86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4219 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  100 
 
 
466 aa  909  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  63.5 
 
 
461 aa  521  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  53.62 
 
 
468 aa  414  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  53.63 
 
 
464 aa  373  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  49.89 
 
 
454 aa  361  2e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  50.11 
 
 
454 aa  350  3e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  50 
 
 
479 aa  346  6e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  48.41 
 
 
464 aa  339  5e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  50.32 
 
 
461 aa  339  5e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  49.25 
 
 
459 aa  338  1e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  49.58 
 
 
467 aa  336  5e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  48.54 
 
 
464 aa  330  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  5.19323e-05 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  47.74 
 
 
454 aa  329  6e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  50.23 
 
 
435 aa  328  1e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  45.8 
 
 
464 aa  328  2e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  48.82 
 
 
459 aa  328  2e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  5.85185e-05 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3415  hypothetical protein  47.77 
 
 
455 aa  326  5e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253351  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  47.9 
 
 
465 aa  325  9e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  47.89 
 
 
465 aa  325  1e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  6.65337e-05 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  48.6 
 
 
450 aa  319  6e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  47.22 
 
 
460 aa  319  6e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  46.5 
 
 
462 aa  318  1e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  49.47 
 
 
457 aa  318  2e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  49.89 
 
 
432 aa  316  5e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1623  hypothetical protein  48.16 
 
 
557 aa  311  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  46.84 
 
 
462 aa  311  2e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  48.29 
 
 
496 aa  309  7e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4599  parallel beta-helix repeat-containing protein  48.13 
 
 
478 aa  303  4e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.119679 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  48.62 
 
 
457 aa  302  7e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  45.28 
 
 
466 aa  299  8e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4332  hypothetical protein  49.59 
 
 
477 aa  298  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252215  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  51.08 
 
 
361 aa  296  6e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  51.28 
 
 
415 aa  290  5e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  51.59 
 
 
435 aa  288  1e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  40.81 
 
 
505 aa  287  3e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  44.03 
 
 
452 aa  284  2e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3075  polymorphic outer membrane protein  45.45 
 
 
462 aa  282  9e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  3.56618e-05 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  44.99 
 
 
489 aa  277  2e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1045  polymorphic outer membrane protein  44.81 
 
 
476 aa  275  1e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  46.1 
 
 
441 aa  273  3e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  46.73 
 
 
439 aa  273  4e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4774  hypothetical protein  46.54 
 
 
473 aa  268  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272932  decreased coverage  3.56618e-05 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  42.71 
 
 
493 aa  265  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  46.47 
 
 
446 aa  251  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  46.3 
 
 
433 aa  250  4e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1605  polymorphic outer membrane protein  42.15 
 
 
448 aa  229  6e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7904  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  38.13 
 
 
509 aa  199  1e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  40.55 
 
 
476 aa  189  7e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  37.72 
 
 
483 aa  187  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  35.07 
 
 
523 aa  170  5e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  40 
 
 
481 aa  167  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  38.76 
 
 
501 aa  161  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  37.14 
 
 
477 aa  160  6e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3285  hypothetical protein  33.48 
 
 
532 aa  150  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.37025  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  32.56 
 
 
477 aa  144  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  32.65 
 
 
483 aa  137  3e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3286  hypothetical protein  37.99 
 
 
840 aa  107  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.577779  hitchhiker  0.00794489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3060  hypothetical protein  36.43 
 
 
673 aa  107  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  27.3 
 
 
541 aa  71.2  4e-11  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  26.64 
 
 
527 aa  69.7  1e-10  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  44.44 
 
 
362 aa  67  6e-10  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  31.53 
 
 
852 aa  66.6  1e-09  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1227  hypothetical protein  41.03 
 
 
168 aa  64.3  5e-09  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0203008  normal  0.739603 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  31.08 
 
 
759 aa  63.2  9e-09  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  38.85 
 
 
717 aa  61.2  4e-08  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  30 
 
 
575 aa  60.8  5e-08  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  28.87 
 
 
593 aa  58.9  2e-07  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  25.48 
 
 
863 aa  56.2  1e-06  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2874  polymorphic outer membrane protein  39.18 
 
 
412 aa  53.5  7e-06  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234984  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  30.8 
 
 
2160 aa  51.6  3e-05  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  29.81 
 
 
523 aa  51.6  3e-05  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  32.68 
 
 
1296 aa  50.8  5e-05  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2246  hypothetical protein  28.42 
 
 
591 aa  50.8  5e-05  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.105015  normal  0.0180285 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1788  polymorphic membrane protein  27.65 
 
 
1092 aa  50.8  6e-05  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  30.58 
 
 
558 aa  50.1  8e-05  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  3.00518e-08 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2253  polymorphic outer membrane protein  27.49 
 
 
572 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0033  hypothetical protein  29.16 
 
 
591 aa  50.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3707  polymorphic outer membrane protein  30.04 
 
 
518 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  8.78669e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  27.07 
 
 
575 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  26.98 
 
 
2192 aa  47.8  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  31.43 
 
 
530 aa  47.8  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1035  hypothetical protein  27.94 
 
 
1010 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3191  hypothetical protein  28.65 
 
 
593 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  1.24226e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  26.88 
 
 
1318 aa  44.3  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  30.41 
 
 
1755 aa  44.3  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  26.34 
 
 
884 aa  43.1  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>