More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4493 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_5007  signal transduction histidine kinase, LytS  91.91 
 
 		 408 aa  677    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131071  decreased coverage  0.00000540633 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4493  histidine kinase internal region  100 
 
 		 408 aa  798    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555212  normal  0.320157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6326  signal transduction histidine kinase, LytS  61.35 
 
 		 398 aa  451  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2134  signal transduction histidine kinase LytS  60.85 
 
 		 394 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3173  signal transduction histidine kinase, LytS  61.62 
 
 		 411 aa  431  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0466454  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5281  signal transduction histidine kinase, LytS  60.32 
 
 		 391 aa  419  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0358  histidine kinase internal region  57.66 
 
 		 374 aa  410  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3378  signal transduction histidine kinase, LytS  56.25 
 
 		 394 aa  399  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1152  signal transduction histidine kinase, LytS  53.92 
 
 		 394 aa  379  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4050  signal transduction histidine kinase, LytS  59.09 
 
 		 403 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2761  signal transduction histidine kinase, LytS  52.51 
 
 		 394 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4125  signal transduction histidine kinase, LytS  59.09 
 
 		 403 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489404  normal  0.628392 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4279  signal transduction histidine kinase, LytS  59.09 
 
 		 403 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4559  signal transduction histidine kinase, LytS  54.59 
 
 		 409 aa  377  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646655 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1376  signal transduction histidine kinase, LytS  52.88 
 
 		 405 aa  372  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1394  signal transduction histidine kinase, LytS  53.87 
 
 		 393 aa  371  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000264266 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2144  signal transduction histidine kinase, LytS  54.69 
 
 		 408 aa  368  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0137321  normal  0.176351 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0700  histidine kinase internal region  54.81 
 
 		 402 aa  356  2.9999999999999997e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0064  signal transduction histidine kinase, LytS  48.88 
 
 		 428 aa  352  5e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0069  signal transduction histidine kinase, LytS  52.23 
 
 		 400 aa  350  3e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0746502  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1329  signal transduction histidine kinase LytS  50 
 
 		 432 aa  317  2e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268235  normal  0.0194209 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00850  putative regulator of cell autolysis  43.8 
 
 		 428 aa  304  2.0000000000000002e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.432322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2857  ATP-binding region, ATPase-like  48.3 
 
 		 363 aa  243  5e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12150  putative regulator of cell autolysis  44.6 
 
 		 325 aa  233  5e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2171  ATP-binding region, ATPase-like  40.11 
 
 		 455 aa  230  3e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346246  normal  0.0306612 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  37.44 
 
 		 465 aa  226  6e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1339  signal transduction histidine kinase, LytS  37.4 
 
 		 426 aa  225  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0468  signal transduction histidine kinase, LytS  37.66 
 
 		 450 aa  224  2e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4128  signal transduction histidine kinase, LytS  44.89 
 
 		 338 aa  222  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3774  signal transduction histidine kinase, LytS  38.19 
 
 		 446 aa  219  7e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.469079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  36.19 
 
 		 576 aa  206  8e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  32.52 
 
 		 578 aa  206  8e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  36.47 
 
 		 576 aa  201  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  36.89 
 
 		 568 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2355  signal transduction histidine kinase, LytS  35.38 
 
 		 580 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1225  signal transduction histidine kinase, LytS  32.94 
 
 		 603 aa  190  4e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.247489 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0160  ATP-binding region, ATPase-like  34.3 
 
 		 567 aa  189  9e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0899  signal transduction histidine kinase, LytS  35.71 
 
 		 572 aa  187  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144133  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2792  signal transduction histidine kinase, LytS  35.81 
 
 		 564 aa  176  5e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000275265  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1441  signal transduction histidine kinase, LytS  32.49 
 
 		 559 aa  176  6e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.645903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0377  Signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  31.65 
 
 		 576 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0918  sensor histidine kinase  30.4 
 
 		 561 aa  170  5e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.817517 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02055  predicted sensory kinase in two-component system with YehT  30.4 
 
 		 561 aa  169  6e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1532  signal transduction histidine kinase, LytS  30.4 
 
 		 561 aa  169  6e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.363202  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1521  signal transduction histidine kinase, LytS  30.4 
 
 		 561 aa  169  6e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2260  sensor histidine kinase  30.4 
 
 		 561 aa  169  6e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02013  hypothetical protein  30.4 
 
 		 561 aa  169  6e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2414  sensor histidine kinase  30.4 
 
 		 561 aa  169  6e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2958  signal transduction histidine kinase, LytS  32.11 
 
