More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0006 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1483  GTP-binding protein TypA  54.32 
 
 
608 aa  661  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0019  GTP-binding protein TypA  52.41 
 
 
605 aa  646  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.664015  normal  0.72367 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3915  GTP-binding protein TypA  55.15 
 
 
609 aa  674  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4880  GTP-binding protein TypA  52.58 
 
 
607 aa  641  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131447 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0293  GTP-binding protein TypA  54.74 
 
 
607 aa  671  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0644132  hitchhiker  1.10369e-05 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1124  GTP-binding protein TypA/BipA  72.62 
 
 
600 aa  907  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.143451  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4394  GTP-binding protein  52.4 
 
 
607 aa  650  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4098  GTP-binding protein  52.4 
 
 
607 aa  650  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00590  GTPase  52.91 
 
 
609 aa  649  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0948  GTP-binding protein  54.58 
 
 
602 aa  665  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2046  GTP-binding protein TypA/BipA  73.29 
 
 
600 aa  913  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0433299  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1757  GTP-binding protein TypA/BipA  70.67 
 
 
602 aa  876  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10011  tyrosine binding protein  54.55 
 
 
599 aa  641  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0312  GTP-binding protein TypA  54.58 
 
 
603 aa  662  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3484  GTP-binding protein TypA  54.65 
 
 
608 aa  657  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  2.44002e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4642  GTP-binding protein TypA  54.65 
 
 
603 aa  673  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.787157  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0420  GTP-binding protein TypA  51.83 
 
 
606 aa  636  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.710155 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4256  GTP-binding protein  52.4 
 
 
607 aa  650  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.953086 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4145  GTP-binding protein  52.4 
 
 
607 aa  650  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.342274 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4188  GTP-binding protein TypA  53.23 
 
 
607 aa  655  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5096  GTP-binding protein TypA  51.5 
 
 
606 aa  635  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  55.26 
 
 
606 aa  681  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  5.61063e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3782  GTP-binding protein TypA  51.82 
 
 
614 aa  654  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00018087  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0032  GTP-binding protein TypA/BipA  53.23 
 
 
607 aa  655  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1063  GTP-binding protein TypA/BipA  54.58 
 
 
602 aa  664  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1748  GTP-binding protein TypA  54.98 
 
 
608 aa  668  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846744  normal  0.0136263 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0028  GTP-binding protein TypA/BipA  53.23 
 
 
607 aa  655  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0053  GTP-binding protein TypA  73.62 
 
 
602 aa  916  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08221  tyrosine binding protein  54.34 
 
 
598 aa  642  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.848748  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  54.82 
 
 
608 aa  667  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  54.65 
 
 
608 aa  666  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  54.65 
 
 
608 aa  666  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0307  GTP-binding protein TypA  54.58 
 
 
609 aa  662  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0237117  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  56.07 
 
 
614 aa  686  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  4.78233e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  54.82 
 
 
608 aa  667  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07981  tyrosine binding protein  54.47 
 
 
598 aa  639  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.633904 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08211  tyrosine binding protein  54.78 
 
 
600 aa  641  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.96814  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08241  tyrosine binding protein  54.1 
 
 
598 aa  642  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0077  GTP-binding protein TypA  73.46 
 
 
602 aa  915  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3553  GTP-binding protein TypA  55.74 
 
 
607 aa  682  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.718809  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1224  GTP-binding protein TypA  52.99 
 
 
605 aa  639  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0413  GTP-binding protein TypA  54.91 
 
 
603 aa  668  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2658  GTP-binding protein TypA  52.07 
 
 
614 aa  664  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0030836  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0308  GTP-binding protein TypA  54.58 
 
 
609 aa  662  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196053  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5850  GTP-binding protein TypA/BipA  53.65 
 
 
605 aa  662  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0948932  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0738  GTP-binding protein TypA  54.56 
 
 
606 aa  654  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1191  GTP-binding protein TypA  51.75 
 
 
615 aa  652  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0472002  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0380  GTP-binding protein TypA  53.95 
 
 
615 aa  658  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  2.38787e-05  hitchhiker  1.36232e-06 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0637  GTP-binding protein TypA  51.58 
 
 
614 aa  637  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  1.55128e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1169  GTP-binding protein TypA  51.75 
 
 
615 aa  652  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0173416  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  55.87 
 
