More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4512 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4512  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 111 aa  226  7e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  89.19 
 
 		 111 aa  201  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  60.19 
 
 		 109 aa  119  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0093  Rhodanese domain protein  53.15 
 
 		 112 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0166  Rhodanese domain protein  57.43 
 
 		 115 aa  112  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.919693 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3058  rhodanese-like  51.35 
 
 		 110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0226  Rhodanese domain protein  52.94 
 
 		 113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5264  Rhodanese domain protein  49.55 
 
 		 110 aa  108  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0074  Rhodanese domain protein  57 
 
 		 115 aa  105  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0042  rhodanese domain-containing protein  53.92 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1138  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 		 113 aa  102  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000773759  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  50.5 
 
 		 110 aa  102  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5669  rhodanese domain-containing protein  48.15 
 
 		 113 aa  101  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192192  hitchhiker  0.00438713 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00900  Rhodanese-related sulfurtransferase  49.11 
 
 		 118 aa  98.2  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  48.54 
 
 		 107 aa  97.4  6e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5422  rhodanese domain-containing protein  54.35 
 
 		 116 aa  96.7  9e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500506  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5130  rhodanese domain-containing protein  53.26 
 
 		 116 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183608  normal  0.915775 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5042  rhodanese-like protein  53.26 
 
 		 116 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0244  Rhodanese domain protein  50 
 
 		 107 aa  94.7  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.216372 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0137  rhodanese domain-containing protein  48.98 
 
 		 108 aa  95.1  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0281  Rhodanese domain protein  45.19 
 
 		 108 aa  93.6  9e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161319 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  45.26 
 
 		 145 aa  92.8  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01120  Rhodanese-related sulfurtransferase  46.53 
 
 		 108 aa  92  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0131  Rhodanese domain protein  49.53 
 
 		 116 aa  91.7  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.189011  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  47.12 
 
 		 116 aa  91.7  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25560  Rhodanese-related sulfurtransferase  45.83 
 
 		 108 aa  90.5  6e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.983275  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  46.32 
 
 		 269 aa  90.5  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2737  rhodanese domain-containing protein  45.74 
 
 		 125 aa  86.3  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.909386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  43.27 
 
 		 132 aa  84  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  47.19 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4423  rhodanese-like protein  52.25 
 
 		 116 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.300405 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  44.95 
 
 		 113 aa  81.3  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  47.56 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  44.44 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0156  rhodanese domain-containing protein  43.12 
 
 		 111 aa  80.9  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.634327  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  46.34 
 
 		 471 aa  79.7  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0167  Rhodanese domain protein  45.98 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  39.77 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  40.23 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  40.96 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  40.45 
 
 		 216 aa  74.3  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  43.21 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  41.56 
 
 		 189 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  44.19 
 
 		 356 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2710  rhodanese-like protein  42.68 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  43.53 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  37.76 
 
 		 142 aa  72  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  36.08 
 
 		 141 aa  72  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  43.02 
 
 		 356 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  36.08 
 
 		 141 aa  72  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  43.02 
 
 		 356 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  39.33 
 
 		 220 aa  72  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  37.86 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  38.27 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  43.02 
 
 		 356 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2680  rhodanese-like protein  41.38 
 
 		 105 aa  71.2  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  41.86 
 
 		 356 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  41.86 
 
 		 356 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4028  rhodanese domain-containing protein  44.68 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  40.23 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  35.42 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  36.7 
 
 		 119 aa  70.1  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  38.64 
 
 		 116 aa  70.1  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514418  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  37.93 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0688  beta-lactamase domain-containing protein  38.24 
 
 		 450 aa  70.1  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.715713  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  38.38 
 
 		 472 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  36.9 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  38.2 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1271  rhodanese-like protein  35.79 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0667  Rhodanese domain protein  45 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  45.98 
 
 		 356 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  36.04 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1253  rhodanese domain-containing protein  44.09 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000299854 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0834  rhodanese-related sulfurtransferase  43.42 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000245472  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4642  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.845465  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  35.63 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1122  rhodanese-like protein  35.58 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  39.08 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6622  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.86 
 
 		 357 aa  67  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2024  Rhodanese domain protein  35.71 
 
 		 131 aa  67  0.00000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1643  beta-lactamase domain-containing protein  35.79 
 
 		 464 aa  66.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.11 
 
 		 383 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  38.24 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  34.48 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0153  coenzyme A disulfide reductase, putative  37.65 
 
 		 565 aa  65.5  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  30.1 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1812  rhodanese domain-containing protein  35.64 
 
 		 103 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.76 
 
 		 383 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  35.92 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1847  rhodanese domain-containing protein  35.64 
 
 		 103 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0832695  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  37.65 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.67 
 
 		 377 aa  64.7  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.522613  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  39.02 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0750  rhodanese-like protein  39.02 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  36.78 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  37.21 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0869  rhodanese-like domain-containing protein  39.44 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4191  beta-lactamase domain protein  40.23 
 
 		 357 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0163085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>