More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0037 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0037  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  100 
 
 
533 aa  1092  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.994153  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  46.23 
 
 
568 aa  431  1e-119  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0635  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  45.51 
 
 
566 aa  424  1e-117  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0393941  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  43.2 
 
 
567 aa  425  1e-117  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1995  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  43.2 
 
 
567 aa  418  1e-115  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0308  succinate dehydrogenase subunit A  42.64 
 
 
567 aa  416  1e-115  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.353372 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0284  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  42.34 
 
 
567 aa  402  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.947176 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0177  succinate dehydrogenase subunit A  43.54 
 
 
567 aa  403  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2717  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  43.14 
 
 
567 aa  400  1e-110  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  41.31 
 
 
568 aa  401  1e-110  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0127  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  42.41 
 
 
567 aa  397  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.864238  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2344  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  41.83 
 
 
567 aa  397  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0210  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  42.55 
 
 
579 aa  395  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1030  succinate dehydrogenase/fumarate reductase subunit A  40.71 
 
 
570 aa  379  1e-104  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.144954  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26940  succinate dehydrogenase subunit A  40.95 
 
 
572 aa  378  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.898505  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0312  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  40.04 
 
 
585 aa  376  1e-103  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0770  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  39.51 
 
 
593 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.130049 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0174  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  40.31 
 
 
542 aa  377  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0476634  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1309  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  39.7 
 
 
583 aa  377  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0985993  normal  0.361254 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05360  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.74 
 
 
595 aa  372  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0259373  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1129  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.08 
 
 
599 aa  373  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06180  succinate dehydrogenase subunit A  40.85 
 
 
570 aa  375  1e-102  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000256693 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04830  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.07 
 
 
595 aa  372  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13349  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.88 
 
 
590 aa  369  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1569  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.76 
 
 
575 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1254  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.84 
 
 
584 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6464  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.04 
 
 
583 aa  368  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.723061  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1245  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.84 
 
 
584 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.193625  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21330  succinate dehydrogenase subunit A  40.31 
 
 
591 aa  367  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2749  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.54 
 
 
612 aa  367  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1228  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.84 
 
 
584 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.394279  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1587  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.14 
 
 
584 aa  365  1e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.243588  normal  0.596865 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1202  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.6 
 
 
599 aa  365  1e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2111e-07 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2832  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  39.43 
 
 
609 aa  365  2e-99  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0155951  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1882  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.94 
 
 
575 aa  365  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.764609  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1856  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.94 
 
 
575 aa  365  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4846  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.66 
 
 
584 aa  363  6e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892416  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0785  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  40.41 
 
 
576 aa  362  1e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0679  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.04 
 
 
584 aa  360  2e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00348299  normal  0.0897043 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2952  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.72 
 
 
600 aa  360  3e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.090106  decreased coverage  0.000187391 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1687  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.15 
 
 
575 aa  360  3e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0263858 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2255  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  39.44 
 
 
584 aa  360  4e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.794625  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1873  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.91 
 
 
612 aa  360  5e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.864322  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3563  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.19 
 
 
612 aa  358  1e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0965  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.13 
 
 
583 aa  357  2e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.297334  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1184  succinate dehydrogenase subunit A  37.87 
 
 
584 aa  357  4e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1428  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.78 
 
 
602 aa  356  5e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0936  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.63 
 
 
612 aa  356  6e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002237  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.88 
 
 
599 aa  355  8e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00131  fumarate reductase flavoprotein subunit  37.5 
 
 
606 aa  355  1e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0170  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  39.58 
 
 
566 aa  355  2e-96  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1799  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  37.23 
 
 
601 aa  354  2e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0677  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.2 
 
 
566 aa  353  3e-96  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0486405  hitchhiker  6.05931e-05 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2788  fumarate reductase flavoprotein subunit  37.34 
 
 
617 aa  353  4e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2514  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  39.48 
 
 
585 aa  353  5e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.136164  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2108  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.89 
 
 
590 aa  353  6e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.018563  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6854  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.27 
 
 
591 aa  353  6e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.232059 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2323  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.08 
 
 
592 aa  352  7e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1437  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  39.96 
 
 
577 aa  352  7e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.217137  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25820  succinate dehydrogenase subunit A  38.46 
 
 
612 aa  352  8e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.722118  normal  0.667788 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5838  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.52 
 
 
591 aa  352  9e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4646  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.52 
 
 
591 aa  352  9e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303055  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2893  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.27 
 
 
591 aa  352  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4352  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  37.03 
 
 
601 aa  351  2e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.602613  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5588  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.27 
 
 
591 aa  351  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0760  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  37.29 
 
 
592 aa  351  2e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1776  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.83 
 
 
584 aa  351  2e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0576  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.25 
 
 
589 aa  351  2e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0595  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.25 
 
 
589 aa  351  2e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4363  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.27 
 
 
591 aa  351  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1015  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  39.08 
 
 
610 aa  350  3e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3691  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.27 
 
 
590 aa  350  3e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2474  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.2 
 
 
575 aa  350  3e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  5.57801e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44030  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.27 
 
 
590 aa  350  3e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.55 
 
 
598 aa  350  5e-95  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.62165  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3034  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  36.59 
 
 
597 aa  350  5e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2484  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.08 
 
 
592 aa  349  6e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.076646 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0459  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.39 
 
 
605 aa  349  7e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414111  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.97 
 
 
591 aa  349  8e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.373287  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3592  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.97 
 
 
591 aa  349  8e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322313  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2230  fumarate reductase flavoprotein subunit  36.95 
 
 
602 aa  349  8e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4431  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.97 
 
 
591 aa  349  8e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2007  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.7 
 
 
590 aa  348  1e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.82203  normal  0.426549 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1990  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.42 
 
 
609 aa  348  2e-94  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.902859  normal  0.104925 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0100  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.63 
 
 
616 aa  347  2e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.576611  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0488  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  38.42 
 
 
576 aa  348  2e-94  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.332185  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2202  succinate dehydrogenase subunit A  37.06 
 
 
602 aa  348  2e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.443729  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4278  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.67 
 
 
605 aa  348  2e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2168  succinate dehydrogenase subunit A  37.15 
 
 
596 aa  347  3e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.274751 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0463  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  38.22 
 
 
611 aa  347  3e-94  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0819  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.81 
 
 
609 aa  347  3e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2863  succinate dehydrogenase subunit A  36.43 
 
 
594 aa  347  3e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.41 
 
 
605 aa  347  3e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.609874  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.93 
 
 
578 aa  347  3e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0662  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.15 
 
 
591 aa  347  4e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.536777  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0258  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  39.62 
 
 
570 aa  346  5e-94  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.408248 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3894  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.41 
 
 
605 aa  346  5e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197251  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1215  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.06 
 
 
590 aa  346  6e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1869  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.78 
 
 
598 aa  346  7e-94  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.462567  normal  0.466053 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2362  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.49 
 
 
595 aa  346  8e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>