More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0012 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0012  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  100 
 
 
306 aa  635  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  60.21 
 
 
290 aa  355  4e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  55.44 
 
 
287 aa  346  3e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  56.74 
 
 
338 aa  345  5e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0905  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  57.5 
 
 
284 aa  342  5e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1371  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  57.3 
 
 
334 aa  340  2e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.896786  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  55.18 
 
 
334 aa  339  3e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  53.8 
 
 
333 aa  335  5e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0746  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  54.74 
 
 
286 aa  309  3e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  3.7264e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2825  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  51.06 
 
 
289 aa  307  1e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1456  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  52 
 
 
284 aa  307  2e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0102824  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  52 
 
 
284 aa  306  2e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2977  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.35 
 
 
289 aa  302  4e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1949  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.69 
 
 
351 aa  295  7e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200432  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1591  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.15 
 
 
305 aa  273  3e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2506  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.48 
 
 
300 aa  267  1e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2636  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.86 
 
 
301 aa  260  3e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000411372  normal  0.0277902 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2435  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.21 
 
 
301 aa  257  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.759859 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1857  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.86 
 
 
301 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2184  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.06 
 
 
301 aa  255  5e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1891  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.86 
 
 
302 aa  255  6e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1488  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.6 
 
 
305 aa  254  1e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1884  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.86 
 
 
301 aa  254  1e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2261  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.71 
 
 
301 aa  254  1e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2393  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.71 
 
 
301 aa  253  2e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1754  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.26 
 
 
301 aa  253  2e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229998  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2304  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.1 
 
 
301 aa  252  4e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2588  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.01 
 
 
301 aa  251  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1991  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  41.84 
 
 
309 aa  244  2e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.145028 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2948  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  34.77 
 
 
322 aa  179  5e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0501  peptide methionine sulfoxide reductase  55.33 
 
 
173 aa  179  5e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0754  methionine sulfoxide reductase B  69.64 
 
 
169 aa  169  7e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.192538  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1130  methionine sulfoxide reductase B  68.1 
 
 
119 aa  168  1e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1255  methionine sulfoxide reductase B  67.24 
 
 
119 aa  167  2e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0609  methionine sulfoxide reductase B  67.24 
 
 
119 aa  167  2e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  33.78 
 
 
311 aa  162  5e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0688  methionine sulfoxide reductase B  62.71 
 
 
159 aa  161  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2423  methionine sulfoxide reductase B  61.16 
 
 
122 aa  160  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.55047  normal  0.248958 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1464  methionine-R-sulfoxide reductase  57.76 
 
 
121 aa  152  8e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0263105  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2731  Peptide-methionine (R)-S-oxide reductase  63.64 
 
 
120 aa  151  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.98889e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  46.5 
 
 
185 aa  149  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1056  methionine sulfoxide reductase B  57.76 
 
 
124 aa  149  5e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.690057  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1028  peptide methionine sulfoxide reductase  60.18 
 
 
124 aa  149  5e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.589309  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2452  methionine sulfoxide reductase A  46.41 
 
 
158 aa  147  3e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  45.45 
 
 
178 aa  145  6e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  44.23 
 
 
178 aa  145  7e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  41.32 
 
 
197 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  42.95 
 
 
180 aa  144  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  44.83 
 
 
208 aa  144  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0271  peptide methionine sulfoxide reductase  41.9 
 
 
201 aa  144  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453594  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  41.77 
 
 
180 aa  143  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1308  peptide methionine sulfoxide reductase  41.56 
 
 
184 aa  140  2e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  42.5 
 
 
228 aa  140  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2075  methionine sulfoxide reductase A  42.21 
 
 
175 aa  140  4e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  45.45 
 
 
210 aa  139  4e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.306837  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2085  peptide methionine sulfoxide reductase  42.95 
 
 
179 aa  139  6e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1055  peptide methionine sulfoxide reductase  40.13 
 
 
178 aa  138  1e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.300876  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0725  peptide methionine sulfoxide reductase  41.61 
 
 
186 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.253534 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  42.94 
 
 
266 aa  138  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  42.14 
 
 
186 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.995502 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2619  peptide methionine sulfoxide reductase  42.14 
 
 
186 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.79029  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3422  peptide methionine sulfoxide reductase  45.1 
 
 
220 aa  136  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08631  peptide methionine sulfoxide reductase  39.49 
 
 
179 aa  136  5e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.442698  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4335  peptide methionine sulfoxide reductase  42.95 
 
 
162 aa  136  5e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0394  peptide methionine sulfoxide reductase  43.23 
 
 
177 aa  135  7e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1937  peptide methionine sulfoxide reductase  43.12 
 
 
246 aa  135  7e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  40.26 
 
 
182 aa  134  1e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0995  peptide methionine sulfoxide reductase  46.26 
 
 
150 aa  135  1e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.760428 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  42 
 
 
176 aa  135  1e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  40.13 
 
 
181 aa  135  1e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3782  methionine sulfoxide reductase A  42.28 
 
 
165 aa  134  2e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5903  protein-methionine-S-oxide reductase  40.25 
 
 
199 aa  134  2e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1960  peptide methionine sulfoxide reductase  39.75 
 
 
186 aa  134  2e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.723901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2571  peptide methionine sulfoxide reductase  39.75 
 
 
186 aa  134  2e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0652  peptide methionine sulfoxide reductase  39.47 
 
 
158 aa  134  2e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0153224  normal  0.157322 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  40.96 
 
 
225 aa  134  2e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  39.26 
 
 
209 aa  133  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  40.26 
 
 
180 aa  133  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1080  peptide methionine sulfoxide reductase  41.83 
 
 
164 aa  133  4e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.197554  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2595  peptide methionine sulfoxide reductase  39.13 
 
 
186 aa  133  4e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2276  peptide methionine sulfoxide reductase  41.1 
 
 
165 aa  133  4e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1329  Methionine sulfoxide reductase B  53.04 
 
 
148 aa  132  5e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.397039  normal  0.253282 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3429  peptide methionine sulfoxide reductase  42.33 
 
 
262 aa  132  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.737343  normal  0.0264207 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2709  methionine sulfoxide reductase A  44.97 
 
 
162 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  37.5 
 
 
183 aa  132  6e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0812  methionine sulfoxide reductase A  39.24 
 
 
180 aa  132  7e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2572  peptide methionine sulfoxide reductase  41.21 
 
 
223 aa  132  9e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3077  peptide methionine sulfoxide reductase  39.61 
 
 
177 aa  132  1e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  40.13 
 
 
184 aa  131  1e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2815  methionine sulfoxide reductase A  42.38 
 
 
181 aa  131  1e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0725435  normal  0.0472359 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1542  methionine-R-sulfoxide reductase  55.26 
 
 
148 aa  131  1e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.275961 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  42.68 
 
 
228 aa  131  1e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3916  methionine-R-sulfoxide reductase  55.08 
 
 
136 aa  131  2e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.158974  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1043  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  45.1 
 
 
416 aa  130  2e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.734062 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0240  peptide methionine sulfoxide reductase  40.65 
 
 
177 aa  131  2e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0714  peptide methionine sulfoxide reductase  38.1 
 
 
277 aa  130  2e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168728  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  37.97 
 
 
184 aa  130  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1895  methionine-R-sulfoxide reductase  54.7 
 
 
146 aa  130  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1427  peptide methionine sulfoxide reductase  45.7 
 
 
416 aa  130  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.208524  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2205  methionine-R-sulfoxide reductase  56.78 
 
 
136 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.346022  normal  0.461417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>