36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4324 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4324  wyosine base formation  100 
 
 		 269 aa  517  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0254069 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4764  wyosine base formation domain-containing protein  88.1 
 
 		 268 aa  427  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000208476 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4430  Wyosine base formation domain protein  57.74 
 
 		 264 aa  265  5.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5394  hypothetical protein  57.59 
 
 		 258 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5483  wyosine base formation  57.59 
 
 		 258 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.308542  normal  0.354276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5770  wyosine base formation  57.59 
 
 		 258 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0624769  normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6059  hypothetical protein  55.51 
 
 		 258 aa  247  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0848  wyosine base formation  55.86 
 
 		 260 aa  241  7.999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.57773  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16480  conserved hypothetical protein TIGR03084  52.04 
 
 		 271 aa  240  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1710  hypothetical protein  53.38 
 
 		 332 aa  236  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4873  Wyosine base formation domain protein  61.28 
 
 		 261 aa  236  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10035  hypothetical protein  53.99 
 
 		 257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.447139 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3207  hypothetical protein  51.7 
 
 		 270 aa  231  8.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113668  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3218  wyosine base formation  51.7 
 
 		 270 aa  231  8.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0337846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3269  wyosine base formation  51.7 
 
 		 270 aa  231  8.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0690  Wyosine base formation domain protein  56.47 
 
 		 261 aa  229  4e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3832  wyosine base formation  53.31 
 
 		 269 aa  225  5.0000000000000005e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530439  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4597  wyosine base formation  51.14 
 
 		 270 aa  221  8e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.992249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6381  wyosine base formation  46.84 
 
 		 266 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0318909  normal  0.0240218 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4556  hypothetical protein  52.14 
 
 		 266 aa  208  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.67145  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6990  wyosine base formation  45.26 
 
 		 267 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2706  wyosine base formation  45.86 
 
 		 306 aa  205  8e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.338329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3148  hypothetical protein  48.88 
 
 		 269 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0559  wyosine base formation domain-containing protein  43.77 
 
 		 264 aa  196  5.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2825  hypothetical protein  48.95 
 
 		 260 aa  195  6e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7298  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6694  wyosine base formation  50.37 
 
 		 270 aa  193  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.288227 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2835  wyosine base formation  48.46 
 
 		 284 aa  192  6e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0343  hypothetical protein  41.73 
 
 		 264 aa  167  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6364  Wyosine base formation domain protein  39.38 
 
 		 250 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.24755 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1030  hypothetical protein  38.26 
 
 		 269 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.098599  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1024  hypothetical protein  31.47 
 
 		 259 aa  118  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2414  hypothetical protein  40.72 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.096621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4594  hypothetical protein  30.5 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2877  wyosine base formation  28.41 
 
 		 265 aa  94  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6362  hypothetical protein  32.22 
 
 		 416 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13116  hypothetical protein  25.77 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>