208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4373 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_4373  dienelactone hydrolase  100 
 
 
256 aa  514  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.68292 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2621  dienelactone hydrolase  73.98 
 
 
265 aa  384  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2665  dienelactone hydrolase  73.98 
 
 
265 aa  384  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal  0.690988 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2650  dienelactone hydrolase  73.98 
 
 
265 aa  384  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4947  dienelactone hydrolase  49.38 
 
 
241 aa  202  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.316291  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3045  dienelactone hydrolase  45.78 
 
 
249 aa  194  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3656  dienelactone hydrolase  38.34 
 
 
263 aa  146  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0787  dienelactone hydrolase family protein  37.4 
 
 
356 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307266  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0597  dienelactone hydrolase family protein  37.8 
 
 
243 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0612  dienelactone hydrolase family protein  37.4 
 
 
243 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0501  dienelactone hydrolase family protein  34.55 
 
 
242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.821381  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1497  dienelactone hydrolase  32.24 
 
 
246 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1920  dienelactone hydrolase  32.93 
 
 
264 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0914  dienelactone hydrolase  33.07 
 
 
263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2303  dienelactone hydrolase  30.92 
 
 
264 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0499  dienelactone hydrolase  31.6 
 
 
261 aa  108  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0014  dienelactone hydrolase  29.76 
 
 
273 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332863  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4242  dienelactone hydrolase  30.24 
 
 
263 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194983  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2592  hypothetical protein  28.63 
 
 
238 aa  106  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33270  Dienelactone hydrolase protein  31.78 
 
 
261 aa  105  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4214  hypothetical protein  33.6 
 
 
262 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4157  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 
237 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138582  normal  0.0101627 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2719  hypothetical protein  28.22 
 
 
238 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1805  dienelactone hydrolase  34.15 
 
 
245 aa  103  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal  0.0741289 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4232  dienelactone hydrolase  30.2 
 
 
263 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.215176  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2163  dienelactone hydrolase  32.83 
 
 
237 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163998  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49330  hypothetical protein  33.61 
 
 
262 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.295044  normal  0.0937035 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0163  dienelactone hydrolase  31.02 
 
 
318 aa  102  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1370  dienelactone hydrolase  33.03 
 
 
280 aa  102  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0661  dienelactone hydrolase  30.4 
 
 
263 aa  102  8e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2018  dienelactone hydrolase  32.02 
 
 
242 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.426068  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3711  dienelactone hydrolase  29.2 
 
 
262 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138504 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7419  hypothetical protein  34.88 
 
 
234 aa  99.8  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1525  dienelactone hydrolase  32.27 
 
 
241 aa  99.8  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1677  dienelactone hydrolase family protein  29.6 
 
 
262 aa  99  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0559  dienelactone hydrolase  32.93 
 
 
265 aa  98.6  9e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0569  dienelactone hydrolase  32.93 
 
 
267 aa  98.2  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000352652  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1184  dienelactone hydrolase  30.61 
 
 
265 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00788305  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2209  dienelactone hydrolase family protein  32.02 
 
 
242 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.670258  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0790  dienelactone hydrolase  30.65 
 
 
269 aa  97.1  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  30.4 
 
 
263 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1196  dienelactone hydrolase  29.84 
 
 
263 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372002  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1214  dienelactone hydrolase  30.61 
 
 
263 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.602009  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2350  dienelactone hydrolase  29.29 
 
 
259 aa  94.7  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2612  hypothetical protein  25.32 
 
 
238 aa  94.7  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1803  dienelactone hydrolase family protein  30.04 
 
 
239 aa  94.4  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.100178  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1626  dienelactone hydrolase  30.36 
 
 
242 aa  94  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0197057 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3749  dienelactone hydrolase  28.69 
 
 
241 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2739  hypothetical protein  26.02 
 
 
238 aa  93.6  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1264  dienelactone hydrolase family protein  33.33 
 
