More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4508 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4127  SSS sodium solute transporter superfamily  68.74 
 
 
561 aa  702    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1161  SSS sodium solute transporter superfamily  70.25 
 
 
568 aa  684    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.710493  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1538  SSS sodium solute transporter superfamily protein  69.43 
 
 
551 aa  671    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.535704  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2129  SSS sodium solute transporter superfamily protein  73.26 
 
 
537 aa  706    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.896322  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4508  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  100 
 
 
557 aa  1085    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5018  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  96.95 
 
 
557 aa  1002    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000399279 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6314  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  73.58 
 
 
536 aa  684    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267295  normal  0.199401 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3815  Na+/solute symporter  73.12 
 
 
584 aa  728    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00808534 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3167  SSS sodium solute transporter superfamily  75.96 
 
 
536 aa  728    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0572213  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0347  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  70.38 
 
 
534 aa  656    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12100  SSS sodium solute transporter  62.19 
 
 
532 aa  584  1.0000000000000001e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24513  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0071  SSS sodium solute transporter superfamily  63.9 
 
 
528 aa  584  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03080  SSS sodium solute transporter  59.89 
 
 
528 aa  579  1e-164  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3373  SSS sodium solute transporter superfamily  62.73 
 
 
536 aa  575  1.0000000000000001e-163  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.346982  normal  0.514599 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2862  Na+/solute symporter  61.29 
 
 
537 aa  569  1e-161  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0219  SSS sodium solute transporter superfamily  61.44 
 
 
552 aa  566  1e-160  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1075  SSS sodium solute transporter superfamily  64.15 
 
 
546 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.099805  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4284  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  58.08 
 
 
541 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.231008  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4055  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  57.9 
 
 
541 aa  551  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.647451  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06910  SSS sodium solute transporter  58.53 
 
 
540 aa  553  1e-156  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4130  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  57.9 
 
 
541 aa  551  1e-156  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.502613  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3659  SSS sodium solute transporter superfamily  62.85 
 
 
542 aa  550  1e-155  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.641913  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1814  SSS sodium solute transporter superfamily  60.66 
 
 
545 aa  549  1e-155  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1967  SSS sodium solute transporter superfamily  59.96 
 
 
552 aa  548  1e-154  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.732438  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1378  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  59.6 
 
 
538 aa  547  1e-154  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1396  SSS sodium solute transporter superfamily  60.32 
 
 
538 aa  541  1e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000408051 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13340  SSS sodium solute transporter  60.07 
 
 
556 aa  544  1e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0683463  normal  0.0921974 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0694  SSS sodium solute transporter superfamily  58.05 
 
 
543 aa  541  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4564  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  57.5 
 
 
543 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.252386  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2139  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  57.32 
 
 
543 aa  535  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.301041 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2994  Na+/solute symporter  57.97 
 
 
632 aa  537  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.77047  normal  0.396474 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5174  SSS sodium solute transporter superfamily  55.29 
 
 
525 aa  527  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1760  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  53.27 
 
 
530 aa  506  9.999999999999999e-143  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.983666  normal  0.122546 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0827  SSS sodium solute transporter superfamily  51.39 
 
 
513 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1330  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  51.21 
 
 
516 aa  502  1e-141  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.892115  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1726  sodium/solute symporter family protein  50.37 
 
 
516 aa  499  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1777  sodium/solute symporter family protein  50.37 
 
 
516 aa  498  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1672  sodium/solute symporter family protein  50.37 
 
 
516 aa  498  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206426  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1518  sodium/solute symporter family protein  50.37 
 
 
516 aa  497  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.782594  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1490  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  50.65 
 
 
516 aa  498  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0960795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1480  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  50.37 
 
 
516 aa  498  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1703  sodium/solute symporter family protein  50.37 
 
 
516 aa  497  1e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3672  sodium/solute symporter family protein  50.37 
 
 
516 aa  496  1e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0653794  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1635  sodium/solute symporter family protein  50.37 
 
 
516 aa  497  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1523  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  50.19 
 
 
516 aa  496  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.292925  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1718  SSS sodium solute transporter superfamily  51.29 
 
