More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0033 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0033  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  100 
 
 
387 aa  796  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1905  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  69.79 
 
 
386 aa  562  1e-159  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.273133  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1578  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  54.45 
 
 
392 aa  428  1e-119  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000305256  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0558  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  54.12 
 
 
391 aa  430  1e-119  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1555  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  55.44 
 
 
388 aa  426  1e-118  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0829  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  55.84 
 
 
388 aa  425  1e-118  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1128  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  56.99 
 
 
388 aa  425  1e-118  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.55377  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1122  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  55.44 
 
 
388 aa  424  1e-117  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0097  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  52.84 
 
 
394 aa  414  1e-114  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2132  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  55 
 
 
393 aa  410  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000381873  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1686  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  55.38 
 
 
391 aa  407  1e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.10474  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2246  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  54.62 
 
 
393 aa  403  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1053  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  52.69 
 
 
393 aa  402  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.13017e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003700  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  53.85 
 
 
391 aa  402  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.497623  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0302  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  52.49 
 
 
392 aa  403  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  7.51651e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2767  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  53.35 
 
 
393 aa  398  1e-110  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0850  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  54.22 
 
 
393 aa  399  1e-110  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0148242  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2351  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  52.36 
 
 
393 aa  395  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.975631  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1929  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  54.32 
 
 
403 aa  395  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.268202  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1277  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  53.1 
 
 
393 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.05935  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3193  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  52.58 
 
 
392 aa  396  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  4.78447e-11  hitchhiker  1.55264e-21 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1966  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  54.72 
 
 
393 aa  398  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1783  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.42 
 
 
392 aa  393  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.163487 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1014  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  53.37 
 
 
393 aa  394  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1062  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  52.77 
 
 
393 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1634  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  52.09 
 
 
393 aa  393  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2097  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  52.07 
 
 
392 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.310007  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2079  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.42 
 
 
392 aa  393  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1941  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.42 
 
 
392 aa  394  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0549  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  53.37 
 
 
393 aa  394  1e-108  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4264  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  53.03 
 
 
393 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2447  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  52.09 
 
 
393 aa  393  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1338  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.42 
 
 
392 aa  392  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1468  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  53.1 
 
 
393 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2756  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  54.08 
 
 
393 aa  392  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.966815 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2242  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  53.87 
 
 
393 aa  394  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1241  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  52.07 
 
 
392 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39610  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  52.93 
 
 
393 aa  394  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2037  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  52.07 
 
 
392 aa  391  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2042  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  52.07 
 
 
392 aa  391  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.489284 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1457  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  52.77 
 
 
393 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.164878 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01808  hypothetical protein  51.42 
 
 
392 aa  393  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01820  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.42 
 
 
392 aa  393  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2584  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.42 
 
 
392 aa  394  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.303586  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2009  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.78 
 
 
400 aa  390  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3406  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.97 
 
 
393 aa  388  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630931  normal  0.629093 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2418  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  53.19 
 
 
392 aa  390  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1792  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.16 
 
 
392 aa  391  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00174349  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4162  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  52.41 
 
 
393 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24478 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1367  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  53.21 
 
 
393 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02115  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.79 
 
 
391 aa  389  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2124  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.9 
 
 
392 aa  389  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1366  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  52.07 
 
 
392 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  2.13864e-07 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0160  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.15 
 
 
392 aa  388  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000791072  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15890  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  53.21 
 
 
393 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.17999 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2807  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  53.81 
 
 
392 aa  387  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2478  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.13 
 
 
400 aa  387  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00049074  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04451  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  52.99 
 
 
400 aa  385  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1107  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  53.55 
 
 
395 aa  387  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.881865  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0871  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.15 
 
 
391 aa  386  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000494924  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2130  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  53.46 
 
 
392 aa  386  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2118  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.3 
 
 
392 aa  384  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0143  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.9 
 
 
392 aa  383  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2234  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.13 
 
 
396 aa  384  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.331336 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3291  Phosphoribosylaminoimidazole carboxylase  53.23 
 
 
399 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1834  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.04 
 
 
392 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.272244  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3197  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.16 
 
 
391 aa  379  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.862074 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3552  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.38 
 
 
399 aa  379  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.229559  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2087  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.38 
 
 
404 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3101  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.16 
 
 
391 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0775  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  53.08 
 
 
398 aa  379  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.486774  normal  0.246438 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3020  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.16 
 
 
391 aa  378  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.190979 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1390  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  53.08 
 
 
394 aa  381  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.833755  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1188  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  52.15 
 
 
404 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.265969  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3070  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.65 
 
 
396 aa  377  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.636645  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2474  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.5 
 
 
401 aa  377  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00530276  normal  0.239211 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1245  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50 
 
 
404 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.816462 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3301  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  49.49 
 
 
404 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225182  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0832  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.61 
 
 
404 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.815383  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2039  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.02 
 
 
400 aa  374  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0527923  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2342  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.34 
 
 
404 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0158257 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4678  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.53 
 
 
400 aa  372  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0318  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.61 
 
 
404 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0201005  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1349  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.61 
 
 
464 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.608306  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1035  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.61 
 
 
404 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.240382  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1196  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.61 
 
 
404 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.517415  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1922  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.61 
 
 
404 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.244182  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0979  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  51.61 
 
 
476 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2805  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  52.88 
 
 
392 aa  372  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0443312 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4045  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.38 
 
 
604 aa  370  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2358  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50 
 
 
404 aa  368  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.739555  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1688  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  54.08 
 
 
394 aa  370  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10891  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  49.86 
 
 
390 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.402968  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1707  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.54 
 
 
404 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0434  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  53.91 
 
 
394 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.298565  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2238  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50 
 
 
404 aa  368  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.335743  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0958  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.54 
 
 
404 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2023  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  54.08 
 
 
394 aa  370  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1820  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.64 
 
 
400 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00220765 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5661  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  50.27 
 
 
404 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.541626  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>