40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0046 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0046  putative salt-induced outer membrane protein-like  100 
 
 
268 aa  547  1e-155  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.843258  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0606  hypothetical protein  26.34 
 
 
250 aa  56.2  5e-07  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2791  hypothetical protein  26.34 
 
 
245 aa  55.8  7e-07  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  6.11146e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3467  hypothetical protein  23.81 
 
 
264 aa  55.1  1e-06  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0271654 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1569  hypothetical protein  25.85 
 
 
251 aa  53.5  4e-06  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.91147e-05 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1502  hypothetical protein  24.02 
 
 
257 aa  53.5  4e-06  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0114999  hitchhiker  0.000875087 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0668  putative salt-induced outer membrane protein  27.5 
 
 
259 aa  53.1  5e-06  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  2.04125e-10  hitchhiker  1.58177e-07 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1722  hypothetical protein  26.15 
 
 
289 aa  53.1  5e-06  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.281842  normal  0.346331 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01679  hypothetical protein  23.83 
 
 
252 aa  51.6  1e-05  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1920  protein of unknown function DUF481  23.83 
 
 
252 aa  51.6  1e-05  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302148  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01691  hypothetical protein  23.83 
 
 
252 aa  51.6  1e-05  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1424  putative outer membrane protein  25.97 
 
 
241 aa  51.2  2e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.284815  decreased coverage  0.000282683 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1844  putative outer membrane protein  25.97 
 
 
241 aa  51.2  2e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  4.76612e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2017  putative outer membrane protein  25.97 
 
 
241 aa  50.8  2e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.277986  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1441  hypothetical protein  25.97 
 
 
241 aa  51.2  2e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0990956  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1456  hypothetical protein  25.97 
 
 
241 aa  51.2  2e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.273825  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0708  hypothetical protein  21.43 
 
 
239 aa  50.4  3e-05  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0527  hypothetical protein  23.5 
 
 
346 aa  50.4  3e-05  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2051  hypothetical protein  22.58 
 
 
248 aa  50.1  4e-05  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  1.94447e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03209  putative orphan protein  25.24 
 
 
248 aa  49.7  5e-05  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000209719  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2440  hypothetical protein  23.4 
 
 
252 aa  48.9  9e-05  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.350144  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1967  hypothetical protein  23.4 
 
 
252 aa  48.9  9e-05  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1469  hypothetical protein  23.4 
 
 
252 aa  48.9  9e-05  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0334595  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1910  hypothetical protein  23.4 
 
 
252 aa  48.9  9e-05  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.155146  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1941  hypothetical protein  23.4 
 
 
252 aa  48.9  9e-05  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00616425  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1803  hypothetical protein  23.4 
 
 
252 aa  48.9  9e-05  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000450339  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1079  protein of unknown function DUF481  24.79 
 
 
249 aa  47.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0777  hypothetical protein  24.44 
 
 
245 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0484485  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3246  hypothetical protein  24.44 
 
 
245 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0192004  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3349  hypothetical protein  24.44 
 
 
245 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  2.36372e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3536  hypothetical protein  24.44 
 
 
245 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1182  hypothetical protein  23.23 
 
 
382 aa  45.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.155999 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3655  hypothetical protein  24.44 
 
 
245 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0652  hypothetical protein  23.25 
 
 
246 aa  43.9  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  3.54938e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0878  hypothetical protein  24.86 
 
 
254 aa  43.1  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.428575  normal  0.136015 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0934  hypothetical protein  23.56 
 
 
245 aa  43.1  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3223  hypothetical protein  22.97 
 
 
255 aa  42.7  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3461  protein of unknown function DUF481  24 
 
 
245 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0831  hypothetical protein  24 
 
 
245 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.221265  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3360  hypothetical protein  22.97 
 
 
255 aa  42.7  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.853104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>