More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0051 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0051  periplasmic solute binding protein  100 
 
 
292 aa  593  1e-169  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.958228  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1548  periplasmic solute binding protein  48.63 
 
 
294 aa  297  2e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  7.7382e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0199  periplasmic solute binding protein  32.75 
 
 
298 aa  189  3e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.254854  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4333  periplasmic solute binding protein  34.93 
 
 
303 aa  186  4e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2538  zinc/manganese transport system substrate-binding protein  31.6 
 
 
297 aa  184  2e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.41437  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0448  periplasmic solute binding protein  33.46 
 
 
303 aa  183  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.158105  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0972  periplasmic solute binding protein  30.03 
 
 
292 aa  178  7e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0180469  normal  0.0507696 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3516  periplasmic solute binding protein  31.67 
 
 
288 aa  179  7e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.996617  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3715  periplasmic solute binding protein  34.38 
 
 
307 aa  176  5e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108388  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3141  adhesion protein, putative  32.73 
 
 
302 aa  175  6e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.452459  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0617  periplasmic solute binding protein  33.46 
 
 
304 aa  175  7e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0528  periplasmic solute binding protein  30.39 
 
 
315 aa  175  9e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000128694  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3310  periplasmic solute binding protein  31.52 
 
 
302 aa  171  9e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0243618  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1530  periplasmic solute binding protein  30.24 
 
 
299 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311517  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3463  periplasmic solute binding protein  32.35 
 
 
302 aa  169  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0567  periplasmic solute binding protein  32.35 
 
 
302 aa  169  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0566  periplasmic solute binding protein  32.35 
 
 
302 aa  169  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2339  ABC metal ion transporter, periplasmic solute binding protein  30.95 
 
 
299 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.591821  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0527  periplasmic solute binding protein  30.61 
 
 
302 aa  166  3e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000427742  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3798  periplasmic solute binding protein  30.61 
 
 
302 aa  166  3e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.173939  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0565  adhesion protein, putative  31.16 
 
 
293 aa  166  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3924  periplasmic solute binding protein  30.61 
 
 
302 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126038  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3741  periplasmic solute binding protein  30.8 
 
 
302 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.434352  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1625  periplasmic solute binding protein  30.82 
 
 
299 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.624808  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3917  periplasmic solute binding protein  31.52 
 
 
309 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.247464  normal  0.1329 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000605  zinc ABC transporter-binding protein ZnuA  32.17 
 
 
308 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  1.53864e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0490  periplasmic solute binding protein  27.37 
 
 
300 aa  150  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1535  periplasmic solute binding protein  30.74 
 
 
299 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.619757 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06465  hypothetical protein  31.3 
 
 
308 aa  144  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2435  periplasmic solute binding protein  26.64 
 
 
308 aa  122  6e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0108745  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3052  periplasmic solute binding protein  28.23 
 
 
301 aa  111  2e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2781  periplasmic solute binding protein  20.74 
 
 
318 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1216  periplasmic solute binding protein  27.17 
 
 
278 aa  89.4  6e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1681  periplasmic solute binding protein  26.89 
 
 
277 aa  89  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  25.37 
 
 
292 aa  86.7  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  25.47 
 
 
316 aa  86.3  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  25 
 
 
316 aa  85.5  1e-15  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  25 
 
 
316 aa  85.5  1e-15  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  25 
 
 
316 aa  85.5  1e-15  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  25.4 
 
 
316 aa  84.7  2e-15  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  24.19 
 
 
316 aa  84  3e-15  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  24.6 
 
 
316 aa  83.6  3e-15  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  24.19 
 
 
316 aa  84  3e-15  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  25.4 
 
 
316 aa  83.2  4e-15  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  26.61 
 
 
365 aa  83.6  4e-15  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1141  periplasmic solute binding protein  23.53 
 
 
310 aa  80.5  3e-14  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  24.84 
 
 
316 aa  79.7  5e-14  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  25.82 
 
 
315 aa  79.7  6e-14  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  25.47 
 
