20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4496 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4496  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  241  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.0019823  normal  0.109198 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5010  hypothetical protein  89.15 
 
 		 129 aa  217  5e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000278675 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2132  hypothetical protein  48.54 
 
 		 123 aa  100  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4561  hypothetical protein  47.37 
 
 		 124 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.564169  normal  0.770397 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2142  hypothetical protein  49.12 
 
 		 124 aa  99  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.153655 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00880  hypothetical protein  46.15 
 
 		 166 aa  90.9  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6323  hypothetical protein  44.66 
 
 		 177 aa  89.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0698  hypothetical protein  43.22 
 
 		 136 aa  88.2  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4052  hypothetical protein  48.25 
 
 		 124 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140635  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4281  hypothetical protein  48.25 
 
 		 124 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4127  hypothetical protein  48.25 
 
 		 124 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105297  normal  0.513252 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1154  hypothetical protein  43.59 
 
 		 136 aa  84.3  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3376  protein of unknown function DUF485  44.21 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0356  hypothetical protein  41.88 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.900599  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1392  hypothetical protein  43.3 
 
 		 116 aa  70.5  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000114394 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0068  hypothetical protein  43.44 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5279  protein of unknown function DUF485  40.98 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.237631  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3171  hypothetical protein  45.78 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00638413  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1374  hypothetical protein  32.65 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.851003  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4130  hypothetical protein  36.59 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>