More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4525 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4525  Cof-like hydrolase  100 
 
 		 273 aa  550  1e-155  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.992091 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5035  HAD family hydrolase  91.94 
 
 		 273 aa  509  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6168  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  49.81 
 
 		 268 aa  246  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0279  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  45.96 
 
 		 308 aa  193  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.333001  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1155  Cof-like hydrolase  38.01 
 
 		 270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269988  normal  0.0161592 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0177  HAD family hydrolase  37.55 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0958993  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4318  Cof protein  39.33 
 
 		 264 aa  130  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.873657 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5654  Cof-like hydrolase  38.29 
 
 		 267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.166656 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0293  Cof-like hydrolase  36.69 
 
 		 268 aa  129  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0280  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  37.78 
 
 		 267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  36.1 
 
 		 278 aa  124  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.384246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5023  Cof protein  37.13 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5111  Cof-like hydrolase  37.13 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0121  Cof-like hydrolase  33.82 
 
 		 273 aa  123  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5404  Cof-like hydrolase  36.76 
 
 		 271 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.365978 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0126  Cof-like hydrolase  34.81 
 
 		 285 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0144  phosphatase YbhA  34.7 
 
 		 265 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1954  Cof-like hydrolase  36.13 
 
 		 274 aa  119  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0074  HAD-superfamily hydrolase  34.4 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.542278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2103  Cof-like hydrolase  34.85 
 
 		 281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.519808 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0158  Cof-like hydrolase  35.87 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3699  Cof-like hydrolase  32.95 
 
 		 265 aa  103  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13847  hypothetical protein  33.46 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.320421 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07610  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  31.48 
 
 		 265 aa  98.6  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0517229 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6169  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  32.6 
 
 		 271 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1105  HAD superfamily hydrolase  29.82 
 
 		 273 aa  96.3  5e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1545  Cof-like hydrolase  32.12 
 
 		 268 aa  94.7  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00960  Cof subfamily of IIB subfamily of haloacid dehalogenase superfamily/HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  31.77 
 
 		 282 aa  94  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.44 
 
 		 290 aa  92  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.962827  hitchhiker  0.00110837 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  23.91 
 
 		 269 aa  91.7  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0560  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29.37 
 
 		 265 aa  91.7  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0193  Cof-like hydrolase  34.29 
 
 		 277 aa  90.5  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0719  Cof-like hydrolase  29.04 
 
 		 268 aa  89.7  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0216  Cof-like hydrolase  29.39 
 
 		 265 aa  89.4  6e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  28.87 
 
 		 266 aa  89  7e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2460  HAD superfamily hydrolase  26.94 
 
 		 257 aa  89  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00284871  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2525  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.31 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000564566  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0990  Cof-like hydrolase  25.71 
 
 		 274 aa  87  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0971  Cof-like hydrolase  25.71 
 
 		 274 aa  87  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.254704  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  28.22 
 
 		 273 aa  86.3  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  26.99 
 
 		 266 aa  85.9  6e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0062  HAD superfamily hydrolase  28.98 
 
 		 270 aa  86.3  6e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0228  Cof-like hydrolase  30.04 
 
 		 272 aa  85.5  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2444  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.94 
 
 		 257 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.385743 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0870  HAD superfamily hydrolase  29.93 
 
 		 281 aa  85.1  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000525914  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0111  Cof-like hydrolase  29.96 
 
 		 272 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2261  HAD superfamily hydrolase  26.57 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.839309  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl513  HAD-superfamily cof-like hydrolase  27.08 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2426  HAD superfamily hydrolase  26.57 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.560116  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1519  HAD family hydrolase  24.74 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0883  Cof-like hydrolase  26.88 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  24.01 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  27.34 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  25.44 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0534  HAD superfamily hydrolase  28.68 
 
 		 273 aa  83.2  0.000000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0561  HAD superfamily hydrolase  24.21 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5588  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase type 3  31.07 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16228  normal  0.729842 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0726  HAD superfamily hydrolase  27.51 
 
 		 274 aa  82.4  0.000000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4106  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.62 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.607815  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  24.39 
 
 		 277 aa  82  0.000000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0414  Cof-like hydrolase  26.74 
 
 		 268 aa  81.6  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0522924  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0277  Cof-like hydrolase  31.52 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0278  Cof-like hydrolase  29.93 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153774  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2182  Cof-like hydrolase  23.57 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0505  Cof-like hydrolase  46.55 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.930441  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  28.07 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  24.19 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0871  phosphatase YbjI  29.5 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.464954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2501  phosphatase YbjI  29.5 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2798  Cof-like hydrolase  29.5 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.373732  normal  0.741017 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00811  hypothetical protein  29.5 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2798  Cof-like hydrolase  29.5 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.260626  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00828  hypothetical protein  29.5 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0086  Cof-like hydrolase  29.39 
 
 		 280 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf524  COF family HAD hydrolase protein  27.66 
 
 		 273 aa  79  0.00000000000008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0005  sugar phosphatase  28.83 
 
 		 270 aa  79  0.00000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0906  phosphatase YbjI  29.5 
 
 		 271 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.742575  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3865  HAD family hydrolase  29.39 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0709  HAD family hydrolase  25.19 
 
 		 262 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0646  HAD superfamily hydrolase  26.16 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1285  HAD superfamily hydrolase  28.37 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000203899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2223  Cof-like hydrolase  26.35 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02386  hypothetical protein  25.89 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  29.24 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0362  HAD superfamily hydrolase  26.99 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.133771  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2185  Cof-like hydrolase  26.35 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  29.03 
 
 		 281 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2869  Cof-like hydrolase  29.39 
 
 		 273 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1675  HAD family hydrolase  29.39 
 
 		 273 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3444  HAD family hydrolase  29.39 
 
 		 273 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.722541  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3106  HAD family hydrolase  29.39 
 
 		 273 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.24744  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1400  HAD superfamily hydrolase  28.84 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000750549  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4060  sugar phosphatase  30.15 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29.35 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452319  hitchhiker  0.00105022 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0013  sugar phosphatase  28.78 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1220  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.82 
 
 		 269 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  30 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  28.73 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3191  Cof-like hydrolase  29.8 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3946  HAD family hydrolase  29.39 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>