More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4586 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  100 
 
 		 329 aa  648    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  89.22 
 
 		 335 aa  553  1e-156  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39730  chromosome segregation DNA-binding protein  63 
 
 		 328 aa  372  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4693  chromosome segregation DNA-binding protein  64.01 
 
 		 318 aa  370  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  59.09 
 
 		 323 aa  366  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  62.42 
 
 		 321 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4977  parB-like partition protein  61.39 
 
 		 312 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6071  parB-like partition proteins  61.26 
 
 		 334 aa  353  2e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164971 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6480  parB-like partition protein  56.34 
 
 		 358 aa  353  2.9999999999999997e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4540  chromosome segregation DNA-binding protein  60.44 
 
 		 333 aa  352  5.9999999999999994e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7092  parB-like partition protein  62.31 
 
 		 331 aa  351  8e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13952  chromosome partitioning protein parB  59.76 
 
 		 344 aa  350  2e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5406  chromosome segregation DNA-binding protein  60.19 
 
 		 330 aa  348  6e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5782  chromosome segregation DNA-binding protein  60.19 
 
 		 330 aa  348  6e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0001  chromosome segregation DNA-binding protein  60.19 
 
 		 330 aa  348  6e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178232  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  66.92 
 
 		 309 aa  346  3e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0835  parB-like partition protein  60.37 
 
 		 331 aa  346  3e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  61.82 
 
 		 529 aa  343  2e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4857  parB-like partition protein  56.49 
 
 		 391 aa  343  2.9999999999999997e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  63.84 
 
 		 295 aa  341  8e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2551  parB-like partition protein  55.28 
 
 		 379 aa  341  8e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00820425  normal  0.388314 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4236  parB-like partition protein  57.52 
 
 		 341 aa  338  8e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37980  chromosome segregation DNA-binding protein  65.06 
 
 		 392 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4217  parB-like partition protein  62.46 
 
 		 472 aa  337  1.9999999999999998e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9383  ParB-like partition protein  56.16 
 
 		 324 aa  335  5e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5089  parB-like partition protein  57.96 
 
 		 347 aa  335  7e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3719  parB-like partition protein  53.44 
 
 		 383 aa  328  5.0000000000000004e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118734  hitchhiker  0.00185127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5407  parB-like partition protein  53.42 
 
 		 377 aa  325  8.000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  54.72 
 
 		 314 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4506  parB-like partition protein  59.41 
 
 		 410 aa  314  9.999999999999999e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26960  chromosome segregation DNA-binding protein  58.94 
 
 		 367 aa  309  4e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9049  parB-like partition protein  49.1 
 
 		 398 aa  293  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.740864  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3930  parB-like partition protein  62.46 
 
 		 438 aa  289  4e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000021356 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23400  ParB-like partition protein  60.47 
 
 		 268 aa  288  1e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1443  putative transcriptional regulator  50.17 
 
 		 424 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4165  chromosome segregation DNA-binding protein  52.22 
 
 		 394 aa  283  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.308582  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31910  ParB-like partition protein  59.41 
 
 		 624 aa  282  5.000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.517394  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0053  ParB-like protein  50.53 
 
 		 450 aa  273  2.0000000000000002e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  45.85 
 
 		 306 aa  229  4e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  39.12 
 
 		 286 aa  225  6e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  39.12 
 
 		 286 aa  225  6e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  43.24 
 
 		 285 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  41.43 
 
 		 289 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  42.63 
 
 		 286 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  38.82 
 
 		 289 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  39.24 
 
 		 286 aa  210  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  38.92 
 
 		 282 aa  207  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  42.75 
 
 		 283 aa  206  4e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  43.13 
 
 		 283 aa  206  5e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  43.13 
 
 		 283 aa  206  5e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  43.7 
 
 		 256 aa  204  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  42.75 
 
 		 283 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  42.75 
 
 		 283 aa  205  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  42.91 
 
 		 283 aa  205  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  36.83 
 
 		 281 aa  204  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  39.31 
 
 		 295 aa  203  3e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  38.41 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  41.8 
 
 		 319 aa  203  3e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  42.75 
 
 		 283 aa  203  4e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  44.13 
 
 		 287 aa  203  4e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  37.12 
 
 		 294 aa  203  4e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  39.12 
 
 		 294 aa  202  6e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  39.7 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  38.46 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  43.31 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  42.64 
 
 		 283 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  37.74 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  43.3 
 
 		 304 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  42.44 
 
 		 293 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  41.51 
 
 		 283 aa  199  6e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  42.52 
 
 		 272 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  38.05 
 
 		 279 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  39.57 
 
 		 299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  44.32 
 
 		 280 aa  198  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  42.19 
 
 		 284 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  40.75 
 
 		 278 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  40.13 
 
 		 305 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0501  parB-like partition protein  37.46 
 
 		 282 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  39.87 
 
 		 290 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  41.58 
 
 		 292 aa  196  6e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  41.82 
 
 		 294 aa  195  7e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  36.71 
 
 		 282 aa  195  7e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  37.38 
 
 		 279 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0133  parB-like partition protein  39.56 
 
 		 294 aa  195  8.000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0203  parB-like partition protein  35.74 
 
 		 302 aa  195  8.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  38.08 
 
 		 314 aa  194  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  40.84 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  40.13 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  40.13 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  40.13 
 
 		 305 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  40.76 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  40.76 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  40.76 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  40.76 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  43.07 
 
 		 298 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  40.76 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  40.36 
 
 		 310 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  40.76 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  34.7 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  40.76 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>