More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4375 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2342  amino acid permease-associated region  76.72 
 
 		 508 aa  738    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0123104  normal  0.200985 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4375  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 495 aa  967    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0037  amino acid permease-associated region  53.35 
 
 		 494 aa  508  1e-143  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.877998 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0047  amino acid permease-associated region  53.73 
 
 		 499 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1050  hypothetical protein  34.26 
 
 		 473 aa  299  7e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.95455 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2318  amino acid permease-associated region  38.15 
 
 		 469 aa  296  4e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0046  amino acid permease-associated region  35.09 
 
 		 495 aa  291  1e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3825  glutamate/gamma-aminobutyrate anti-porter  36.67 
 
 		 506 aa  292  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0552  glutamate/GABA antiporter  36.4 
 
 		 506 aa  288  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1654  hypothetical protein  34.98 
 
 		 464 aa  281  1e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0470  hypothetical protein  32.75 
 
 		 467 aa  281  2e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1660  hypothetical protein  35.19 
 
 		 464 aa  281  2e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0708  amino acid permease-associated region  36.71 
 
 		 480 aa  280  3e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000156631 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0446  hypothetical protein  32.75 
 
 		 467 aa  280  5e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0145  amino acid permease-associated region  33.76 
 
 		 474 aa  276  6e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.270718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6600  amino acid permease-associated region  35.86 
 
 		 490 aa  273  5.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2121  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  33.97 
 
 		 476 aa  268  2e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0063  amino acid antiporter  34.19 
 
 		 470 aa  267  2.9999999999999995e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1501  amino acid permease family protein  31.04 
 
 		 474 aa  248  1e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1434  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  31.04 
 
 		 474 aa  248  2e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0488  amino acid antiporter  32.03 
 
 		 466 aa  230  3e-59  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.557891  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1892  hypothetical protein  30.82 
 
 		 473 aa  227  3e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2031  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  32.57 
 
 		 472 aa  220  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1881  hypothetical protein  30.6 
 
 		 473 aa  219  1e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2317  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter family protein  32.57 
 
 		 472 aa  219  1e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003630  amino acid/polyamine  28.75 
 
 		 475 aa  211  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1412  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  30.32 
 
 		 503 aa  205  1e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0796975  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02485  hypothetical protein  27.64 
 
 		 475 aa  200  6e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2710  putative amino acid transporter  27.45 
 
 		 473 aa  196  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.484559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2589  putative amino acid transporter  27.45 
 
 		 473 aa  196  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.462 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2501  putative amino acid transporter  27.45 
 
 		 473 aa  196  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.957619  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2601  putative amino acid transporter  27.45 
 
 		 473 aa  196  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2547  putative amino acid transporter  27.45 
 
 		 473 aa  196  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2105  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  29.71 
 
 		 511 aa  189  9e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.902861  normal  0.230296 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01450  predicted glutamate:gamma-aminobutyric acid antiporter  29.71 
 
 		 511 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2155  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  29.71 
 
 		 511 aa  189  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.316259  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01463  hypothetical protein  29.71 
 
 		 511 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1755  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  29.71 
 
 		 511 aa  189  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.489766  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1577  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  29.71 
 
 		 511 aa  189  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2165  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  29.71 
 
 		 511 aa  189  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0669643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  29.71 
 
 		 511 aa  189  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  29.71 
 
 		 511 aa  188  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0148  amino acid permease-associated region  30.51 
 
 		 720 aa  172  1e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1507  glutamate:gamma-aminobutyrate antiporter family protein  27.08 
 
 		 485 aa  169  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0581388  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1297  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  26.82 
 
 		 485 aa  168  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00362427  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0883  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  26.68 
 
 		 511 aa  166  9e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0047  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  25.72 
 
 		 494 aa  148  3e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1629  hypothetical protein  24.74 
 
 		 445 aa  127  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1623  hypothetical protein  24.32 
 
 		 445 aa  124  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2961  amino acid permease-associated region  29.46 
 
 		 481 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.408205 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1143  amino acid permease-associated region  25.22 
 
 		 464 aa  115  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0653  amino acid permease family protein  21.77 
 
