More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4417 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  39.41 
 
 
3470 aa  677    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1879  amino acid adenylation domain-containing protein  39.09 
 
 
2419 aa  700    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4221  non-ribosomal peptide synthetase  39.15 
 
 
2174 aa  642    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.206011 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4086  amino acid adenylation domain-containing protein  38.49 
 
 
2155 aa  635    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  42.07 
 
 
5953 aa  697    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  42.52 
 
 
6889 aa  702    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  36.92 
 
 
2385 aa  654    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3686  amino acid adenylation domain protein  38.22 
 
 
2395 aa  686    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  37.51 
 
 
2156 aa  756    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  37.96 
 
 
3432 aa  637    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  38.65 
 
 
2151 aa  676    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4894  amino acid adenylation domain-containing protein  46.44 
 
 
1083 aa  816    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.950239  normal  0.0263577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  40.43 
 
 
5929 aa  660    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3546  amino acid adenylation domain-containing protein  39.56 
 
 
3404 aa  659    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  41.33 
 
 
3432 aa  742    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  39.85 
 
 
4531 aa  680    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  36.49 
 
 
2385 aa  647    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  35.83 
 
 
2385 aa  648    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  36.73 
 
 
2385 aa  654    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  41.47 
 
 
8646 aa  679    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  41.95 
 
 
3328 aa  671    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  38.72 
 
 
3021 aa  649    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  39.06 
 
 
1550 aa  724    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  38.01 
 
 
4336 aa  637    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  38.77 
 
 
4960 aa  740    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  38.65 
 
 
2154 aa  665    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  42.91 
 
 
5596 aa  712    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  39.44 
 
 
5926 aa  664    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  42.68 
 
 
9498 aa  702    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  42.27 
 
 
2581 aa  828    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  41.65 
 
 
13537 aa  697    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  42.64 
 
 
6676 aa  707    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  39.09 
 
 
4317 aa  642    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  38.3 
 
 
2867 aa  729    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4084  amino acid adenylation domain-containing protein  39.15 
 
 
1114 aa  674    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85613  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  39.1 
 
 
1142 aa  717    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  41.11 
 
 
3308 aa  798    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  41.47 
 
 
3498 aa  813    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  40.73 
 
 
2033 aa  779    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4109  amino acid adenylation  34.59 
 
 
1786 aa  640    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208816  normal  0.227369 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  40.49 
 
 
3942 aa  689    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4838  amino acid adenylation  35.36 
 
 
1436 aa  638    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0776089 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5751  amino acid adenylation domain protein  39.48 
 
 
1578 aa  709    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  41.33 
 
 
6661 aa  711    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  42.07 
 
 
6072 aa  674    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  39.96 
 
 
4572 aa  665    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  39.87 
 
 
3291 aa  657    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  37.49 
 
 
2156 aa  758    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  39.52 
 
 
4502 aa  686    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  37.33 
 
 
4960 aa  729    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  41.74 
 
 
4882 aa  680    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  39.68 
 
 
3002 aa  668    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2266  amino acid adenylation  39.91 
 
 
1369 aa  662    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654953  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  39.02 
 
 
3291 aa  745    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  42.46 
 
 
4383 aa  671    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  36.49 
 
 
2385 aa  647    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  38.16 
 
 
4037 aa  640    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1830  amino acid adenylation  38.67 
 
 
1138 aa  660    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  38.87 
 
 
4968 aa  738    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  36.87 
 
 
2386 aa  660    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  37.24 
 
 
2385 aa  656    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  41.11 
 
 
8914 aa  677    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1874  amino acid adenylation domain-containing protein  37.1 
 
 
1553 aa  666    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  41.52 
 
 
4489 aa  649    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1088  hypothetical protein  41.88 
 
 
2187 aa  675    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3541  amino acid adenylation domain-containing protein  40.06 
 
 
2137 aa  647    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.432696  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  36.26 
 
 
2386 aa  644    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0353  amino acid adenylation domain-containing protein  42.31 
 
 
1054 aa  682    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0224507  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  36.7 
 
 
1556 aa  692    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  37.04 
 
 
2156 aa  743    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  39.94 
 
 
5328 aa  659    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  40.53 
 
 
8915 aa  662    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.47545 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  41.28 
 
 
3176 aa  690    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1971  amino acid adenylation domain-containing protein  40.91 
 
 
1109 aa  656    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.565529  normal  0.353817 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  39.09 
 
 
4342 aa  640    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  39.89 
 
 
2571 aa  732    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  40.08 
 
 
2189 aa  676    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  40.93 
 
 
2448 aa  686    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3683  amino acid adenylation domain protein  38.33 
 
 
2664 aa  687    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0363  amino acid adenylation domain-containing protein  43.28 
 
 
2125 aa  723    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.831612 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0546  amino acid adenylation domain-containing protein  35.32 
 
 
2151 aa  636    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  38.41 
 
 
1816 aa  706    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4891  amino acid adenylation domain-containing protein  92.39 
 
 
1104 aa  1967    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0706407  normal  0.0725779 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  37.17 
 
 
3086 aa  728    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  35.4 
 
 
2164 aa  661    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  41.22 
 
 
2370 aa  690    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  41.8 
 
 
3352 aa  671    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  39.91 
 
 
3639 aa  664    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  34.28 
 
 
1833 aa  687    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2413  amino acid adenylation domain-containing protein  37.74 
 
 
1569 aa  700    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1970  amino acid adenylation domain-containing protein  39.98 
 
 
1137 aa  648    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0949143 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  41.97 
 
 
6006 aa  672    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  36.87 
 
 
2385 aa  649    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2415  amino acid adenylation domain-containing protein  36.65 
 
 
1127 aa  666    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  42.17 
 
 
6081 aa  672    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2213  non-ribosomal peptide synthase  40.15 
 
 
4468 aa  666    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  40.15 
 
 
3348 aa  666    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1675  amino acid adenylation domain-containing protein  43.5 
 
 
1129 aa  741    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  44.8 
 
 
4991 aa  768    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4417  amino acid adenylation domain-containing protein  100 
 
 
1104 aa  2173    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.543215 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>