 
511 aa  488  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0315  SSS sodium solute transporter superfamily  50.18 
 
 
519 aa  473  1e-132  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1420  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  45.62 
 
 
659 aa  472  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140042  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2352  sodium/solute symporter family protein  46.89 
 
 
584 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1021  SSS sodium solute transporter superfamily  49.45 
 
 
515 aa  465  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.359049  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2490  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  49.26 
 
 
515 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1070  sodium/solute symporter family protein  46.22 
 
 
584 aa  456  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00394385  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0739  Na+/solute symporter  45.96 
 
 
584 aa  455  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000119238  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1397  SSS sodium solute transporter superfamily  43.69 
 
 
665 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000364072  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1399  SSS sodium solute transporter superfamily  43.93 
 
 
661 aa  449  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00201971  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1517  SSS sodium solute transporter superfamily  45.81 
 
 
664 aa  449  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000116414  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2699  SSS sodium solute transporter superfamily  45.48 
 
 
665 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000107835 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3836  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  47.26 
 
 
539 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.808948 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1850  SSS sodium solute transporter superfamily  48.42 
 
 
513 aa  439  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3760  SSS sodium solute transporter superfamily  46.9 
 
 
541 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3703  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  46.9 
 
 
541 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3843  SSS sodium solute transporter superfamily  46.9 
 
 
541 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1068  sodium/solute symporter family protein  45.39 
 
 
584 aa  431  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272224  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1340  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  44.13 
 
 
655 aa  431  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2623  acetate permease  46.52 
 
 
563 aa  427  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0635  acetate permease  45.2 
 
 
559 aa  425  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.953483  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1624  sodium:solute symporter family protein  44.85 
 
 
552 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.484288  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3756  acetate permease  45.17 
 
 
552 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.574544  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3377  acetate permease  43.68 
 
 
552 aa  421  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0784287  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1608  acetate permease  45.62 
 
 
552 aa  421  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0912  acetate permease  44.64 
 
 
552 aa  420  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1454  acetate permease  44.52 
 
 
554 aa  420  1e-116  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.253764  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0683  acetate permease  44.17 
 
 
552 aa  421  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0143  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  48.45 
 
 
524 aa  419  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1743  acetate permease  45.07 
 
 
554 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1335  acetate permease  45.36 
 
 
554 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384462  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3837  acetate permease  44.53 
 
 
551 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0353587  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3923  acetate permease  44.53 
 
 
551 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281224  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3949  acetate permease  44.71 
 
 
551 aa  418  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.739246 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0295  acetate permease  44.42 
 
 
550 aa  416  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510607  hitchhiker  0.000229004 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1542  SSS sodium solute transporter superfamily  43.8 
 
 
577 aa  416  9.999999999999999e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000862893  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3976  acetate permease  45.11 
 
 
554 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.900001  normal  0.864966 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03939  acetate permease  44.63 
 
 
549 aa  412  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.68156  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4619  acetate permease  44.63 
 
 
549 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4668  acetate permease  44.44 
 
 
549 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.962936  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4622  acetate permease  44.63 
 
 
549 aa  413  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4526  acetate permease  44.44 
 
 
549 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0375  acetate permease  45.24 
 
 
553 aa  413  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4533  acetate permease  44.44 
 
 
549 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.612121  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2856  SSS sodium solute transporter superfamily  42.21 
 
 
657 aa  412  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4617  acetate permease  44.44 
 
 
549 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.825598  normal  0.309264 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1891  acetate permease  43.46 
 
 
551 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.45053  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3960  acetate permease  44.63 
 
 
549 aa  413  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.221467 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1293  acetate permease  44.89 
 
 
554 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22350  acetate permease  43.42 
 
 
551 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000316225 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4529  acetate permease  44.63 
 
 
549 aa  412  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03899  hypothetical protein  44.63 
 
 
549 aa  412  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.790578  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4311  acetate permease  44.63 
 
 
549 aa  413  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5572  acetate permease  44.63 
 
 
549 aa  412  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4586  acetate permease  44.26 
 
 
549 aa  409  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781469  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>