 		 568 aa  169  7e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.177996  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0225  hypothetical protein  31.14 
 
 		 558 aa  169  7e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0222  signal transduction histidine kinase, LytS  30.96 
 
 		 561 aa  169  8e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5383  sensor histidine kinase LytS  29.53 
 
 		 522 aa  168  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.498572  normal  0.326696 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0866  sensor histidine kinase  30.4 
 
 		 561 aa  167  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4137  signal transduction histidine kinase, LytS  29.38 
 
 		 572 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3113  sensor histidine kinase  30.79 
 
 		 561 aa  168  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.212432 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3543  signal transduction histidine kinase, LytS  41.43 
 
 		 403 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00838652  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3938  signal transduction histidine kinase, LytS  29.43 
 
 		 572 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4117  sensor histidine kinase  30.16 
 
 		 565 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.645201 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2394  sensor histidine kinase  30.11 
 
 		 561 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764867  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5123  sensor histidine kinase  29.49 
 
 		 589 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5138  sensor histidine kinase  29.49 
 
 		 589 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2094  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase internal region:5TM Receptors of the LytS-YhcK type, transmembrane region  29.97 
 
 		 577 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2349  sensor histidine kinase  30.11 
 
 		 561 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4007  sensor histidine kinase  29.89 
 
 		 565 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5537  sensor histidine kinase LytS  29.49 
 
 		 589 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2398  sensor histidine kinase  30.11 
 
 		 561 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5566  sensor histidine kinase LytS  29.49 
 
 		 589 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2305  sensor histidine kinase  30.11 
 
 		 561 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5574  sensor histidine kinase LytS  29.23 
 
 		 589 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5296  sensor histidine kinase LytS  29.49 
 
 		 589 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5692  sensor histidine kinase LytS  29.49 
 
 		 589 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5622  sensor histidine kinase LytS  29.49 
 
 		 589 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1319  membrane receptor, histidine kinase  30.4 
 
 		 560 aa  165  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1084  histidine kinase internal region  30.94 
 
 		 575 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0370265  normal  0.975996 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2506  sensor histidine kinase  30.11 
 
 		 561 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2724  signal transduction histidine kinase, LytS  30.97 
 
 		 562 aa  164  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004413  autolysin sensor kinase  32.13 
 
 		 556 aa  163  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5235  signal transduction histidine kinase, LytS  31.3 
 
 		 589 aa  163  7e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0146  signal transduction histidine kinase, LytS  30.16 
 
 		 565 aa  162  9e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889074  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00985  hypothetical protein  31.67 
 
 		 556 aa  162  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0956  signal transduction histidine kinase, LytS  28.12 
 
 		 563 aa  162  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324121  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3959  signal transduction histidine kinase, LytS  30.08 
 
 		 591 aa  161  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0276  signal transduction histidine kinase, LytS  30.25 
 
 		 561 aa  160  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1480  signal transduction histidine kinase, LytS  30.17 
 
 		 557 aa  160  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336148  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4588  signal transduction histidine kinase, LytS  30.4 
 
 		 561 aa  160  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1282  signal transduction histidine kinase, LytS  33.43 
 
 		 569 aa  159  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0211527 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0958  signal transduction histidine kinase, LytS  28.69 
 
 		 563 aa  157  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3342  signal transduction histidine kinase, LytS  30.15 
 
 		 556 aa  156  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.891854 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2453  histidine kinase internal protein  30.97 
 
 		 568 aa  156  7e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278514  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3061  signal transduction histidine kinase, LytS  33.25 
 
 		 560 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3404  signal transduction histidine kinase, LytS  32.09 
 
 		 563 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.823402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3169  signal transduction histidine kinase, LytS  33.25 
 
 		 560 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1766  signal transduction histidine kinase, LytS  29.33 
 
 		 558 aa  154  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.420125  hitchhiker  0.00747728 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01150  putative regulator of cell autolysis  31.54 
 
 		 440 aa  153  5e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1324  signal transduction histidine kinase, LytS  30.73 
 
 		 433 aa  153  5.9999999999999996e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0634382  hitchhiker  0.00226936 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02290  predicted sensory kinase in two-component system with YpdB  30.59 
 
 		 565 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2024  sensor histidine kinase LytS  27.15 
 
 		 591 aa  150  3e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0251  5TM Receptors of the LytS-YhcK type transmembrane region  27.32 
 
 		 584 aa  150  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02251  hypothetical protein  30.59 
 
 		 565 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0245  signal transduction histidine kinase, LytS  27.32 
 
 		 584 aa  150  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>