinase  47.34 
 
 
396 aa  363  2e-99  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0640  acetate kinase  46.77 
 
 
394 aa  361  1e-98  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3242  acetate kinase  47.01 
 
 
402 aa  353  2e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  46.23 
 
 
398 aa  353  2e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  1.54307e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  45.73 
 
 
404 aa  353  3e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1162  acetate kinase  44.92 
 
 
399 aa  352  8e-96  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  44.97 
 
 
403 aa  349  5e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  45.34 
 
 
399 aa  348  8e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  44.72 
 
 
403 aa  348  9e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1049  acetate kinase  44.89 
 
 
401 aa  348  1e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1473  acetate kinase  42.89 
 
 
411 aa  346  5e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0812  acetate kinase  45.36 
 
 
399 aa  345  7e-94  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0732  acetate kinase  46.85 
 
 
401 aa  345  1e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000188256  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  45.75 
 
 
406 aa  343  2e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  45.27 
 
 
399 aa  343  3e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.59685e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0343  acetate kinase  46.06 
 
 
402 aa  341  1e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.441374  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  45.84 
 
 
401 aa  341  1e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  45.09 
 
 
397 aa  340  3e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1865  acetate kinase  43.78 
 
 
404 aa  340  4e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  46.41 
 
 
398 aa  339  4e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1221  acetate kinase  46.1 
 
 
394 aa  338  8e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.805277  normal  0.0186268 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  45.34 
 
 
398 aa  338  9e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28510  acetate kinase  44.07 
 
 
409 aa  338  1e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6196  acetate kinase  43.88 
 
 
380 aa  337  3e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  43.22 
 
 
399 aa  337  3e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  4.13101e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  44.64 
 
 
405 aa  336  4e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  9.04206e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7970  acetate kinase  46.6 
 
 
378 aa  336  5e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2543  acetate kinase  44.73 
 
 
421 aa  333  2e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.60205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3528  acetate kinase  45.34 
 
 
394 aa  332  5e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18649  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  43.75 
 
 
406 aa  331  1e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0208  acetate kinase  43.94 
 
 
398 aa  330  3e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.777111  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  44.42 
 
 
397 aa  329  5e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0270  acetate kinase  44.53 
 
 
396 aa  329  6e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0296  acetate kinase  44.56 
 
 
403 aa  329  6e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  44.68 
 
 
396 aa  329  6e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2578  acetate kinase  44.76 
 
 
408 aa  328  7e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.406613  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  43.18 
 
 
398 aa  328  1e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2230  acetate kinase  41.67 
 
 
417 aa  328  1e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  8.35714e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4468  acetate kinase  44.16 
 
 
397 aa  327  2e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3049  acetate kinase  45.04 
 
 
407 aa  326  3e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0947096 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4888  acetate kinase  43.9 
 
 
397 aa  326  5e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1081  acetate kinase  42.61 
 
 
398 aa  326  5e-88  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.347293 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0621  acetate kinase  43.61 
 
 
397 aa  326  5e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  2.98382e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4535  acetate kinase  43.9 
 
 
397 aa  326  5e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4773  acetate kinase  43.9 
 
 
397 aa  325  6e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4772  acetate kinase  43.9 
 
 
397 aa  325  6e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4381  acetate kinase  43.9 
 
 
397 aa  325  6e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4371  acetate kinase  43.9 
 
 
397 aa  325  6e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4746  acetate kinase  43.64 
 
 
397 aa  325  8e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0489  acetate kinase  43.64 
 
 
397 aa  325  9e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4755  acetate kinase  43.64 
 
 
397 aa  325  1e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2393  propionate kinase  41.25 
 
 
404 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2227  propionate kinase  41.25 
 
 
404 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.422778  normal  0.198158 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2180  propionate kinase  41.25 
 
 
404 aa  324  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2234  propionate kinase  41.25 
 
 
404 aa  324  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2280  propionate kinase  41.25 
 
 
404 aa  324  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.257687  decreased coverage  0.00259617 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2953  acetate kinase  41.06 
 
 
402 aa  323  3e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.845819  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  42.07 
 
 
397 aa  323  4e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  2.19259e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  43.38 
 
 
397 aa  322  5e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0608  acetate kinase  40.5 
 
 
421 aa  321  1e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.387186  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08760  acetate kinase  41.12 
 
 
403 aa  321  1e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2295  acetate kinase  42.35 
 
 
395 aa  321  1e-86  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0655  acetate kinase  42.32 
 
 
397 aa  321  2e-86  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  4.14678e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0206  acetate kinase  43.69 
 
 
398 aa  321  2e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1105  acetate kinase  41.27 
 
 
398 aa  321  2e-86  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000219398  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0642  acetate kinase  42.89 
 
 
399 aa  319  5e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.376841  normal  0.374072 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0580  acetate kinase  43.04 
 
 
399 aa  319  5e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1249  acetate kinase  42.78 
 
 
397 aa  319  7e-86  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.407585  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2277  acetate kinase  41 
 
 
421 aa  319  7e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  4.4561e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1946  acetate kinase  41.25 
 
 
421 aa  318  8e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1275  acetate kinase  42.34 
 
 
417 aa  318  8e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.419483  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01770  acetate kinase  42.96 
 
 
388 aa  318  1e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3396  acetate kinase  41.09 
 
 
421 aa  318  1e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  7.41189e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  41.77 
 
 
397 aa  316  4e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1731  acetate kinase  44.61 
 
 
401 aa  316  5e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  4.22881e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3761  acetate kinase  46.55 
 
 
386 aa  314  1e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1034  acetate kinase  42.04 
 
 
421 aa  315  1e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.52602e-11  hitchhiker  1.92642e-06 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1180  acetate kinase  42.42 
 
 
414 aa  314  2e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2707  acetate kinase  42.04 
 
 
421 aa  313  3e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1754  acetate kinase  39.4 
 
 
421 aa  313  5e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.22438e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1733  acetate kinase  42.82 
 
 
394 aa  311  1e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0940  acetate kinase  43.72 
 
 
397 aa  311  1e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  9.14313e-11  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2409  acetate kinase  43.39 
 
 
413 aa  311  1e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0528  acetate kinase  43.04 
 
 
399 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6116  acetate kinase  42.03 
 
 
583 aa  310  3e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  41.92 
 
 
395 aa  310  3e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  2.37028e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0538  acetate kinase  43.04 
 
 
399 aa  309  4e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0550  acetate kinase  43.04 
 
 
399 aa  309  4e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0560  acetate kinase  41.67 
 
 
398 aa  309  5e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0797  acetate kinase  41.12 
 
 
406 aa  309  5e-83  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0768  hypothetical protein  41.39 
 
 
397 aa  309  5e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  3.29459e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1820  acetate kinase  42.33 
 
 
408 aa  307  2e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  1.79563e-09  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>