More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0044 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0044  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
162 aa  333  4e-91  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1233  methyl-accepting chemotaxis protein  60.9 
 
 
166 aa  206  1e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1962  methyl-accepting chemotaxis protein  60.78 
 
 
166 aa  202  2e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0158  PAS sensor protein  58.17 
 
 
170 aa  196  9e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00559927  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1012  methyl-accepting chemotaxis protein  51.9 
 
 
171 aa  184  4e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.63093  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0368  PAS sensor protein  55.56 
 
 
168 aa  175  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.580475  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4975  putative PAS/PAC sensor protein  52.2 
 
 
178 aa  175  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161434  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4009  PAS  50.93 
 
 
172 aa  173  8e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0964  putative PAS domain signal transduction sensor protein  51.28 
 
 
163 aa  172  2e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.695373  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0963  putative PAS domain signal transduction sensor protein  50 
 
 
163 aa  171  4e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.598174  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1206  methyl-accepting chemotaxis protein  50 
 
 
164 aa  169  1e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1071  putative PAS/PAC sensor protein  50.31 
 
 
178 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1325  methyl-accepting chemotaxis protein  49.36 
 
 
164 aa  167  8e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0735034  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1204  methyl-accepting chemotaxis protein  48.15 
 
 
165 aa  166  1e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4662  putative PAS/PAC sensor protein  46.5 
 
 
168 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.193201 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2378  transcriptional regulator  50 
 
 
174 aa  166  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1323  methyl-accepting chemotaxis protein  48.15 
 
 
165 aa  166  1e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0540  methyl-accepting chemotaxis protein  49.08 
 
 
166 aa  166  2e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1393  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.86 
 
 
182 aa  164  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4977  putative PAS/PAC sensor protein  47.17 
 
 
177 aa  164  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13761  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1413  putative PAS/PAC sensor protein  45.86 
 
 
185 aa  162  2e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.026067  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1312  putative PAS/PAC sensor protein  44.94 
 
 
174 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.723682  normal  0.171791 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4683  putative PAS/PAC sensor protein  45.86 
 
 
173 aa  158  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4792  putative PAS/PAC sensor protein  43.04 
 
 
174 aa  158  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0920  putative PAS/PAC sensor protein  45.86 
 
 
170 aa  149  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.14 
 
 
174 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3403  PAS sensor protein  43.83 
 
 
189 aa  146  1e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263742  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05500  PAS domain S-box  42.94 
 
 
194 aa  144  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.414164  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2233  putative PAS/PAC sensor protein  39.88 
 
 
177 aa  141  4e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.17522 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3464  transcriptional regulator  40.74 
 
 
174 aa  138  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2936  putative PAS/PAC sensor protein  38.82 
 
 
201 aa  121  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178135  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1223  signal-transduction sensor protein  38.82 
 
 
189 aa  119  1e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.658782  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38670  aerotaxis sesnor; AerP  48.18 
 
 
313 aa  118  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2812  putative PAS/PAC sensor protein  44.35 
 
 
166 aa  117  5e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.494423  decreased coverage  3.24615e-07 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2525  putative PAS/PAC sensor protein  41.06 
 
 
208 aa  117  7e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0659487  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24380  aerotaxis receptor Aer  44.35 
 
 
567 aa  117  8e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0650163  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1521  putative PAS/PAC sensor protein  36.36 
 
 
228 aa  117  8e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.950455  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1522  PAS sensor protein  35.29 
 
 
225 aa  116  1e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.533099  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6942  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  43.41 
 
 
566 aa  116  2e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819674  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2984  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer, Pas/Pac sensor  44.26 
 
 
565 aa  114  7e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  45.76 
 
 
519 aa  113  1e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.982796  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4269  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  45.08 
 
 
556 aa  112  2e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3295  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.31 
 
 
519 aa  112  2e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1378  putative PAS/PAC sensor protein  37.75 
 
