More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0006 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03756  GTP-binding protein  52.4 
 
 
607 aa  650    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4115  GTP-binding protein TypA  52.4 
 
 
607 aa  650    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  55.54 
 
 
598 aa  689    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2658  GTP-binding protein TypA  52.07 
 
 
614 aa  664    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0030836  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3415  virulence regulator BipA  55.15 
 
 
604 aa  681    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.349187 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0696  GTP-binding protein TypA  52.07 
 
 
615 aa  659    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2852  GTP-binding protein TypA  54.58 
 
 
606 aa  676    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011881  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  54.65 
 
 
608 aa  666    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1296  GTP-binding elongation factor protein  54.55 
 
 
606 aa  669    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.609673  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4003  GTP-binding protein TypA  52.15 
 
 
614 aa  663    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1191  GTP-binding protein TypA  51.75 
 
 
615 aa  652    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0472002  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0038  GTP-binding protein TypA  73.62 
 
 
602 aa  917    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368844  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0473  elongation factor Tu family protein  52.25 
 
 
613 aa  640    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  54.82 
 
 
608 aa  667    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4408  virulence regulator BipA  54.91 
 
 
603 aa  666    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0361  GTP-binding protein TypA  51.9 
 
 
606 aa  639    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3868  GTP-binding protein TypA  52.15 
 
 
614 aa  663    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3701  GTP-binding protein  52.15 
 
 
614 aa  663    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000145642  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3483  GTP-binding virulence regulator protein BipA  53.41 
 
 
607 aa  649    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.325344 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3716  GTP-binding protein  52.15 
 
 
614 aa  662    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  54.82 
 
 
608 aa  667    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2875  hypothetical protein  52.25 
 
 
608 aa  651    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2737  hypothetical protein  52.25 
 
 
608 aa  651    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1757  GTP-binding protein TypA/BipA  70.67 
 
 
602 aa  876    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0339  putative regulatory protein TypA or elongation factor Tu  52.14 
 
 
615 aa  645    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.597633  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1998  GTP-binding protein TypA  54.79 
 
 
613 aa  678    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.472185  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0166  GTP-binding protein TypA  54.64 
 
 
598 aa  641    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0168881  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2021  GTP-binding protein TypA  54.3 
 
 
606 aa  661    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487667  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0077  GTP-binding protein TypA  73.46 
 
 
602 aa  915    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0772  GTP-binding protein TypA  54.71 
 
 
610 aa  692    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08221  tyrosine binding protein  54.34 
 
 
598 aa  642    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.848748  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0763  small GTP-binding protein domain-containing protein  56.51 
 
 
596 aa  645    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  54.82 
 
 
608 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0720  GTP-binding protein TypA  53.81 
 
 
609 aa  661    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000568805  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0347  GTP-binding protein TypA  52.07 
 
 
606 aa  648    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0380  GTP-binding protein TypA  53.95 
 
 
615 aa  658    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238787  hitchhiker  0.00000136232 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  57.93 
 
 
602 aa  719    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4648  GTP-binding protein TypA  54.32 
 
 
608 aa  660    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0457537  normal  0.313247 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1424  GTP-binding protein TypA  52.25 
 
 
610 aa  654    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1236  GTP-binding protein TypA  54.44 
 
 
600 aa  640    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.292914  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1518  GTP-binding protein TypA  52.75 
 
 
608 aa  655    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.678291  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1243  GTP-binding protein TypA  54.44 
 
 
602 aa  640    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.590892 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  55.54 
 
 
598 aa  691    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  54.42 
 
 
601 aa  679    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0169  GTP-binding protein TypA  54.59 
 
 
607 aa  666    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4166  GTP-binding protein TypA  52.15 
 
 
614 aa  663    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00701473  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0006  GTP-binding protein TypA  100 
 
 
600 aa  1224    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0770  tyrosine binding protein  54.01 
 
 
598 aa  645    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1525  GTP-binding protein TypA  54.62 
 
 
597 aa  638    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490404 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  53.42 
 
 
603 aa  669    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2316  GTP-binding protein TypA  53.58 
 
