57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0017 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0017  thymidylate synthase complementing protein ThyX  100 
 
 
277 aa  577  1e-164  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1762  FAD-dependent thymidylate synthase  24.71 
 
 
206 aa  83.2  4e-15  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0011  FAD-dependent thymidylate synthase  26.64 
 
 
210 aa  83.2  5e-15  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0028  FAD-dependent thymidylate synthase  25.19 
 
 
207 aa  82.8  6e-15  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0026  FAD-dependent thymidylate synthase  25.19 
 
 
207 aa  82.4  7e-15  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0053  FAD-dependent thymidylate synthase  25.19 
 
 
207 aa  82.4  7e-15  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1800  FAD-dependent thymidylate synthase  26.15 
 
 
206 aa  80.1  3e-14  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0219748  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1861  FAD-dependent thymidylate synthase  25.58 
 
 
218 aa  80.1  3e-14  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.224616  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2063  FAD-dependent thymidylate synthase  25.38 
 
 
235 aa  78.2  1e-13  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.828676  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0001  thymidylate synthase, flavin-dependent  25.68 
 
 
204 aa  70.9  2e-11  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.248117  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0195  FAD-dependent thymidylate synthase  25.26 
 
 
246 aa  59.7  6e-08  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00699129  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2735  FAD-dependent thymidylate synthase  24.15 
 
 
245 aa  57.8  2e-07  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2421  FAD-dependent thymidylate synthase  24.15 
 
 
245 aa  57.4  2e-07  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0588955  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0189  FAD-dependent thymidylate synthase  23.51 
 
 
245 aa  53.9  3e-06  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.125611  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25280  FAD-dependent thymidylate synthase  26.06 
 
 
250 aa  53.9  3e-06  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0348718  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3530  prophage LambdaBa01, thymidylate synthase-complementing protein  25.31 
 
 
257 aa  53.1  4e-06  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537663  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3813  prophage LambdaBa01, thymidylate synthase-complementing protein  25.31 
 
 
252 aa  53.5  4e-06  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17838  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3445  thymidylate synthase  25.1 
 
 
253 aa  53.1  5e-06  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.277161  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5811  FAD-dependent thymidylate synthase  24.23 
 
 
250 aa  52  9e-06  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2189  thymidylate synthase, flavin-dependent  22.06 
 
 
250 aa  51.6  1e-05  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3449  thymidylate synthase, flavin-dependent  24.69 
 
 
248 aa  52  1e-05  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354216  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2102  FAD-dependent thymidylate synthase  23.94 
 
 
254 aa  51.2  2e-05  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.213601 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2161  FAD-dependent thymidylate synthase  23.24 
 
 
254 aa  51.2  2e-05  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.298336  normal  0.459496 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2482  thymidylate synthase complementing protein ThyX  25.27 
 
 
232 aa  51.6  2e-05  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  4.21387e-07  hitchhiker  0.00846096 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2115  FAD-dependent thymidylate synthase  23.24 
 
 
254 aa  51.2  2e-05  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4001  FAD-dependent thymidylate synthase  23.77 
 
 
250 aa  50.4  3e-05  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0999655 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12767  FAD-dependent thymidylate synthase  23.36 
 
 
250 aa  50.4  3e-05  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1027  FAD-dependent thymidylate synthase  23.83 
 
 
230 aa  50.1  4e-05  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00194248  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2633  thymidylate synthase (FAD)  23.65 
 
 
262 aa  49.7  5e-05  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0928647  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3547  FAD-dependent thymidylate synthase  23.17 
 
 
265 aa  49.7  5e-05  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.583534  normal  0.337603 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0523  thymidylate synthase, flavin-dependent  23.33 
 
 
237 aa  49.7  6e-05  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2792  FAD-dependent thymidylate synthase  26 
 
 
285 aa  49.7  6e-05  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2649  FAD-dependent thymidylate synthase  23.96 
 
 
245 aa  49.3  8e-05  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  3.29367e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2386  FAD-dependent thymidylate synthase  22.36 
 
 
250 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0115404 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0173  thymidylate synthase, flavin-dependent  24.48 
 
 
230 aa  48.9  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  3.07587e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4274  thymidylate synthase flavin-dependent  22.83 
 
 
250 aa  47.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.933149  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2353  thymidylate synthase complementing protein ThyX  25.67 
 
 
233 aa  47  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.431052  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1346  FAD-dependent thymidylate synthase  24.71 
 
 
247 aa  46.6  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2401  decreased coverage  4.13782e-05 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2044  FAD-dependent thymidylate synthase  26.15 
 
 
263 aa  46.6  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  3.90103e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09250  thymidylate synthase (FAD)  23.62 
 
 
226 aa  46.2  0.0006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0981097  normal  0.0643636 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0772  thymidylate synthase, flavin-dependent  23.86 
 
 
258 aa  46.2  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1689  thymidylate synthase, flavin-dependent  28.87 
 
 
260 aa  46.2  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.179029 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3206  FAD-dependent thymidylate synthase  21.62 
 
 
243 aa  45.8  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.200528 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2472  thymidylate synthase, flavin-dependent  21.92 
 
 
284 aa  45.8  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  4.36575e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0802  thymidylate synthase, flavin-dependent  24.47 
 
 
218 aa  45.4  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000150033  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20020  thymidylate synthase (FAD)  22.16 
 
 
226 aa  45.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.886241 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2693  FAD-dependent thymidylate synthase  22.69 
 
 
228 aa  45.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.28347e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0404  thymidylate synthase, flavin-dependent  29.23 
 
 
223 aa  44.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0128021  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1265  thymidylate synthase, flavin-dependent  24.63 
 
 
195 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3806  FAD-dependent thymidylate synthase  21.47 
 
 
229 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3898  thymidylate synthase, flavin-dependent  37.5 
 
 
216 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.262304 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3494  thymidylate synthase, flavin-dependent  25.32 
 
 
226 aa  43.9  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1388  FAD-dependent thymidylate synthase  23.94 
 
 
247 aa  43.9  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0378  FAD-dependent thymidylate synthase  22.51 
 
 
231 aa  43.5  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.06523e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1387  thymidylate synthase complementing protein ThyX  23.05 
 
 
269 aa  43.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0493208  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2321  FAD-dependent thymidylate synthase  20.21 
 
 
248 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.294658  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1297  thymidylate synthase, flavin-dependent  27.84 
 
 
260 aa  42.4  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>