79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4332 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4774  hypothetical protein  87.74 
 
 		 473 aa  641    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272932  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4332  hypothetical protein  100 
 
 		 477 aa  923    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252215  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  59.34 
 
 		 465 aa  430  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  59.75 
 
 		 450 aa  427  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  58.45 
 
 		 467 aa  412  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  55.62 
 
 		 479 aa  410  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  55.99 
 
 		 468 aa  409  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  58.69 
 
 		 462 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  55.65 
 
 		 465 aa  402  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  52.67 
 
 		 461 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  56.54 
 
 		 464 aa  394  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  55.83 
 
 		 457 aa  382  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  54.47 
 
 		 461 aa  384  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  51.14 
 
 		 454 aa  383  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  53.12 
 
 		 464 aa  375  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  47.63 
 
 		 505 aa  373  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  52.38 
 
 		 454 aa  372  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  50.1 
 
 		 464 aa  370  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3415  hypothetical protein  54.88 
 
 		 455 aa  371  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  55.8 
 
 		 496 aa  365  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  51.04 
 
 		 459 aa  368  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  54.96 
 
 		 464 aa  367  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  55.65 
 
 		 441 aa  359  5e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  49.42 
 
 		 493 aa  359  8e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  50.1 
 
 		 466 aa  358  9.999999999999999e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1623  hypothetical protein  52.01 
 
 		 557 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  51.44 
 
 		 459 aa  355  7.999999999999999e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  50.83 
 
 		 454 aa  355  1e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  51.84 
 
 		 462 aa  353  4e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  50.21 
 
 		 466 aa  345  1e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  51.41 
 
 		 435 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  52.38 
 
 		 457 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  49.9 
 
 		 489 aa  334  2e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  48.77 
 
 		 452 aa  330  3e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  50.73 
 
 		 432 aa  325  1e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  55.73 
 
 		 361 aa  323  3e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  49.39 
 
 		 460 aa  323  5e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3075  polymorphic outer membrane protein  51.13 
 
 		 462 aa  323  6e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1045  polymorphic outer membrane protein  47.79 
 
 		 476 aa  307  3e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4599  parallel beta-helix repeat-containing protein  50.2 
 
 		 478 aa  302  7.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.119679 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  52.08 
 
 		 435 aa  292  7e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  50 
 
 		 433 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  46.11 
 
 		 439 aa  282  8.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  52.48 
 
 		 415 aa  281  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1605  polymorphic outer membrane protein  47.73 
 
 		 448 aa  278  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7904  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  48.04 
 
 		 446 aa  267  4e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  41.35 
 
 		 476 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  36.44 
 
 		 481 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  36.78 
 
 		 509 aa  187  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  37.88 
 
 		 483 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  43.06 
 
 		 501 aa  180  4.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  38.23 
 
 		 477 aa  172  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  35.85 
 
 		 523 aa  170  6e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3285  hypothetical protein  35.33 
 
 		 532 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.37025  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  32.75 
 
 		 483 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  32.51 
 
 		 477 aa  157  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3060  hypothetical protein  39.79 
 
 		 673 aa  103  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3286  hypothetical protein  36.59 
 
 		 840 aa  97.8  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.577779  hitchhiker  0.00794489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1227  hypothetical protein  44.78 
 
 		 168 aa  87.4  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0203008  normal  0.739603 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  32.8 
 
 		 767 aa  83.2  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  32.95 
 
 		 759 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1788  polymorphic membrane protein  31.56 
 
 		 1092 aa  63.9  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  31.2 
 
 		 541 aa  57.4  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  30.24 
 
 		 1318 aa  56.6  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  34.57 
 
 		 717 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  27.4 
 
 		 863 aa  54.3  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  29.69 
 
 		 1296 aa  53.9  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  28.21 
 
 		 530 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  38.89 
 
 		 523 aa  51.6  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  35.34 
 
 		 1037 aa  50.1  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  28.48 
 
 		 852 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  28.9 
 
 		 575 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  29.47 
 
 		 575 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  31 
 
 		 2160 aa  48.5  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  35.78 
 
 		 593 aa  48.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  37.42 
 
 		 362 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1362  hypothetical protein  29.85 
 
 		 1023 aa  45.8  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  32.32 
 
 		 2192 aa  44.3  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0765  hypothetical protein  39.72 
 
 		 294 aa  43.5  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>