228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0039 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0039  putative nucleotide-binding protein  100 
 
 
165 aa  326  1e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1649  putative nucleotide-binding protein  49.09 
 
 
165 aa  165  2e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1539  putative nucleotide-binding protein  47.88 
 
 
165 aa  163  1e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0092  protein of unknown function DUF520  49.09 
 
 
165 aa  160  7e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1664  putative nucleotide-binding protein  43.64 
 
 
165 aa  145  4e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1551  putative nucleotide-binding protein  43.03 
 
 
163 aa  129  1e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2804  protein of unknown function DUF520  40 
 
 
165 aa  128  3e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.72661e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0318  protein of unknown function DUF520  43.75 
 
 
161 aa  127  6e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1469  protein of unknown function DUF520  41.21 
 
 
164 aa  125  2e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0438378  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0290  hypothetical protein  41.88 
 
 
161 aa  125  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0423  putative nucleotide-binding protein  42.42 
 
 
163 aa  125  3e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1706  putative nucleotide-binding protein  43.48 
 
 
164 aa  125  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.280602  hitchhiker  0.00217335 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1583  putative nucleotide-binding protein  42.42 
 
 
163 aa  125  3e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0398  putative nucleotide-binding protein  42.42 
 
 
163 aa  124  4e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.167613  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3028  putative nucleotide-binding protein  44.1 
 
 
164 aa  124  4e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.208181  normal  0.91414 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0876  putative nucleotide-binding protein  43.03 
 
 
163 aa  124  8e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1539  putative nucleotide-binding protein  43.03 
 
 
163 aa  123  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0711  putative nucleotide-binding protein  42.42 
 
 
163 aa  121  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  3.20146e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2291  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 
163 aa  120  6e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  4.70515e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0033  putative nucleotide-binding protein  44.38 
 
 
161 aa  120  9e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1061  putative nucleotide-binding protein  42.42 
 
 
163 aa  117  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000318846  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1634  putative nucleotide-binding protein  38.75 
 
 
163 aa  115  2e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0454282 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1196  putative nucleotide-binding protein  38.12 
 
 
160 aa  115  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.699154  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4128  putative nucleotide-binding protein  41.21 
 
 
163 aa  115  4e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0402113  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2899  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 
161 aa  114  8e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1213  putative nucleotide-binding protein  40.61 
 
 
163 aa  113  1e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2826  putative nucleotide-binding protein  39.38 
 
 
161 aa  112  2e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.931729 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0094  putative nucleotide-binding protein  35.62 
 
 
162 aa  112  2e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1240  putative nucleotide-binding protein  40.61 
 
 
163 aa  111  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1081  putative nucleotide-binding protein  40.61 
 
 
163 aa  111  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1064  putative nucleotide-binding protein  40.61 
 
 
163 aa  111  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1059  putative nucleotide-binding protein  40.61 
 
 
163 aa  111  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1318  putative nucleotide-binding protein  40.61 
 
 
163 aa  111  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1273  putative nucleotide-binding protein  40.61 
 
 
163 aa  111  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.152949  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2420  putative nucleotide-binding protein  39.38 
 
 
161 aa  112  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1166  putative nucleotide-binding protein  40.61 
 
 
163 aa  111  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1080  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 
163 aa  111  4e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.240554  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1044  putative nucleotide-binding protein  41.25 
 
 
161 aa  111  4e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3058  putative nucleotide-binding protein  38.75 
 
 
163 aa  111  4e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.309078 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1927  putative nucleotide-binding protein  36.97 
 
 
166 aa  111  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0682804  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2549  putative nucleotide-binding protein  38.75 
 
 
161 aa  111  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0619  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 
161 aa  110  9e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0491781  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1846  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 
161 aa  109  1e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0633  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 
161 aa  110  1e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.897e-30 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2603  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 
161 aa  108  2e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1670  putative nucleotide-binding protein  38.12 
 
 
161 aa  109  2e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.502764  normal  0.473324 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1596  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 
161 aa  108  2e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.938712  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2760  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 
161 aa  109  2e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5887  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 
161 aa  108  2e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3206  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 
161 aa  108  2e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  9.32382e-06  hitchhiker  2.62338e-18 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2479  putative nucleotide-binding protein  37.5 
 
