More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4280 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4715  L-aspartate oxidase  90.91 
 
 		 572 aa  956    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.232267  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4280  L-aspartate oxidase  100 
 
 		 572 aa  1110    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0087  L-aspartate oxidase  70.67 
 
 		 549 aa  712    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0634  L-aspartate oxidase  65.54 
 
 		 558 aa  614  9.999999999999999e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0198  L-aspartate oxidase  62.31 
 
 		 598 aa  601  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  63.34 
 
 		 863 aa  590  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3424  L-aspartate oxidase  63.84 
 
 		 847 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.714369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4377  L-aspartate oxidase  62.32 
 
 		 566 aa  565  1e-160  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.342641 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8381  L-aspartate oxidase  57.84 
 
 		 557 aa  550  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.613382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  60.32 
 
 		 545 aa  550  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0462  L-aspartate oxidase  60.78 
 
 		 575 aa  551  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2883  L-aspartate oxidase  58.05 
 
 		 867 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.401949  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31990  L-aspartate oxidase  56.91 
 
 		 577 aa  536  1e-151  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0213  L-aspartate oxidase  56.79 
 
 		 548 aa  525  1e-148  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.145833 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0637  L-aspartate oxidase  58.72 
 
 		 572 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.420562  normal  0.605731 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2094  L-aspartate oxidase  56.11 
 
 		 589 aa  504  1e-141  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4982  L-aspartate oxidase  57.76 
 
 		 872 aa  492  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  44.38 
 
 		 532 aa  428  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  42.46 
 
 		 532 aa  409  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  41.32 
 
 		 534 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  39.41 
 
 		 542 aa  402  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2309  L-aspartate oxidase  47.04 
 
 		 507 aa  402  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114896  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0122  L-aspartate oxidase  48.11 
 
 		 538 aa  398  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.028832  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  45.86 
 
 		 529 aa  395  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  46.49 
 
 		 522 aa  397  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1193  L-aspartate oxidase  45.86 
 
 		 515 aa  395  1e-108  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00735813  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  43.88 
 
 		 528 aa  392  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  45.3 
 
 		 515 aa  392  1e-107  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  46.33 
 
 		 533 aa  386  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1322  L-aspartate oxidase  42.11 
 
 		 532 aa  383  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  44.46 
 
 		 541 aa  383  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5729  L-aspartate oxidase  50.09 
 
 		 538 aa  383  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1213  L-aspartate oxidase  40.49 
 
 		 538 aa  381  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0621913  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1648  L-aspartate oxidase  42.96 
 
 		 534 aa  375  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0105  L-aspartate oxidase  42.35 
 
 		 533 aa  374  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0950  L-aspartate oxidase  40.41 
 
 		 532 aa  372  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0811  L-aspartate oxidase  39.89 
 
 		 531 aa  370  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00614841  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1030  L-aspartate oxidase  43.23 
 
 		 536 aa  366  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0868483  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10840  L-aspartate oxidase  49.55 
 
 		 557 aa  367  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1159  L-aspartate oxidase  40.79 
 
 		 531 aa  364  2e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0733  L-aspartate oxidase  46.02 
 
 		 537 aa  364  2e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1827  L-aspartate oxidase  42.23 
 
 		 531 aa  363  4e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400593  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3084  L-aspartate oxidase  47.24 
 
 		 535 aa  363  4e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.169021 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1954  L-aspartate oxidase  42.29 
 
 		 531 aa  363  4e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  39.66 
 
 		 531 aa  363  6e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0525  L-aspartate oxidase  40.42 
 
 		 531 aa  362  9e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.191357  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3618  L-aspartate oxidase  48.29 
 
 		 519 aa  362  1e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.203775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1756  L-aspartate oxidase  46 
 
 		 502 aa  361  2e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.863927  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3067  L-aspartate oxidase  47.73 
 
 		 548 aa  361  2e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117293  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3127  L-aspartate oxidase  47.73 
 
 		 548 aa  361  2e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.513503 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1270  L-aspartate oxidase  42.86 
 
 		 545 aa  360  4e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0565  L-aspartate oxidase  39.66 
 
 		 537 aa  360  5e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.222565 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3566  L-aspartate oxidase  45.49 
 