 
599 aa  679  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  4.75691e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2316  GTP-binding protein TypA  53.58 
 
 
609 aa  644  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4138  GTP-binding protein TypA  52.9 
 
 
606 aa  650  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.781613  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  54.82 
 
 
608 aa  667  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1429  GTP-binding protein TypA  54.15 
 
 
608 aa  658  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4378  GTP-binding protein TypA  56.34 
 
 
596 aa  649  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1217  GTP-binding protein TypA  54.88 
 
 
606 aa  675  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0969  GTP-binding protein TypA  54.31 
 
 
613 aa  661  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45830  small GTP-binding protein TypA  53.4 
 
 
606 aa  657  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1516  GTP-binding protein TypA  72.95 
 
 
602 aa  909  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0732  GTP-binding protein TypA  54.79 
 
 
616 aa  672  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3148  GTP-binding protein TypA  54.42 
 
 
605 aa  666  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284484  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1471  GTP-binding protein TypA  56.17 
 
 
605 aa  689  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.885287  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1716  GTP-binding protein TypA  53.94 
 
 
596 aa  638  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0151298  hitchhiker  0.00768442 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2726  GTP-binding protein TypA  56.28 
 
 
610 aa  682  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.16376e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3971  GTP-binding protein TypA  52.15 
 
 
614 aa  663  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1181  GTP-binding protein TypA  52.15 
 
 
614 aa  662  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.15687  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3958  GTP-binding protein TypA  52.4 
 
 
607 aa  644  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.41781  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03705  hypothetical protein  52.4 
 
 
607 aa  650  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4155  GTP-binding protein TypA  52.74 
 
 
607 aa  650  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.785099  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0204  GTP-binding protein TypA  54.17 
 
 
605 aa  685  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.672165  normal  0.152752 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2472  GTP-binding protein TypA  55.33 
 
 
603 aa  697  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0692  GTP-binding protein TypA  57.31 
 
 
604 aa  709  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2287  GTP-binding protein TypA  75.13 
 
 
599 aa  925  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001903  GTP-binding protein TypA/BipA  52.41 
 
 
609 aa  641  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00233609  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0383  GTP-binding protein TypA  53.3 
 
 
613 aa  659  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4502  GTP-binding protein TypA  52.41 
 
 
607 aa  647  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.622829  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1843  GTP-binding protein TypA  53.12 
 
 
614 aa  655  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4241  GTP-binding protein TypA  55.48 
 
 
597 aa  650  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.972345  hitchhiker  0.000558258 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0491  GTP-binding protein TypA  55.09 
 
 
601 aa  681  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.65728e-05 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4219  GTP-binding protein TypA  52.74 
 
 
607 aa  647  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2740  GTP-binding protein TypA  54.17 
 
 
605 aa  654  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3551  GTP-binding protein TypA  56.51 
 
 
597 aa  659  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119172 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4290  GTP-binding protein  52.57 
 
 
607 aa  647  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.40714  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0953  GTP-binding protein TypA  52.08 
 
 
608 aa  643  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1536  GTP-binding protein TypA  52.61 
 
 
608 aa  648  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00994584  normal  0.0110769 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0936  GTP-binding protein TypA  53.28 
 
 
608 aa  656  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3441  GTP-binding protein TypA  54.76 
 
 
600 aa  683  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0896  GTP-binding protein TypA  52.41 
 
 
608 aa  649  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0560855  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0213  GTP-binding protein TypA  55.29 
 
 
608 aa  676  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1126  GTP-binding protein TypA  54.88 
 
 
606 aa  674  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.563047 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1639  GTP-binding protein TypA  53.32 
 
 
608 aa  654  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787477  normal  0.0390195 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4347  GTP-binding protein  52.4 
 
 
607 aa  650  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0573  GTP-binding protein TypA  52.33 
 
 
612 aa  639  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.179658 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4336  GTP-binding protein  52.57 
 
 
607 aa  647  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4219  GTP-binding protein  52.57 
 
 
607 aa  647  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01592  BipA protein  54.41 
 
 
610 aa  664  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4202  GTP-binding protein TypA  55.48 
 
 
597 aa  650  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4059  GTP-binding protein TypA  52.15 
 
 
614 aa  663  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124295  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0312  GTP-binding protein TypA  54.58 
 
 
603 aa  662  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>