25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4368 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4368  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  471  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4817  hypothetical protein  81.17 
 
 		 239 aa  368  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2657  hypothetical protein  37.64 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00775221  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01020  hypothetical protein  32 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.551056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0086  hypothetical protein  30.77 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0175  hypothetical protein  29.37 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0933557  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4816  hypothetical protein  30.74 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.536398 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0142  hypothetical protein  30.88 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5663  hypothetical protein  28.46 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.570228  normal  0.031893 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4367  hypothetical protein  32.03 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5416  hypothetical protein  28.38 
 
 		 273 aa  62  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.720653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5035  hypothetical protein  30.63 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478357  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1144  hypothetical protein  30.57 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0437754  normal  0.0600359 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5123  hypothetical protein  30.63 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0174  hypothetical protein  36.02 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13873  hypothetical protein  30.26 
 
 		 258 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5476  hypothetical protein  32.02 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3405  hypothetical protein  30.28 
 
 		 247 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214353  normal  0.0597402 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4935  hypothetical protein  27.67 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5502  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  34.74 
 
 		 266 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5211  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  34.74 
 
 		 266 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.733021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5122  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  34.74 
 
 		 266 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5737  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  33.68 
 
 		 270 aa  52  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.602445 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1109  hypothetical protein  25.53 
 
 		 327 aa  51.2  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182239  normal  0.383462 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1085  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  33.33 
 
 		 276 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.429706  normal  0.50341 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>