81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4592 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_4592  ribonuclease P protein component  100 
 
 
136 aa  255  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000331999  decreased coverage  0.0000978361 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5110  ribonuclease P protein component  84.3 
 
 
134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0820058  unclonable  0.0000000144984 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3116  ribonuclease P protein  51.11 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134216  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9055  ribonuclease P protein  58.12 
 
 
109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00175664  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3595  ribonuclease P protein component  47.58 
 
 
124 aa  97.1  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183825  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4984  ribonuclease P protein component  48.39 
 
 
122 aa  95.9  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  43.88 
 
 
122 aa  87.8  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6486  ribonuclease P protein  61.11 
 
 
89 aa  82.4  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00207284  normal  0.0833987 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5095  ribonuclease P protein component  45.86 
 
 
127 aa  82  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38050  ribonuclease P protein component  65.08 
 
 
91 aa  80.1  0.000000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7099  ribonuclease P protein  64.18 
 
 
81 aa  80.1  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.260789  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27030  ribonuclease P protein component  60.81 
 
 
93 aa  77.8  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4171  ribonuclease P protein component  43.55 
 
 
136 aa  77.4  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00326173  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3936  ribonuclease P protein component  42.74 
 
 
136 aa  77  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4699  ribonuclease P protein component  51.89 
 
 
117 aa  75.5  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5414  ribonuclease P protein component  48.33 
 
 
130 aa  74.7  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4512  ribonuclease P protein component  41.8 
 
 
120 aa  74.3  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00356165 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2557  ribonuclease P protein component  45.79 
 
 
91 aa  72.8  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000049885  normal  0.280398 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3378  ribonuclease P protein component  41.67 
 
 
125 aa  73.2  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39790  ribonuclease P protein component  55.65 
 
 
122 aa  69.3  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0000138929  normal  0.561767 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5412  ribonuclease P  41.41 
 
 
118 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4224  ribonuclease P protein component  42.86 
 
 
119 aa  68.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5788  ribonuclease P  41.41 
 
 
118 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534341  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0007  ribonuclease P  41.41 
 
 
118 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0873597  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3729  ribonuclease P protein component  45.83 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.468865 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23470  ribonuclease P protein component  45.52 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7340  ribonuclease P protein component  42.96 
 
 
121 aa  62.8  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0829  ribonuclease P  37.9 
 
 
124 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.861038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6077  ribonuclease P  37.21 
 
 
119 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0418194  normal  0.134211 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4242  ribonuclease P protein component  40.6 
 
 
142 aa  57.8  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.0023987  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  35.04 
 
 
131 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0047  ribonuclease P protein component  48.33 
 
 
135 aa  56.2  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1438  RNase P protein component  35 
 
 
119 aa  55.5  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4708  ribonuclease P  29.2 
 
 
159 aa  55.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13958  ribonuclease P  33.87 
 
 
125 aa  52  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4863  ribonuclease P protein component  37.6 
 
 
132 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0576  ribonuclease P protein component  34.33 
 
 
162 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2160  ribonuclease P protein component  44.66 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4547  ribonuclease P protein component  48.74 
 
 
104 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00136145  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0459  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 
189 aa  47.4  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.751226 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  25 
 
 
115 aa  47.4  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  45.31 
 
 
240 aa  47.4  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1200  ribonuclease P protein component  33.67 
 
 
150 aa  47  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00390619 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  32 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  30.83 
 
 
116 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  40.62 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  23.53 
 
 
115 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  24.17 
 
 
119 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0069  ribonuclease P protein component  41.89 
 
 
137 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  24.17 
 
 
119 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  24.17 
 
 
119 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  24.17 
 
 
119 aa  44.7  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  24.17 
 
 
119 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  24.17 
 
 
115 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  25 
 
 
115 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  24.17 
 
 
115 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2064  ribonuclease P  30.33 
 
 
116 aa  43.9  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0143582  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  24.17 
 
 
115 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  26.12 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0873  ribonuclease P protein component  58.82 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  34.31 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  37.29 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  40 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  26.47 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  37.29 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  28.24 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1022  ribonuclease P  34.15 
 
 
145 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3433  ribonuclease P  31.21 
 
 
140 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0963  ribonuclease P  34.15 
 
 
145 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1047  ribonuclease P  32.17 
 
 
121 aa  42  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.012443  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  40.62 
 
 
114 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  36.44 
 
 
116 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  24.22 
 
 
119 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3615  ribonuclease P protein component  36.13 
 
 
106 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0522  ribonuclease P protein  36.51 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  37.33 
 
 
121 aa  40.8  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  37.1 
 
 
115 aa  40.8  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  32.67 
 
 
130 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0332  ribonuclease P protein component  59.38 
 
 
129 aa  40.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10124  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0604  ribonuclease P protein component  24.51 
 
 
118 aa  40.4  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00426381  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0685  ribonuclease P protein component  28.87 
 
 
140 aa  40.4  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>