 
609 aa  644    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0770  GTP-binding protein TypA  53.55 
 
 
603 aa  668    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.872449  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1894  GTP-binding protein TypA  54.86 
 
 
592 aa  673    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00474713  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  55.48 
 
 
608 aa  671    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4378  GTP-binding protein TypA  56.34 
 
 
596 aa  649    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0053  GTP-binding protein TypA  73.62 
 
 
602 aa  916    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  56.07 
 
 
614 aa  686    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1169  GTP-binding protein TypA  51.75 
 
 
615 aa  652    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0173416  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0013  GTP-binding protein TypA/BipA  73.12 
 
 
602 aa  908    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08211  tyrosine binding protein  54.78 
 
 
600 aa  641    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.96814  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5850  GTP-binding protein TypA/BipA  53.65 
 
 
605 aa  662    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0948932  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3553  GTP-binding protein TypA  55.74 
 
 
607 aa  682    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.718809  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0511  regulatory protein TypA  53.74 
 
 
608 aa  640    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  54.82 
 
 
608 aa  667    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1259  GTP-binding protein TypA  55.26 
 
 
602 aa  684    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.273411 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0738  GTP-binding protein TypA  54.56 
 
 
606 aa  654    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2813  GTP-binding protein TypA  53.32 
 
 
608 aa  653    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.472576 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3455  GTP-binding protein TypA  55.24 
 
 
603 aa  669    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000132117  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1224  GTP-binding protein TypA  52.99 
 
 
605 aa  639    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  54.65 
 
 
608 aa  666    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  54.82 
 
 
608 aa  667    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0373  GTP-binding protein TypA  51.81 
 
 
615 aa  640    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0554499  normal  0.0314222 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2024  GTP-binding protein TypA  53.82 
 
 
607 aa  651    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.213403 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4404  GTP-binding protein TypA  51.59 
 
 
605 aa  644    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0864  GTP-binding protein TypA  54.65 
 
 
593 aa  645    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  55.87 
 
 
599 aa  679    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0637  GTP-binding protein TypA  51.58 
 
 
614 aa  637    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000155128  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1027  GTP-binding protein TypA  54.32 
 
 
608 aa  661    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1024  GTP-binding protein TypA  53.51 
 
 
623 aa  651    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07981  tyrosine binding protein  54.47 
 
 
598 aa  639    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.633904 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0028  GTP-binding protein TypA/BipA  53.23 
 
 
607 aa  655    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  57.24 
 
 
610 aa  687    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  57.41 
 
 
610 aa  686    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0307  GTP-binding protein TypA  54.58 
 
 
609 aa  662    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0237117  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4442  GTP-binding protein TypA  55.99 
 
 
596 aa  657    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0306  GTP-binding protein TypA  54.91 
 
 
603 aa  667    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.562357  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3718  GTP-binding protein TypA  54.91 
 
 
603 aa  667    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0941  GTP-binding protein TypA  55.67 
 
 
602 aa  686    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0324  GTP-binding protein TypA  53.91 
 
 
603 aa  654    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000010951  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0339  GTP-binding protein TypA  54.58 
 
 
608 aa  674    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0649933 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1389  GTP-binding protein TypA  54.15 
 
 
608 aa  658    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67560  GTP-binding protein TypA/BipA  53.32 
 
 
605 aa  658    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24734  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2298  membrane GTPase for stress response  52.48 
 
 
613 aa  639    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4138  GTP-binding protein TypA  52.9 
 
 
606 aa  650    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.781613  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0413  GTP-binding protein TypA  54.91 
 
 
603 aa  668    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08241  tyrosine binding protein  54.1 
 
 
598 aa  642    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0771  GTP-binding protein TypA/BipA (tyrosine phosphorylated protein A)  52.4 
 
 
615 aa  645    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0726544  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1507  GTP-binding protein TypA  54.32 
 
 
608 aa  661    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0308  GTP-binding protein TypA  54.58 
 
 
609 aa  662    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196053  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1545  GTP-binding protein TypA  54.97 
 
 
611 aa  665    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>