31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0050 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0050  putative manganese transport system permease protein  100 
 
 
249 aa  473  1e-132  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1547  ABC-3 protein  49.16 
 
 
249 aa  211  1e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  3.63711e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3515  ABC-3 protein  37.55 
 
 
261 aa  108  8e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3140  ABC 3 transport family protein  34.89 
 
 
251 aa  105  8e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4332  ABC-3 protein  37.14 
 
 
265 aa  104  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.364125  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0566  ABC 3 transport family protein  33.76 
 
 
259 aa  102  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3462  ABC-3 protein  35.86 
 
 
259 aa  102  8e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0567  ABC-3 protein  35.86 
 
 
255 aa  102  8e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0568  ABC-3 protein  34.03 
 
 
255 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3309  ABC-3 protein  36.07 
 
 
262 aa  99.4  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.224275  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2782  ABC-3 protein  29.54 
 
 
466 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0449  ABC-3 protein  34.84 
 
 
263 aa  95.1  9e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.856508  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3740  ABC-3 protein  35.27 
 
 
266 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.298841  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3923  ABC-3 protein  35.27 
 
 
266 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00893533  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0618  ABC-3 protein  35.35 
 
 
286 aa  94.7  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.087201  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3797  ABC-3 protein  35.27 
 
 
266 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.48799  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0528  ABC-3 protein  35.27 
 
 
266 aa  93.6  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  4.97802e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0529  hypothetical protein  34.3 
 
 
263 aa  91.3  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00670346  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3714  ABC-3 protein  34.21 
 
 
263 aa  87.4  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0390511  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06464  hypothetical protein  30.64 
 
 
264 aa  85.9  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000604  zinc ABC transporter permease protein ZnuB  30.13 
 
 
267 aa  80.1  3e-14  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000103291  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2539  zinc/manganese transport system permease protein  29.13 
 
 
256 aa  72.8  5e-12  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.421777  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  29.9 
 
 
281 aa  50.8  2e-05  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  3.45254e-05  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  27.59 
 
 
280 aa  49.7  4e-05  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0996  zinc ABC transporter, permease protein  27.96 
 
 
274 aa  49.3  6e-05  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349684  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0402  ABC-3 protein  25.35 
 
 
273 aa  48.9  8e-05  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0757  ABC-3 protein  33.93 
 
 
269 aa  47  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.422432  normal  0.510372 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0605  cation ABC transporter, permease protein, putative  33.93 
 
 
269 aa  47  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.999911  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  25.14 
 
 
272 aa  46.6  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  26.13 
 
 
276 aa  46.6  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  27.27 
 
 
266 aa  42.4  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>