 		 472 aa  107  5e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63480  putative amino acid permease  28.54 
 
 		 465 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.982931 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3446  amino acid permease-associated region  24.47 
 
 		 455 aa  97.4  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0677  amino acid permease-associated region  24.02 
 
 		 500 aa  97.1  6e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.148387 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2190  amino acid permease-associated region  24.32 
 
 		 497 aa  91.7  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1012  amino acid permease family protein  24.07 
 
 		 489 aa  90.1  9e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000367074  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0155  amino acid permease  24.13 
 
 		 495 aa  89.4  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0671  amino acid permease-associated region  23.77 
 
 		 500 aa  89  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  hitchhiker  0.0000196904 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1181  amino acid permease family protein  23.54 
 
 		 489 aa  86.7  9e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0293618  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0159  amino acid permease family protein  23.88 
 
 		 495 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1999  amino acid permease-associated region  23.73 
 
 		 504 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0525134  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2045  amino acid permease-associated region  23.73 
 
 		 504 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1980  amino acid permease-associated region  23.73 
 
 		 504 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4126  amino acid permease-associated region  21.88 
 
 		 502 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.635081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2217  amino acid permease-associated region  23.54 
 
 		 503 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291041 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4400  amino acid permease family protein  27.45 
 
 		 500 aa  81.3  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4627  amino acid permease family protein  27.45 
 
 		 514 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.592733  normal  0.0531629 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1536  amino acid transporter  26.58 
 
 		 476 aa  81.3  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0652543  normal  0.377188 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04028  predicted transporter  27.45 
 
 		 500 aa  80.9  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.853032  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3834  amino acid permease-associated region  27.45 
 
 		 514 aa  80.9  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03990  hypothetical protein  27.45 
 
 		 489 aa  80.9  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.826607  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3854  amino acid permease-associated region  27.45 
 
 		 500 aa  80.9  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146223 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3114  amino acid transporter  26.81 
 
 		 446 aa  80.9  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.988661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5674  amino acid permease family protein  27.45 
 
 		 514 aa  80.9  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.270283  normal  0.215143 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4715  amino acid permease family protein  27.06 
 
 		 500 aa  80.1  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.212622  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4623  inner membrane transporter YjeM  24.71 
 
 		 500 aa  78.2  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4615  inner membrane transporter YjeM  24.71 
 
 		 500 aa  78.2  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4763  inner membrane transporter YjeM  24.71 
 
 		 500 aa  78.2  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.520052 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4706  inner membrane transporter YjeM  24.71 
 
 		 500 aa  78.2  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.929482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4742  inner membrane transporter YjeM  24.83 
 
 		 493 aa  77  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0345  amino acid permease-associated region  26.34 
 
 		 468 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1226  amino acid permease-associated region  23.37 
 
 		 497 aa  73.2  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3706  hypothetical protein  26.63 
 
 		 483 aa  70.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.130124 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1009  amino acid permease-associated region  24.71 
 
 		 506 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.146582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0714  putrescine transporter  25.18 
 
 		 439 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0136028  normal  0.578449 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1204  putrescine transporter  25.84 
 
 		 437 aa  67.8  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.658764  decreased coverage  0.0000377329 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  25.21 
 
 		 436 aa  67.8  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03339  hypothetical protein  23.6 
 
 		 476 aa  67  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4115  amino acid permease-associated region  26.19 
 
 		 516 aa  66.6  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0828  amino acid transporter  23.78 
 
 		 502 aa  66.2  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000137053  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00648  putrescine/proton symporter: putrescine/ornithine antiporter  25.24 
 
 		 439 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.173719  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2945  arginine/ornithine antiporter  25.24 
 
 		 439 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1866  amino acid permease-associated region  22.19 
 
 		 458 aa  65.5  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1382  amino acid permease-associated region  21.48 
 
 		 501 aa  65.1  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.320464  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0784  putrescine transporter  25.24 
 
 		 439 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0285849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00640  hypothetical protein  25.24 
 
 		 439 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.167643  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2964  putrescine transporter  25.24 
 
 		 439 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.018093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0508  putrescine transporter  25.69 
 
 		 440 aa  65.1  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  25.63 
 
 		 481 aa  65.1  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>