 
200 aa  112  2e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2920  aerotaxis sensor receptor  46.77 
 
 
549 aa  111  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0532  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.16 
 
 
523 aa  111  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0374128 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1902  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.35 
 
 
521 aa  110  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00326538  normal  0.948878 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0659  putative PAS/PAC sensor protein  42.62 
 
 
164 aa  110  6e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2113  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  45.53 
 
 
550 aa  110  6e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4027  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  41.46 
 
 
521 aa  110  8e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664053  normal  0.0821551 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2022  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  43.24 
 
 
748 aa  110  1e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4521  aerotaxis receptor, putative  41.46 
 
 
521 aa  109  1e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0729  PAS  40.5 
 
 
945 aa  110  1e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0635035  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  44.26 
 
 
543 aa  110  1e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112151 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1648  aerotaxis receptor  39.84 
 
 
521 aa  108  2e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1390  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.46 
 
 
534 aa  109  2e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1800  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40 
 
 
521 aa  109  2e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.258308  normal  0.504821 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2372  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  46.03 
 
 
579 aa  109  2e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2577  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  38.89 
 
 
524 aa  108  2e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1125  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.86 
 
 
532 aa  108  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1933  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  39.84 
 
 
598 aa  108  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3735  PAS  39.84 
 
 
521 aa  108  4e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.065462 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000496  methyl-accepting chemotaxis protein  43.18 
 
 
520 aa  107  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0232366  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44300  aerotaxis receptor Aer  40.87 
 
 
521 aa  107  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06258  hypothetical protein  43.65 
 
 
520 aa  107  7e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1220  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  42.98 
 
 
522 aa  107  8e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1150  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  42.98 
 
 
522 aa  107  8e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2726  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.84 
 
 
538 aa  107  9e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3770  aerotaxis receptor Aer  41.74 
 
 
521 aa  107  9e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1487  PAS domain-containing protein  40.52 
 
 
158 aa  106  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  1.33262e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3404  methyl-accepting chemotaxis protein  43.33 
 
 
522 aa  106  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1618  chemotaxis sensory transducer  40 
 
 
557 aa  106  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.126465 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2648  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  39.2 
 
 
520 aa  106  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1652  putative PAS/PAC sensor protein  43.8 
 
 
127 aa  106  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.129926  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3813  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  39.84 
 
 
521 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.629648  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1867  chemotaxis sensory transducer  44.76 
 
 
714 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.133032 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  42.15 
 
 
522 aa  105  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.737349  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1684  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  38.97 
 
 
525 aa  105  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1238  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.32 
 
 
522 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0615962  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0130  PAS sensor protein  40.16 
 
 
451 aa  105  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1282  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.32 
 
 
522 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.13527  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3073  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  41.32 
 
 
522 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.66485e-10 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3460  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.8 
 
 
520 aa  105  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0580  hypothetical protein  37.5 
 
 
407 aa  105  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.376144  hitchhiker  5.96414e-07 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  38.93 
 
 
551 aa  104  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.510218  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  45.71 
 
 
716 aa  104  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1294  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  42.61 
 
 
575 aa  103  7e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00873235 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3406  PAS  36.81 
 
 
521 aa  103  9e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387271  normal  0.671486 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0223  PAS  39.34 
 
 
1214 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0974  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.94 
 
 
532 aa  103  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.32 
 
 
522 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0176898 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2014  aerotaxis receptor  37.5 
 
 
521 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  40.32 
 
 
566 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3109  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.28 
 
 
522 aa  102  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1045  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  41.9 
 
 
564 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2111  aerotaxis receptor Aer-2  38.26 
 
 
521 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0317394 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3270  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.98 
 
 
532 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.415489  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1630  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  37.39 
 
 
521 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.814601 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0530  methyl-accepting chemotaxis protein  41.9 
 
 
569 aa  102  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.667624  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  38.26 
 
 
521 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.976535  normal  0.292811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>