15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4480 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4480  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  279  9e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0231829 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4994  hypothetical protein  81.63 
 
 		 147 aa  174  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000393416 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8341  hypothetical protein  49.62 
 
 		 139 aa  110  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.724069 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1681  hypothetical protein  48.09 
 
 		 131 aa  103  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.834143  normal  0.100946 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0011  hypothetical protein  37.1 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0019  hypothetical protein  37.1 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0189767 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0011  hypothetical protein  37.1 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193559 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0024  hypothetical protein  35.34 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301664  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0018  hypothetical protein  34.35 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0015  hypothetical protein  37.5 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0816  hypothetical protein  30.43 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128925  normal  0.711897 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00280  hypothetical protein  33.63 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.326036  normal  0.0617221 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10010  hypothetical protein  33.04 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0070  hypothetical protein  34.67 
 
 		 150 aa  40  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0030  hypothetical protein  40.24 
 
 		 135 aa  40  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.241385  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>