 
328 aa  78.6  1e-13  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  6.88581e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1015  periplasmic solute binding protein  26.1 
 
 
293 aa  78.2  1e-13  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  24.82 
 
 
318 aa  78.6  1e-13  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  25.33 
 
 
265 aa  77.8  2e-13  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2836  periplasmic solute binding protein  23.02 
 
 
299 aa  78.2  2e-13  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  24.4 
 
 
346 aa  77  3e-13  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  28.93 
 
 
292 aa  76.3  5e-13  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1470  periplasmic solute binding protein  20.31 
 
 
298 aa  76.3  6e-13  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0700113  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  24.71 
 
 
309 aa  75.5  1e-12  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  23.2 
 
 
300 aa  74.7  2e-12  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  26.17 
 
 
304 aa  73.9  3e-12  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  24.9 
 
 
300 aa  73.9  3e-12  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  27.78 
 
 
368 aa  73.6  4e-12  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  25.6 
 
 
303 aa  72.4  8e-12  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  24.91 
 
 
305 aa  72.4  9e-12  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  25.52 
 
 
292 aa  72  1e-11  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0852  high-affinity zinc uptake system protein ZnuA precursor  23.86 
 
 
297 aa  71.6  2e-11  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0338292  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1258  periplasmic solute binding protein  27.78 
 
 
494 aa  70.5  3e-11  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00438687  decreased coverage  0.000164305 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  26.25 
 
 
292 aa  70.5  3e-11  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  26.12 
 
 
325 aa  69.7  5e-11  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0916  periplasmic solute binding protein  24.69 
 
 
307 aa  69.3  8e-11  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  23.94 
 
 
292 aa  68.6  1e-10  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  2.44311e-07  unclonable  1.16493e-08 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  24.18 
 
 
317 aa  68.6  1e-10  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6299  putative adhesin  25 
 
 
307 aa  68.2  1e-10  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  26.05 
 
 
285 aa  68.2  1e-10  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  26.21 
 
 
292 aa  68.6  1e-10  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1730  periplasmic solute binding protein  23.23 
 
 
313 aa  68.6  1e-10  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  22.18 
 
 
290 aa  68.2  2e-10  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72550  putative adhesin  24.54 
 
 
307 aa  67.8  2e-10  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  23.57 
 
 
344 aa  67.8  2e-10  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06745  hypothetical protein  23.02 
 
 
311 aa  68.2  2e-10  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  31.12 
 
 
311 aa  67.8  2e-10  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1591  periplasmic solute binding protein  27.59 
 
 
497 aa  67  3e-10  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  23.89 
 
 
282 aa  67.4  3e-10  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  28.5 
 
 
292 aa  66.6  4e-10  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  23.85 
 
 
325 aa  67  4e-10  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  27.32 
 
 
316 aa  66.2  6e-10  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  21.94 
 
 
292 aa  65.9  7e-10  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  23.16 
 
 
313 aa  65.9  7e-10  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3026  ABC-type transport system, periplasmic component  23.39 
 
 
302 aa  65.9  8e-10  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  21.34 
 
 
290 aa  65.9  8e-10  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  24.15 
 
 
302 aa  65.1  1e-09  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.73282e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  23.19 
 
 
296 aa  65.1  1e-09  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3805  periplasmic solute binding protein  26.1 
 
 
298 aa  65.1  1e-09  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0163421  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1891  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  24.79 
 
 
288 aa  65.1  1e-09  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18350  periplasmic solute binding protein  23.02 
 
 
308 aa  64.3  2e-09  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.03257e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  29.8 
 
 
311 aa  64.7  2e-09  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2423  periplasmic solute binding protein  23.95 
 
 
296 aa  64.3  2e-09  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.890095  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  29.8 
 
 
311 aa  64.7  2e-09  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1041  periplasmic solute binding protein  22.18 
 
 
303 aa  63.9  3e-09  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.203742 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2176  periplasmic solute binding protein  20.66 
 
 
320 aa  63.9  3e-09  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1122  periplasmic solute binding protein  23.05 
 
 
328 aa  63.9  3e-09  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>