More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4553 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  100 
 
 		 148 aa  294  3e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  96.62 
 
 		 148 aa  288  3e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  69.86 
 
 		 148 aa  212  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  69.86 
 
 		 149 aa  210  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  70.75 
 
 		 148 aa  205  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  65.07 
 
 		 148 aa  198  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  64.83 
 
 		 148 aa  194  4.0000000000000005e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  64.38 
 
 		 148 aa  192  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  64.14 
 
 		 148 aa  189  8e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  59.31 
 
 		 151 aa  186  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  61.9 
 
 		 151 aa  185  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  62.33 
 
 		 149 aa  185  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  60.96 
 
 		 148 aa  177  4.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4737  ribosomal protein L9  59.33 
 
 		 150 aa  177  5.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4166  ribosomal protein L9  59.18 
 
 		 150 aa  174  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  56.55 
 
 		 149 aa  174  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  57.93 
 
 		 151 aa  172  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  56.46 
 
 		 150 aa  171  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5366  ribosomal protein L9  58.28 
 
 		 151 aa  170  6.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  60.54 
 
 		 151 aa  169  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  56.16 
 
 		 148 aa  169  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6031  50S ribosomal protein L9  55.92 
 
 		 151 aa  167  7e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.827335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39420  LSU ribosomal protein L9P  56.08 
 
 		 152 aa  164  5e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  53.1 
 
 		 149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5367  50S ribosomal protein L9  55.33 
 
 		 152 aa  161  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5743  50S ribosomal protein L9  55.33 
 
 		 152 aa  161  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.245852 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5456  50S ribosomal protein L9  55.33 
 
 		 152 aa  161  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166119  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0877  50S ribosomal protein L9  53.64 
 
 		 151 aa  160  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3888  50S ribosomal protein L9  54.42 
 
 		 150 aa  160  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00361277 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26560  LSU ribosomal protein L9P  57.14 
 
 		 148 aa  159  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.199017 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10055  50S ribosomal protein L9  53.02 
 
 		 152 aa  158  3e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.95125e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4117  50S ribosomal protein L9  53.74 
 
 		 150 aa  157  7e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23230  LSU ribosomal protein L9P  51.72 
 
 		 153 aa  147  3e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3352  ribosomal protein L9  51.7 
 
 		 151 aa  144  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.600621  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2522  ribosomal protein L9  48.28 
 
 		 150 aa  135  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.559663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  43.45 
 
 		 157 aa  130  5e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0311  ribosomal protein L9  44.83 
 
 		 148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0979697 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1216  50S ribosomal protein L9  45.58 
 
 		 148 aa  128  3e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  46.58 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  35.86 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  43.45 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  42.07 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  41.38 
 
 		 170 aa  118  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  41.38 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  46.67 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11530  ribosomal protein L9  42.07 
 
 		 191 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0446546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  43.15 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0025  ribosomal protein L9  44.83 
 
 		 178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00173008  normal  0.984167 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  43.45 
 
 		 147 aa  111  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  43.84 
 
 		 167 aa  111  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  43.45 
 
 		 151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1205  ribosomal protein L9  42.07 
 
 		 151 aa  110  5e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  41.1 
 
 		 148 aa  110  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 147 aa  110  9e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 151 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  40.41 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  40.41 
 
 		 149 aa  107  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5262  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 148 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00409171  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27890  ribosomal protein L9  44.83 
 
 		 181 aa  106  8.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00233062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  42.47 
 
 		 171 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 147 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 		 168 aa  105  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3412  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 148 aa  105  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  41.61 
 
 		 147 aa  105  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  41.1 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2559  50S ribosomal protein L9  42.18 
 
 		 152 aa  104  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  42.03 
 
 		 153 aa  104  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 		 148 aa  103  6e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 148 aa  103  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5596  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 		 148 aa  103  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 		 148 aa  103  9e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5620  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000412151  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  34.93 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0881  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 		 148 aa  102  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00774862  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5657  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5322  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5150  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000483517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5166  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0461945  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5718  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000626689  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5579  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17506e-22 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  34.48 
 
 		 149 aa  101  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  38.36 
 
 		 151 aa  101  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0163  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 146 aa  101  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00237667  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 165 aa  100  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0397  hypothetical protein  36.3 
 
 		 149 aa  100  5e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1000  50S ribosomal protein L9  37.67 
 
 		 147 aa  100  5e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5339  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 148 aa  100  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000103383  hitchhiker  0.00000000147927 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 148 aa  100  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0517  50S ribosomal protein L9  33.56 
 
 		 151 aa  100  7e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0042  ribosomal protein L9  41.38 
 
 		 150 aa  100  8e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0011  50S ribosomal protein L9  38.93 
 
 		 150 aa  100  8e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.557694  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3541  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 		 149 aa  100  9e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  34.01 
 
 		 148 aa  100  9e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>