 
163 aa  108  2e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0562563  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0730  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 
161 aa  109  2e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2474  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 
161 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0278079 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4781  putative nucleotide-binding protein  39.38 
 
 
161 aa  108  4e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0520927  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3093  putative nucleotide-binding protein  41.25 
 
 
161 aa  108  4e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  9.35771e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3067  putative nucleotide-binding protein  38.12 
 
 
163 aa  107  5e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3247  putative nucleotide-binding protein  38.12 
 
 
163 aa  107  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3104  putative nucleotide-binding protein  38.12 
 
 
163 aa  107  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0717  putative nucleotide-binding protein  40.62 
 
 
161 aa  107  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.15495e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1071  putative nucleotide-binding protein  38.75 
 
 
161 aa  107  7e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2508  putative nucleotide-binding protein  38.75 
 
 
161 aa  107  7e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0915  putative nucleotide-binding protein  38.75 
 
 
161 aa  107  7e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885973  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0122  putative nucleotide-binding protein  38.75 
 
 
161 aa  107  7e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0919  putative nucleotide-binding protein  38.75 
 
 
161 aa  107  7e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1036  putative nucleotide-binding protein  38.75 
 
 
163 aa  107  7e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.448426  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0373  putative nucleotide-binding protein  38.75 
 
 
161 aa  107  7e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0673  putative nucleotide-binding protein  38.75 
 
 
161 aa  107  7e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0741  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 
161 aa  107  9e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0652  putative nucleotide-binding protein  37.13 
 
 
165 aa  107  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1084  putative nucleotide-binding protein  37.5 
 
 
163 aa  106  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.235952  hitchhiker  3.04548e-06 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1191  putative nucleotide-binding protein  36.88 
 
 
163 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.566237  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3769  putative nucleotide-binding protein  38.75 
 
 
161 aa  106  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2240  putative nucleotide-binding protein  39.38 
 
 
161 aa  105  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.065474  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2750  putative nucleotide-binding protein  39.38 
 
 
161 aa  106  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821102  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3198  putative nucleotide-binding protein  40.62 
 
 
161 aa  105  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0101  putative nucleotide-binding protein  36.25 
 
 
162 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.179816  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0959  putative nucleotide-binding protein  38.75 
 
 
161 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3039  hypothetical protein  39.13 
 
 
162 aa  105  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10690  hypothetical protein  33.33 
 
 
165 aa  104  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0100552  unclonable  1.13677e-09 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2177  putative nucleotide-binding protein  36.88 
 
 
161 aa  104  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.946938  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0095  putative nucleotide-binding protein  34.38 
 
 
162 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.615818  normal  0.24721 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3208  putative nucleotide-binding protein  38.12 
 
 
161 aa  104  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2585  putative nucleotide-binding protein  39.38 
 
 
160 aa  104  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358565  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3127  putative nucleotide-binding protein  37.58 
 
 
163 aa  104  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.266318  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2671  putative nucleotide-binding protein  36.25 
 
 
161 aa  103  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1944  putative nucleotide-binding protein  38.75 
 
 
161 aa  104  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.478874  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2579  putative nucleotide-binding protein  38.75 
 
 
161 aa  104  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2555  putative nucleotide-binding protein  38.75 
 
 
161 aa  104  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.354154  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4497  putative nucleotide-binding protein  38.75 
 
 
161 aa  103  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253922  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04811  putative nucleotide-binding protein  37.13 
 
 
165 aa  103  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4372  putative nucleotide-binding protein  39.13 
 
 
161 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0514431 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1352  putative nucleotide-binding protein  39.13 
 
 
161 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154119  normal  0.12708 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03091  putative nucleotide-binding protein  37.27 
 
 
172 aa  103  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0564  putative nucleotide-binding protein  37.89 
 
 
163 aa  103  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0754  putative nucleotide-binding protein  38.12 
 
 
161 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2033  hypothetical protein  39.13 
 
 
161 aa  103  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0112  putative nucleotide-binding protein  35.62 
 
 
162 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609186  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00374  nucleotide-binding protein  37.5 
 
 
163 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0498  putative nucleotide-binding protein  37.5 
 
 
163 aa  102  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0458  putative nucleotide-binding protein  37.5 
 
 
163 aa  102  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>