More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0023 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0023  DNA primase  100 
 
 
550 aa  1135  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1978  DNA primase  51.53 
 
 
552 aa  580  1e-164  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0795  DNA primase  40.97 
 
 
572 aa  426  1e-118  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2069  DNA primase  42.03 
 
 
554 aa  417  1e-115  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1745  DNA primase  38.61 
 
 
546 aa  377  1e-103  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1610  DNA primase  38.05 
 
 
548 aa  361  2e-98  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1497  DNA primase  38.58 
 
 
595 aa  341  2e-92  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1629  DNA primase  35.39 
 
 
614 aa  327  5e-88  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.332155  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1810  DNA primase  35.39 
 
 
605 aa  326  6e-88  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1998  DNA primase  35.18 
 
 
605 aa  325  1e-87  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  37.59 
 
 
598 aa  293  8e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  34.29 
 
 
614 aa  279  1e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  37.29 
 
 
598 aa  278  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  37.29 
 
 
571 aa  277  4e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  2.15576e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  37.29 
 
 
598 aa  276  5e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  37.29 
 
 
598 aa  276  5e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  37.29 
 
 
598 aa  276  6e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  37.29 
 
 
598 aa  276  6e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  9.94887e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  37.29 
 
 
598 aa  276  6e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  37.29 
 
 
598 aa  276  6e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.25124e-06  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  37.29 
 
 
598 aa  276  6e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  37.29 
 
 
598 aa  276  9e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  41.26 
 
 
601 aa  274  3e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  35.62 
 
 
599 aa  274  3e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  36.87 
 
 
600 aa  274  3e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  34.59 
 
 
539 aa  272  1e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4335  DNA primase  33.12 
 
 
585 aa  268  2e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  36.65 
 
 
595 aa  268  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2337  DNA primase  34.05 
 
 
583 aa  266  6e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1971  DNA primase  34.05 
 
 
583 aa  266  6e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0427766  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3942  DNA primase  35.84 
 
 
630 aa  266  7e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  33.06 
 
 
581 aa  265  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3256  DNA primase  34.08 
 
 
622 aa  264  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0530643 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  35.03 
 
 
660 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3782  DNA primase  33.88 
 
 
622 aa  263  7e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.18227  normal  0.0180999 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2205  DNA primase  35.1 
 
 
638 aa  262  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3885  DNA primase  34.55 
 
 
625 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.987209  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  33.47 
 
 
609 aa  261  2e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.33993e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4814  DNA primase  35.57 
 
 
636 aa  262  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6775  DNA primase  35.88 
 
 
623 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0278611 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3642  DNA primase  34.55 
 
 
625 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  34.81 
 
 
660 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  35.03 
 
 
660 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2821  DNA primase  36.51 
 
 
622 aa  261  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  35.7 
 
 
660 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1716  DNA primase  33.41 
 
 
626 aa  260  4e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2995  DNA primase  35.71 
 
 
575 aa  260  5e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0193814  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  34.61 
 
 
592 aa  260  6e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  33.54 
 
 
599 aa  259  9e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  35.15 
 
 
617 aa  259  1e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  31 
 
 
599 aa  258  1e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2833  DNA primase  32.28 
 
 
574 aa  258  1e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0310817  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  39.94 
 
 
645 aa  259  1e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  38.97 
 
 
605 aa  258  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4481  DNA primase  34.35 
 
 
800 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.135384  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  38.97 
 
 
605 aa  258  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  32.86 
 
 
604 aa  257  3e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2028  DNA primase  36.95 
 
 
603 aa  257  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0620  DNA primase  35.8 
 
 
625 aa  258  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  33.97 
 
 
614 aa  257  4e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  7.25747e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  37.29 
 
 
663 aa  257  4e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  33.8 
 
 
582 aa  257  4e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  36.3 
 
 
663 aa  256  5e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1519  DNA primase  35.8 
 
 
624 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2385  DNA primase  35.8 
 
 
624 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2526  DNA primase  35.8 
 
 
624 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1712  DNA primase  35.8 
 
 
624 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  35.19 
 
 
582 aa  257  5e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.22663e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0338  DNA primase  35.8 
 
 
624 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  35.19 
 
 
582 aa  257  5e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  9.55759e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  35.19 
 
 
582 aa  257  5e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  1.95537e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0372  DNA primase  35.8 
 
 
624 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0834  DNA primase  35.8 
 
 
624 aa  257  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1345  DNA primase  30.92 
 
 
595 aa  256  6e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  36.34 
 
 
655 aa  256  6e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  36.91 
 
 
664 aa  256  7e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  33.84 
 
 
605 aa  256  9e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  38.95 
 
 
617 aa  255  1e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0527  DNA primase  39.2 
 
 
578 aa  254  2e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2421  DNA primase  36.72 
 
 
603 aa  254  2e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  35.85 
 
 
577 aa  254  3e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  30.23 
 
 
573 aa  254  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  33.95 
 
 
581 aa  254  3e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  33.95 
 
 
581 aa  254  3e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  2.2434e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  36.24 
 
 
613 aa  254  3e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  33.95 
 
 
581 aa  254  3e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  33.95 
 
 
581 aa  254  3e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  5.06976e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  33.95 
 
 
581 aa  254  3e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  4.92318e-09  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0887  DNA primase  35.48 
 
 
604 aa  254  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.612944  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  33.95 
 
 
581 aa  254  3e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.61356e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  37.77 
 
 
598 aa  254  4e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  34.99 
 
 
636 aa  254  4e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2387  DNA primase  37.09 
 
 
565 aa  253  6e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  33.95 
 
 
581 aa  253  6e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  5.65097e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0323  DNA primase  37.2 
 
 
579 aa  253  9e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.119133 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1224  DNA primase  31.54 
 
 
564 aa  252  1e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.533717  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  32.83 
 
 
601 aa  252  1e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  34.69 
 
 
605 aa  251  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0659  DNA primase  36.32 
 
 
583 aa  251  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.250836  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2561  DNA primase  40.85 
 
 
598 aa  251  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296311 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>