More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0001 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0001  chromosomal replication initiation protein  100 
 
 
435 aa  891  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0003  chromosomal replication initiator protein DnaA  55.86 
 
 
441 aa  511  1e-144  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00105638  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2056  chromosomal replication initiation protein  51.51 
 
 
436 aa  473  1e-132  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0001  chromosomal replication initiation protein  50.12 
 
 
436 aa  452  1e-126  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.76217  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1853  chromosomal replication initiation protein  49.65 
 
 
436 aa  441  1e-123  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0001  chromosomal replication initiation protein  49.08 
 
 
440 aa  435  1e-121  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.879571  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0027  chromosomal replication initiation protein  49.08 
 
 
440 aa  435  1e-121  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.984359  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0001  chromosomal replication initiation protein  49.08 
 
 
440 aa  434  1e-120  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0001  chromosomal replication initiation protein  47.59 
 
 
442 aa  423  1e-117  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.08 
 
 
437 aa  379  1e-104  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.11482  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  40.09 
 
 
460 aa  346  4e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  42.82 
 
 
449 aa  345  1e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  40.04 
 
 
458 aa  342  7e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  3.04436e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  39.82 
 
 
457 aa  333  3e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  5.97417e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  39.82 
 
 
457 aa  333  5e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.7 
 
 
454 aa  332  8e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  41.2 
 
 
443 aa  327  2e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  38.44 
 
 
459 aa  324  2e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  3.86226e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  39.54 
 
 
440 aa  324  2e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  1.18947e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.91 
 
 
443 aa  323  3e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  39.5 
 
 
443 aa  323  3e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  48.18 
 
 
450 aa  320  3e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  42.64 
 
 
436 aa  317  2e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  37.39 
 
 
450 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  40.49 
 
 
450 aa  317  3e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  4.47845e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.83 
 
 
446 aa  315  8e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  2.08181e-06  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  44.07 
 
 
445 aa  315  9e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  39.73 
 
 
451 aa  315  1e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  40.9 
 
 
441 aa  313  3e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  39.61 
 
 
442 aa  313  4e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  1.01386e-05 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  38.43 
 
 
446 aa  312  6e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  38.43 
 
 
446 aa  312  6e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  2.44098e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  42.86 
 
 
452 aa  312  6e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  38.43 
 
 
446 aa  312  6e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  4.25777e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  38.43 
 
 
446 aa  312  6e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.63866e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  38.43 
 
 
446 aa  312  6e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  4.59109e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  39.26 
 
 
446 aa  312  9e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.25337e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.1 
 
 
463 aa  311  1e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  37.73 
 
 
446 aa  311  1e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  37.73 
 
 
446 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.84902e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  38.28 
 
 
446 aa  311  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  38.37 
 
 
446 aa  311  2e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.05 
 
 
464 aa  309  5e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  35.78 
 
 
462 aa  309  6e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  35.78 
 
 
462 aa  309  6e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.10804e-08  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.51 
 
 
461 aa  309  6e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  7.04659e-08  normal  0.0525005 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  36.62 
 
 
465 aa  309  7e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  35.48 
 
 
463 aa  309  7e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  2.17775e-05  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  36.6 
 
 
465 aa  309  7e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.21 
 
 
462 aa  309  7e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  35.59 
 
 
472 aa  308  2e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.51721e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  37.96 
 
 
446 aa  308  2e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.91 
 
 
453 aa  306  5e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0001  chromosomal replication initiation protein  36.12 
 
 
450 aa  306  5e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  6.34969e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.85 
 
 
449 aa  305  1e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.41272e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0001  chromosomal replication initiation protein  37.53 
 
 
450 aa  305  1e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  3.22878e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.58 
 
 
587 aa  305  1e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  7.18914e-09  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4223  chromosomal replication initiation protein  35.39 
 
 
467 aa  304  2e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  6.6194e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.58 
 
 
591 aa  304  2e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000633656  unclonable  2.92755e-08 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  39.91 
 
 
445 aa  304  2e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.21 
 
 
453 aa  304  2e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  2.08022e-10  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0001  chromosomal replication initiator protein, DnaA  37.73 
 
 
449 aa  305  2e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.44 
 
 
461 aa  303  4e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.39 
 
 
467 aa  302  6e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  1.36922e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03585  chromosomal replication initiation protein  35.39 
 
 
467 aa  302  6e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183504  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  35.39 
 
 
467 aa  302  6e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  1.02031e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03529  hypothetical protein  35.39 
 
 
467 aa  302  6e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00951486  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  35.39 
 
 
467 aa  302  6e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.26813e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  35.39 
 
 
467 aa  302  6e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  2.01887e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  35.39 
 
 
467 aa  303  6e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  5.58594e-06  normal  0.0494414 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.52 
 
 
503 aa  302  7e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.41 
 
 
483 aa  302  8e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  3.28329e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  35.18 
 
 
467 aa  302  9e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4066  chromosomal replication initiation protein  35.88 
 
 
466 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  8.44177e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4050  chromosomal replication initiation protein  35.88 
 
 
466 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0553543  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4123  chromosomal replication initiation protein  35.88 
 
 
466 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00889574  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4172  chromosomal replication initiation protein  35.88 
 
 
466 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.049293  normal  0.324603 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4230  chromosomal replication initiation protein  35.26 
 
 
466 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00725647  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.8 
 
 
474 aa  301  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00208216  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  37.86 
 
 
453 aa  300  3e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  7.95473e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.65 
 
 
458 aa  300  3e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.11 
 
 
454 aa  300  3e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  3.31762e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  37.86 
 
 
453 aa  300  3e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0001  chromosomal replication initiation protein  42.33 
 
 
495 aa  299  6e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0009  chromosomal replication initiation protein  42.33 
 
 
495 aa  299  6e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166715  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0001  chromosomal replication initiation protein  42.33 
 
 
495 aa  299  6e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0454037 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1227  chromosomal replication initiation protein  37.5 
 
 
449 aa  299  6e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174697  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.65 
 
 
444 aa  299  7e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0001  chromosomal replication initiation protein  37.73 
 
 
451 aa  299  7e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  1.23931e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0001  chromosomal replication initiation protein  37.73 
 
 
451 aa  299  7e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00187127  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002009  chromosomal replication initiator protein dnaA  35.24 
 
 
468 aa  298  1e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  5.52796e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00442  chromosomal replication initiation protein  35.24 
 
 
468 aa  298  1e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0009  chromosomal replication initiation protein  35.13 
 
 
468 aa  298  1e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00184157  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.97 
 
 
566 aa  296  4e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  1.50843e-05  normal  0.201816 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.24 
 
 
439 aa  296  4e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0001  chromosomal replication initiation protein  37.16 
 
 
451 aa  296  4e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  7.64641e-07  normal  0.435321 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0001  chromosomal replication initiation protein  43.7 
 
 
524 aa  296  5e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237228  normal  0.131634 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  34.56 
 
 
462 aa  296  5e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  2.81438e-07  unclonable  1.18337e-08 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4117  chromosomal replication initiation protein  36.68 
 
 
465 aa  296  7e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  9.31933e-05  normal  0.0270955 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0001  chromosomal replication initiation protein  34.63 
 
 
461 aa  295  9e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  5.1e-09  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>