 		 535 aa  360  5e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  42.72 
 
 		 538 aa  359  7e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  42.72 
 
 		 538 aa  359  7e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4092  L-aspartate oxidase  45.87 
 
 		 523 aa  359  7e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.757551  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0858  L-aspartate oxidase  39.58 
 
 		 531 aa  359  7e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1812  L-aspartate oxidase  40.23 
 
 		 531 aa  359  8e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0905  L-aspartate oxidase  45.39 
 
 		 541 aa  358  9.999999999999999e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2322  L-aspartate oxidase  43.73 
 
 		 532 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3632  L-aspartate oxidase  44.47 
 
 		 535 aa  358  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3706  L-aspartate oxidase  44.65 
 
 		 535 aa  358  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166219  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0012  L-aspartate oxidase  37.67 
 
 		 528 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1141  L-aspartate oxidase  42.43 
 
 		 536 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0257897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2251  L-aspartate oxidase  40.75 
 
 		 535 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00695711 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1341  L-aspartate oxidase  42.62 
 
 		 537 aa  356  6.999999999999999e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0349  L-aspartate oxidase  46.41 
 
 		 576 aa  356  6.999999999999999e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2773  L-aspartate oxidase  41.46 
 
 		 537 aa  355  1e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1152  L-aspartate oxidase  41.56 
 
 		 537 aa  355  1e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.172404  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0242  aspartate oxidase  43.37 
 
 		 543 aa  354  2e-96  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.032501  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1047  L-aspartate oxidase  41.93 
 
 		 537 aa  355  2e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2855  L-aspartate oxidase  41.87 
 
 		 537 aa  355  2e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3033  L-aspartate oxidase  41.87 
 
 		 537 aa  355  2e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.625398  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3840  L-aspartate oxidase  45.79 
 
 		 529 aa  354  2e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1194  L-aspartate oxidase  41.37 
 
 		 537 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1238  L-aspartate oxidase  41.37 
 
 		 537 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2937  L-aspartate oxidase  41.87 
 
 		 537 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.320984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3119  L-aspartate oxidase  41.37 
 
 		 537 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3493  L-aspartate oxidase  44.85 
 
 		 529 aa  353  4e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1271  L-aspartate oxidase  41.19 
 
 		 537 aa  353  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1236  L-aspartate oxidase  42.03 
 
 		 536 aa  353  5.9999999999999994e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.305386  hitchhiker  0.0000186096 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2715  L-aspartate oxidase  42.75 
 
 		 533 aa  352  1e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2325  L-aspartate oxidase  42.94 
 
 		 533 aa  352  1e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0392  L-aspartate oxidase  41.86 
 
 		 565 aa  351  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2447  L-aspartate oxidase  44.08 
 
 		 533 aa  351  2e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2735  L-aspartate oxidase  43.1 
 
 		 528 aa  352  2e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0449  L-aspartate oxidase  42.04 
 
 		 556 aa  350  3e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4339  L-aspartate oxidase  44.44 
 
 		 534 aa  350  4e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0729  L-aspartate oxidase  39.14 
 
 		 533 aa  348  2e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000384944  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24902  predicted protein  42.41 
 
 		 541 aa  348  2e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00163177  normal  0.0185281 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4514  L-aspartate oxidase  44.89 
 
 		 527 aa  348  2e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.712637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1736  L-aspartate oxidase  41.17 
 
 		 531 aa  348  2e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2816  L-aspartate oxidase  44.66 
 
 		 529 aa  347  3e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0796143  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1881  L-aspartate oxidase  41.79 
 
 		 550 aa  347  3e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.756332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2936  L-aspartate oxidase  40.37 
 
 		 538 aa  347  3e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1874  L-aspartate oxidase  41.12 
 
 		 533 aa  347  4e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2487  L-aspartate oxidase  40.98 
 
 		 531 aa  347  5e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000814089  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3165  L-aspartate oxidase  48.46 
 
 		 538 aa  346  6e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000274372  hitchhiker  0.0000603804 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2296  L-aspartate oxidase  45.04 
 
 		 550 aa  346  7e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000882824 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3159  L-aspartate oxidase  45.62 
 
 		 534 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>