 
237 aa  91.7  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2490  dienelactone hydrolase  29.03 
 
 
262 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2281  dienelactone hydrolase  24.69 
 
 
245 aa  89  7e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187081 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3677  hypothetical protein  31.84 
 
 
241 aa  89  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43840  hypothetical protein  31.43 
 
 
241 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2536  dienelactone hydrolase family protein  29.22 
 
 
270 aa  87.8  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4178  dienelactone hydrolase  27.16 
 
 
241 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119095  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1219  carboxymethylenebutenolidase  30.77 
 
 
258 aa  87.4  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0189806  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1690  dienelactone hydrolase  27.46 
 
 
241 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0305937  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3501  dienelactone hydrolase  29.1 
 
 
241 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.572778  normal  0.863924 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0940  dienelactone hydrolase  31.5 
 
 
279 aa  86.7  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0347  dienelactone hydrolase  28.86 
 
 
262 aa  86.7  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.971139  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2218  dienelactone hydrolase  28.05 
 
 
264 aa  85.9  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000562202  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1245  dienelactone hydrolase  31.28 
 
 
261 aa  85.5  8e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00955102  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1980  dienelactone hydrolase  24.28 
 
 
245 aa  84  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.228213 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0425  dienelactone hydrolase  26.23 
 
 
268 aa  82.8  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.18094  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4133  dienelactone hydrolase  31.74 
 
 
237 aa  82.8  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.850524  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1399  dienelactone hydrolase  30.14 
 
 
250 aa  82.4  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0170  dienelactone hydrolase  23.89 
 
 
246 aa  81.6  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135133  normal  0.545513 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2104  dienelactone hydrolase  29.22 
 
 
234 aa  80.1  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0464175  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02015  dienelactone hydrolase  27.51 
 
 
264 aa  79  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4080  dienelactone hydrolase  27.35 
 
 
244 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.240265  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3611  dienelactone hydrolase  26.07 
 
 
267 aa  78.6  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000690208  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0480  dienelactone hydrolase family protein  28 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3134  dienelactone hydrolase  29.96 
 
 
234 aa  73.6  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0587579  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1015  dienelactone hydrolase  27.07 
 
 
261 aa  73.2  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0264245  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2775  dienelactone hydrolase  28.4 
 
 
269 aa  72.8  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4659  dienelactone hydrolase  26.69 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  28.27 
 
 
254 aa  70.1  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3272  dienelactone hydrolase  32.31 
 
 
249 aa  68.6  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0949  Carboxymethylenebutenolidase  27.7 
 
 
261 aa  66.6  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00366545  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1093  dienelactone hydrolase  22.09 
 
 
237 aa  66.2  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3032  dienelactone hydrolase  27.94 
 
 
296 aa  65.5  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.345773 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4061  carboxymethylenebutenolidase  28.33 
 
 
236 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.86952  normal  0.797437 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12091  hypothetical protein  29.24 
 
 
237 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00173116  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  29.3 
 
 
227 aa  60.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  27.09 
 
 
246 aa  58.9  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0424  Carboxymethylenebutenolidase  28.16 
 
 
313 aa  58.5  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0290099 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  21.69 
 
 
247 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  22.58 
 
 
245 aa  58.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  26.32 
 
 
324 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  20.97 
 
 
247 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  23.33 
 
 
248 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4121  Carboxymethylenebutenolidase  26.75 
 
 
235 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  27.94 
 
 
296 aa  55.8  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  29.56 
 
 
291 aa  55.5  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0914  dienelactone hydrolase  26.67 
 
 
255 aa  55.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.177135  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4533  dienelactone hydrolase  29.86 
 
 
260 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.617386  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  30.05 
 
 
291 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2198  dienelactone hydrolase  27.27 
 
 
252 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0102291  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0841  dienelactone hydrolase  27.24 
 
 
228 aa  53.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.540975  normal  0.335069 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>